Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GI34

Protein Details
Accession C1GI34    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-52ERRRVLNVLAQRRYRKRRREHLASLEAQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-41RKRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046347  bZIP_sf  
IPR021833  DUF3425  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG pbn:PADG_06920  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11905  DUF3425  
Amino Acid Sequences MPSKRQRRMVHDPTIPDISDDAAERRRVLNVLAQRRYRKRRREHLASLEAQIQMSHRKTRESGVVVVDPSPTDSAAEKQSGLDILLPLGAPECETGNISPASSGTVPRIQEALLEKSNDGSPSALTDVFTQSDILDVILESMMQNSPSSSSPSSITPLSPLSSFDSLFSSELALPELSALSYQLLQNPINEQDFTPNDLSATLQSYQATTFTFPDDHIIEIPPLSLLRAVLTIADRLQLKELIWTMNSISPFYTGPAGFECTNSDPPQSSSTASSLSSSRLPICIESLPAHLQPTPTQRLIPHHPILDLFPWPTTRDKLIQVFSMPEYLRPASASHPMALMNLVYDIEDLTEGMRVSGTDPFQIDMWEIGQIVFERWWWAFETKVIDISNSLRQNRGQQGLAISLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.56
3 0.46
4 0.37
5 0.28
6 0.23
7 0.21
8 0.2
9 0.21
10 0.23
11 0.24
12 0.24
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.28
17 0.32
18 0.41
19 0.47
20 0.53
21 0.61
22 0.71
23 0.8
24 0.82
25 0.84
26 0.84
27 0.87
28 0.9
29 0.9
30 0.9
31 0.89
32 0.88
33 0.8
34 0.72
35 0.65
36 0.55
37 0.45
38 0.35
39 0.27
40 0.26
41 0.27
42 0.31
43 0.28
44 0.32
45 0.34
46 0.38
47 0.44
48 0.4
49 0.39
50 0.37
51 0.38
52 0.35
53 0.33
54 0.29
55 0.22
56 0.19
57 0.16
58 0.12
59 0.1
60 0.11
61 0.13
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.15
97 0.18
98 0.21
99 0.23
100 0.21
101 0.22
102 0.21
103 0.22
104 0.23
105 0.21
106 0.17
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.07
134 0.08
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.13
177 0.14
178 0.12
179 0.14
180 0.14
181 0.17
182 0.16
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.09
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.15
248 0.16
249 0.19
250 0.19
251 0.19
252 0.18
253 0.19
254 0.21
255 0.2
256 0.18
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.18
280 0.2
281 0.25
282 0.28
283 0.26
284 0.28
285 0.29
286 0.35
287 0.41
288 0.45
289 0.42
290 0.37
291 0.37
292 0.36
293 0.35
294 0.31
295 0.25
296 0.18
297 0.15
298 0.16
299 0.17
300 0.2
301 0.2
302 0.22
303 0.24
304 0.28
305 0.32
306 0.33
307 0.33
308 0.31
309 0.31
310 0.28
311 0.3
312 0.25
313 0.21
314 0.23
315 0.21
316 0.2
317 0.19
318 0.19
319 0.17
320 0.24
321 0.24
322 0.2
323 0.21
324 0.2
325 0.2
326 0.19
327 0.16
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.16
352 0.12
353 0.12
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.16
366 0.17
367 0.17
368 0.2
369 0.25
370 0.23
371 0.28
372 0.27
373 0.24
374 0.25
375 0.27
376 0.32
377 0.34
378 0.34
379 0.33
380 0.36
381 0.44
382 0.5
383 0.51
384 0.44
385 0.4
386 0.41