Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CFI4

Protein Details
Accession A0A1C1CFI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35HLQPAKKVRRDGPCSRKHHNILBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-194PKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00517  RNASE_3_1  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MAESDNKRKYGGGHLQPAKKVRRDGPCSRKHHNILPEPARNGPPHLPQISDEYRNVVFTHPSQAPQDPQASYDRLEFLGDAYLELYATQLIFNRFPDLEVGKMSQLRETLVRNETIGQYASLYSLDRQLKNYKQFQNSPPHVWLKIKGDVFEAYVAAVVLSSPDGAVTAKSWLHQLWEPKVQAVAASTPPKPKKTKEELAKKILMKGTKINYVDEKAPVVHYGQGREEYFVGVYFTGFDWENQYLGSGRGPSRVEAGMFAAADALNNPLVDHIAGEKAKALAQREKDAEAIKDNGVQKEQELGRGNAEAVKPESLTESRDSQASAETPPDEQFRGPHRVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.68
4 0.74
5 0.72
6 0.68
7 0.67
8 0.64
9 0.67
10 0.7
11 0.75
12 0.77
13 0.79
14 0.8
15 0.8
16 0.82
17 0.77
18 0.76
19 0.75
20 0.73
21 0.73
22 0.75
23 0.74
24 0.67
25 0.66
26 0.63
27 0.54
28 0.5
29 0.45
30 0.42
31 0.43
32 0.41
33 0.38
34 0.35
35 0.42
36 0.42
37 0.41
38 0.35
39 0.32
40 0.31
41 0.3
42 0.3
43 0.23
44 0.2
45 0.18
46 0.24
47 0.21
48 0.23
49 0.25
50 0.28
51 0.29
52 0.3
53 0.33
54 0.26
55 0.27
56 0.29
57 0.27
58 0.25
59 0.24
60 0.22
61 0.18
62 0.18
63 0.16
64 0.12
65 0.13
66 0.11
67 0.1
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.07
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.18
103 0.16
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.14
112 0.18
113 0.19
114 0.22
115 0.28
116 0.34
117 0.41
118 0.49
119 0.5
120 0.51
121 0.56
122 0.59
123 0.63
124 0.61
125 0.58
126 0.53
127 0.49
128 0.45
129 0.4
130 0.37
131 0.31
132 0.33
133 0.3
134 0.26
135 0.24
136 0.23
137 0.22
138 0.19
139 0.14
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.02
147 0.03
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.07
160 0.09
161 0.12
162 0.15
163 0.17
164 0.23
165 0.22
166 0.22
167 0.22
168 0.2
169 0.17
170 0.14
171 0.12
172 0.11
173 0.13
174 0.15
175 0.22
176 0.26
177 0.31
178 0.35
179 0.37
180 0.43
181 0.49
182 0.57
183 0.59
184 0.67
185 0.69
186 0.71
187 0.73
188 0.64
189 0.59
190 0.53
191 0.45
192 0.36
193 0.34
194 0.31
195 0.31
196 0.31
197 0.29
198 0.28
199 0.29
200 0.29
201 0.24
202 0.22
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.15
216 0.14
217 0.12
218 0.11
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.16
237 0.17
238 0.17
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.15
243 0.16
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.13
265 0.15
266 0.18
267 0.21
268 0.24
269 0.28
270 0.34
271 0.35
272 0.36
273 0.37
274 0.37
275 0.34
276 0.32
277 0.3
278 0.24
279 0.28
280 0.3
281 0.3
282 0.29
283 0.27
284 0.23
285 0.29
286 0.29
287 0.3
288 0.31
289 0.29
290 0.29
291 0.3
292 0.3
293 0.26
294 0.26
295 0.22
296 0.2
297 0.21
298 0.19
299 0.18
300 0.22
301 0.19
302 0.22
303 0.22
304 0.24
305 0.23
306 0.24
307 0.24
308 0.2
309 0.23
310 0.21
311 0.19
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.22
316 0.25
317 0.23
318 0.23
319 0.27
320 0.3