Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CIA4

Protein Details
Accession A0A1C1CIA4    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-35IPTSADPRSRRPIKRARVPGSNNPNAKHydrophilic
124-158ERERKEKDEEKTRKNRERRNKRKGKDKSKSPAATEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-23RRPIKR
122-157EKERERKEKDEEKTRKNRERRNKRKGKDKSKSPAAT
169-173PKDKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPEAIPTSADPRSRRPIKRARVPGSNNPNAKAASAQANEIENLFLDPAREIKLPAPASEVKRSVPAPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRVMDEEAKKEEEDREWAEKERERKEKDEEKTRKNRERRNKRKGKDKSKSPAATENGHGHEPSEGPKDKKPRVNLAVPARAEDPASAQGTTDFGVAAVVQESGITIHDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.44
4 0.52
5 0.57
6 0.63
7 0.69
8 0.74
9 0.81
10 0.85
11 0.81
12 0.82
13 0.82
14 0.83
15 0.83
16 0.81
17 0.73
18 0.64
19 0.6
20 0.5
21 0.43
22 0.34
23 0.26
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.17
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.2
44 0.2
45 0.2
46 0.24
47 0.26
48 0.3
49 0.34
50 0.34
51 0.27
52 0.3
53 0.3
54 0.29
55 0.28
56 0.26
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.19
61 0.19
62 0.17
63 0.14
64 0.12
65 0.09
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.04
71 0.03
72 0.03
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.07
79 0.07
80 0.12
81 0.19
82 0.26
83 0.31
84 0.35
85 0.41
86 0.49
87 0.56
88 0.61
89 0.61
90 0.56
91 0.53
92 0.5
93 0.45
94 0.41
95 0.36
96 0.29
97 0.23
98 0.21
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.18
106 0.19
107 0.21
108 0.24
109 0.26
110 0.32
111 0.36
112 0.42
113 0.42
114 0.44
115 0.51
116 0.56
117 0.6
118 0.64
119 0.64
120 0.66
121 0.73
122 0.79
123 0.8
124 0.8
125 0.83
126 0.84
127 0.87
128 0.88
129 0.89
130 0.9
131 0.88
132 0.9
133 0.91
134 0.91
135 0.89
136 0.88
137 0.87
138 0.87
139 0.83
140 0.76
141 0.74
142 0.66
143 0.59
144 0.52
145 0.48
146 0.4
147 0.37
148 0.33
149 0.25
150 0.22
151 0.2
152 0.19
153 0.21
154 0.24
155 0.26
156 0.33
157 0.42
158 0.48
159 0.55
160 0.58
161 0.61
162 0.63
163 0.66
164 0.68
165 0.68
166 0.68
167 0.61
168 0.57
169 0.48
170 0.41
171 0.35
172 0.26
173 0.21
174 0.18
175 0.19
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.13
182 0.08
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06