FuNGI

A0A1C1CKR4

Protein Details

Accession

A0A1C1CKR4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MPPVPKAPPPKPRPGQARRSIYRGR	Hydrophilic
197-216	LYIACRRKKEQVQGVQRPVY	Hydrophilic
387-417	QPPIVKEQMKPKQKKKRGRPRKRPLPETAAE	Basic
703-728	EEERKKKAAKGKRKDGTRRPGRRGDV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-19	PPPKPRPGQARR
396-410	KPKQKKKRGRPRKRP
679-726	KDHAKRIRKELKDAEMRAKGLDPAEEERKKKAAKGKRKDGTRRPGRRG
867-899	RGNKPRGKRRGPVAAGQKEKERQARNAQKKAKT

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF00382 TFIIB
CDD	cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MPPVPKAPPPKPRPGQARRSIYRGRIEGLGSPVPTSLRASTPTLVRATTPAAQPQTRPKLLCPNPDCPDRSKVNRTDQGLICETCGALVQEDSGLVSEQGFGETDSGRIVATGVQVGQDQTHQRTFTSGGAFGNAGREATSSSDRTRMQARSIMTSYCPIFNIQSSEVERGMLCFGLAVTNGFLAGRTIESVAVASLYIACRRKKEQVQGVQRPVYSLMLIDFAEKLNMDVFALGKIYRDLYEKLWYDKKTGSWKDETASLDFQGMDPAVLVPKFIKELEFDRRDELKIQYDAIQIIKRMKRDWIHDGRRPSGVCGAAVLLAARMNNYRRTTREIVLTAKVTEITLNKRLQEFHDTKVSNLSVTSFMQEAKSWEDVPLGQHYLDEQQPPIVKEQMKPKQKKKRGRPRKRPLPETAAEIEGDTATTEPPTSNTERSHPAKRVRIDAQGYKIPEIPIRRLDAESLQIIDKPPPNPQPEHIASESLRGEAGSASEVIDDNADASPSHSPSPQADGEEANVDFGLPRRKPRGPNWQPPPPSTAEIAMEAGIENAMDETFVDNAELSDRLGVRPSSVPHTGASQPGASDVDAQSPSRGQHDLRHEQIEFDADPTQTVPPHQKDKILGPPVNTIIGNFGHISLSPTLKPDEFDSDEDVATCTLTEEESRIKERVWVSMNADWLRKDHAKRIRKELKDAEMRAKGLDPAEEERKKKAAKGKRKDGTRRPGRRGDVSYLAEQGRKRKAPADEGEGGGEGQEQEDGGTDEADGGARPEEPRTAARAMRLMLENRRTWSHRINYDAVDHIFAATSTSEESAESRSATGDGQSRSGSVAASEGTQQTSREGSATGSPSASTPAAAKDSIPLRHTTLFRGNKPRGKRRGPVAAGQKEKERQARNAQKKAKTSEGPSGDRSASRSRSTSTPASAESRPSPEPQSLNPGQAEAPQQAPMANRPLPTPPSKDTQLGPQIPGIITTAAVSPTLANHPGPQIPSLRSTAPMPTPPATQLEPTIPSIKSTGPQQDRSPSAGGPGKGNSNPVGRQGPQSSPPGEAKGKGDEQGEAGPEEDELEAALEGRYRAGSAEGEDEDEDDDEEDEDEDDEYEDEEDNDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.84
3	0.84
4	0.87
5	0.81
6	0.81
7	0.8
8	0.76
9	0.75
10	0.67
11	0.59
12	0.52
13	0.48
14	0.44
15	0.42
16	0.38
17	0.3
18	0.28
19	0.26
20	0.23
21	0.23
22	0.22
23	0.19
24	0.18
25	0.21
26	0.24
27	0.27
28	0.3
29	0.33
30	0.32
31	0.3
32	0.28
33	0.27
34	0.27
35	0.29
36	0.28
37	0.31
38	0.35
39	0.37
40	0.4
41	0.48
42	0.54
43	0.55
44	0.54
45	0.51
46	0.56
47	0.61
48	0.68
49	0.63
50	0.63
51	0.63
52	0.68
53	0.67
54	0.6
55	0.61
56	0.59
57	0.62
58	0.62
59	0.64
60	0.67
61	0.71
62	0.71
63	0.72
64	0.67
65	0.64
66	0.6
67	0.52
68	0.42
69	0.35
70	0.3
71	0.21
72	0.2
73	0.14
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.07
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.1
103	0.11
104	0.11
105	0.14
106	0.18
107	0.21
108	0.26
109	0.25
110	0.25
111	0.27
112	0.29
113	0.28
114	0.27
115	0.24
116	0.2
117	0.21
118	0.21
119	0.19
120	0.19
121	0.15
122	0.12
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.14
127	0.18
128	0.18
129	0.2
130	0.27
131	0.27
132	0.3
133	0.36
134	0.35
135	0.34
136	0.36
137	0.36
138	0.37
139	0.38
140	0.36
141	0.31
142	0.32
143	0.3
144	0.26
145	0.25
146	0.2
147	0.19
148	0.2
149	0.23
150	0.2
151	0.24
152	0.25
153	0.27
154	0.26
155	0.25
156	0.23
157	0.19
158	0.19
159	0.13
160	0.1
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.06
184	0.07
185	0.13
186	0.18
187	0.21
188	0.26
189	0.31
190	0.4
191	0.46
192	0.55
193	0.6
194	0.64
195	0.73
196	0.78
197	0.81
198	0.76
199	0.68
200	0.59
201	0.5
202	0.41
203	0.3
204	0.2
205	0.13
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.07
215	0.08
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.1
226	0.13
227	0.14
228	0.16
229	0.23
230	0.25
231	0.3
232	0.36
233	0.36
234	0.36
235	0.37
236	0.4
237	0.43
238	0.47
239	0.47
240	0.45
241	0.46
242	0.44
243	0.46
244	0.43
245	0.36
246	0.32
247	0.26
248	0.22
249	0.2
250	0.19
251	0.15
252	0.13
253	0.09
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.08
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.11
265	0.16
266	0.26
267	0.29
268	0.3
269	0.33
270	0.35
271	0.36
272	0.37
273	0.35
274	0.3
275	0.28
276	0.28
277	0.25
278	0.25
279	0.25
280	0.24
281	0.23
282	0.19
283	0.26
284	0.28
285	0.27
286	0.27
287	0.33
288	0.35
289	0.39
290	0.47
291	0.5
292	0.56
293	0.59
294	0.64
295	0.6
296	0.6
297	0.54
298	0.46
299	0.4
300	0.32
301	0.26
302	0.21
303	0.18
304	0.13
305	0.13
306	0.11
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.09
312	0.12
313	0.18
314	0.22
315	0.25
316	0.28
317	0.35
318	0.39
319	0.39
320	0.42
321	0.38
322	0.38
323	0.37
324	0.36
325	0.28
326	0.24
327	0.22
328	0.16
329	0.15
330	0.15
331	0.16
332	0.22
333	0.23
334	0.25
335	0.26
336	0.27
337	0.28
338	0.35
339	0.33
340	0.29
341	0.36
342	0.35
343	0.33
344	0.37
345	0.34
346	0.25
347	0.22
348	0.2
349	0.14
350	0.14
351	0.15
352	0.1
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.13
358	0.14
359	0.13
360	0.13
361	0.14
362	0.14
363	0.15
364	0.16
365	0.14
366	0.12
367	0.12
368	0.12
369	0.14
370	0.15
371	0.15
372	0.12
373	0.14
374	0.16
375	0.17
376	0.18
377	0.21
378	0.21
379	0.24
380	0.34
381	0.4
382	0.48
383	0.56
384	0.64
385	0.7
386	0.78
387	0.85
388	0.86
389	0.88
390	0.9
391	0.92
392	0.94
393	0.94
394	0.96
395	0.95
396	0.91
397	0.86
398	0.83
399	0.73
400	0.67
401	0.57
402	0.47
403	0.37
404	0.29
405	0.22
406	0.14
407	0.12
408	0.07
409	0.05
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.04
414	0.06
415	0.1
416	0.13
417	0.16
418	0.18
419	0.21
420	0.28
421	0.33
422	0.37
423	0.4
424	0.45
425	0.49
426	0.5
427	0.53
428	0.49
429	0.51
430	0.49
431	0.46
432	0.43
433	0.4
434	0.38
435	0.33
436	0.31
437	0.25
438	0.24
439	0.22
440	0.21
441	0.21
442	0.22
443	0.23
444	0.21
445	0.21
446	0.2
447	0.19
448	0.16
449	0.14
450	0.12
451	0.11
452	0.12
453	0.14
454	0.16
455	0.15
456	0.2
457	0.25
458	0.28
459	0.29
460	0.3
461	0.34
462	0.34
463	0.37
464	0.32
465	0.29
466	0.25
467	0.28
468	0.26
469	0.18
470	0.16
471	0.11
472	0.1
473	0.08
474	0.08
475	0.05
476	0.05
477	0.04
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.06
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.15
495	0.15
496	0.14
497	0.14
498	0.13
499	0.13
500	0.14
501	0.13
502	0.09
503	0.08
504	0.06
505	0.06
506	0.08
507	0.14
508	0.13
509	0.17
510	0.23
511	0.28
512	0.34
513	0.42
514	0.51
515	0.54
516	0.63
517	0.67
518	0.7
519	0.68
520	0.63
521	0.59
522	0.5
523	0.42
524	0.33
525	0.27
526	0.18
527	0.16
528	0.15
529	0.11
530	0.09
531	0.07
532	0.06
533	0.04
534	0.03
535	0.03
536	0.02
537	0.02
538	0.02
539	0.02
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.08
555	0.1
556	0.11
557	0.14
558	0.15
559	0.16
560	0.15
561	0.18
562	0.17
563	0.17
564	0.16
565	0.12
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.1
577	0.11
578	0.11
579	0.12
580	0.11
581	0.16
582	0.24
583	0.29
584	0.3
585	0.33
586	0.31
587	0.3
588	0.29
589	0.25
590	0.17
591	0.13
592	0.13
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.11
597	0.09
598	0.1
599	0.15
600	0.17
601	0.24
602	0.24
603	0.26
604	0.27
605	0.31
606	0.38
607	0.39
608	0.37
609	0.32
610	0.34
611	0.32
612	0.32
613	0.27
614	0.19
615	0.14
616	0.12
617	0.11
618	0.09
619	0.08
620	0.07
621	0.07
622	0.09
623	0.09
624	0.1
625	0.09
626	0.1
627	0.12
628	0.12
629	0.13
630	0.12
631	0.16
632	0.17
633	0.18
634	0.2
635	0.2
636	0.19
637	0.19
638	0.17
639	0.12
640	0.1
641	0.08
642	0.05
643	0.04
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.08
648	0.11
649	0.14
650	0.14
651	0.14
652	0.19
653	0.19
654	0.23
655	0.24
656	0.24
657	0.25
658	0.27
659	0.31
660	0.28
661	0.28
662	0.24
663	0.21
664	0.24
665	0.26
666	0.25
667	0.29
668	0.37
669	0.45
670	0.49
671	0.59
672	0.64
673	0.61
674	0.67
675	0.65
676	0.64
677	0.63
678	0.61
679	0.58
680	0.51
681	0.49
682	0.41
683	0.36
684	0.28
685	0.21
686	0.19
687	0.14
688	0.15
689	0.24
690	0.28
691	0.29
692	0.31
693	0.36
694	0.36
695	0.38
696	0.43
697	0.44
698	0.51
699	0.6
700	0.67
701	0.69
702	0.78
703	0.84
704	0.84
705	0.85
706	0.85
707	0.84
708	0.81
709	0.82
710	0.77
711	0.73
712	0.68
713	0.62
714	0.57
715	0.51
716	0.44
717	0.39
718	0.36
719	0.33
720	0.3
721	0.32
722	0.32
723	0.32
724	0.32
725	0.34
726	0.37
727	0.42
728	0.44
729	0.44
730	0.39
731	0.38
732	0.37
733	0.31
734	0.27
735	0.19
736	0.15
737	0.08
738	0.05
739	0.04
740	0.04
741	0.03
742	0.04
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.04
751	0.04
752	0.05
753	0.06
754	0.06
755	0.07
756	0.09
757	0.11
758	0.12
759	0.16
760	0.19
761	0.19
762	0.21
763	0.23
764	0.22
765	0.23
766	0.25
767	0.25
768	0.28
769	0.32
770	0.32
771	0.32
772	0.36
773	0.36
774	0.37
775	0.42
776	0.43
777	0.42
778	0.45
779	0.46
780	0.43
781	0.42
782	0.41
783	0.33
784	0.26
785	0.22
786	0.16
787	0.13
788	0.11
789	0.1
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.07
795	0.07
796	0.08
797	0.09
798	0.1
799	0.1
800	0.1
801	0.1
802	0.1
803	0.1
804	0.12
805	0.15
806	0.15
807	0.17
808	0.17
809	0.16
810	0.17
811	0.17
812	0.14
813	0.08
814	0.08
815	0.07
816	0.07
817	0.09
818	0.09
819	0.1
820	0.11
821	0.11
822	0.12
823	0.13
824	0.13
825	0.12
826	0.11
827	0.11
828	0.14
829	0.16
830	0.16
831	0.15
832	0.15
833	0.14
834	0.17
835	0.15
836	0.11
837	0.1
838	0.11
839	0.13
840	0.13
841	0.13
842	0.15
843	0.2
844	0.24
845	0.24
846	0.24
847	0.26
848	0.31
849	0.32
850	0.32
851	0.37
852	0.41
853	0.47
854	0.55
855	0.59
856	0.61
857	0.7
858	0.75
859	0.75
860	0.76
861	0.76
862	0.74
863	0.77
864	0.73
865	0.71
866	0.71
867	0.7
868	0.68
869	0.63
870	0.62
871	0.55
872	0.58
873	0.59
874	0.53
875	0.51
876	0.57
877	0.66
878	0.69
879	0.75
880	0.77
881	0.76
882	0.79
883	0.77
884	0.75
885	0.69
886	0.63
887	0.62
888	0.6
889	0.57
890	0.52
891	0.5
892	0.44
893	0.39
894	0.39
895	0.37
896	0.35
897	0.34
898	0.34
899	0.33
900	0.35
901	0.4
902	0.4
903	0.36
904	0.34
905	0.33
906	0.36
907	0.34
908	0.35
909	0.33
910	0.33
911	0.32
912	0.33
913	0.33
914	0.34
915	0.35
916	0.33
917	0.38
918	0.36
919	0.37
920	0.34
921	0.32
922	0.27
923	0.28
924	0.28
925	0.21
926	0.2
927	0.18
928	0.18
929	0.19
930	0.2
931	0.2
932	0.24
933	0.25
934	0.24
935	0.24
936	0.29
937	0.33
938	0.37
939	0.39
940	0.36
941	0.4
942	0.43
943	0.44
944	0.4
945	0.44
946	0.48
947	0.45
948	0.43
949	0.38
950	0.37
951	0.33
952	0.32
953	0.24
954	0.15
955	0.12
956	0.11
957	0.11
958	0.09
959	0.09
960	0.08
961	0.07
962	0.09
963	0.13
964	0.14
965	0.14
966	0.15
967	0.19
968	0.21
969	0.23
970	0.24
971	0.25
972	0.25
973	0.27
974	0.29
975	0.27
976	0.26
977	0.26
978	0.28
979	0.29
980	0.31
981	0.32
982	0.31
983	0.32
984	0.32
985	0.35
986	0.31
987	0.28
988	0.27
989	0.26
990	0.26
991	0.28
992	0.3
993	0.26
994	0.25
995	0.26
996	0.25
997	0.23
998	0.27
999	0.34
1000	0.37
1001	0.42
1002	0.46
1003	0.51
1004	0.53
1005	0.54
1006	0.5
1007	0.4
1008	0.4
1009	0.4
1010	0.37
1011	0.33
1012	0.32
1013	0.34
1014	0.33
1015	0.36
1016	0.33
1017	0.32
1018	0.33
1019	0.35
1020	0.39
1021	0.35
1022	0.4
1023	0.41
1024	0.42
1025	0.42
1026	0.46
1027	0.41
1028	0.4
1029	0.41
1030	0.41
1031	0.39
1032	0.37
1033	0.35
1034	0.37
1035	0.38
1036	0.37
1037	0.35
1038	0.3
1039	0.29
1040	0.29
1041	0.27
1042	0.21
1043	0.19
1044	0.15
1045	0.14
1046	0.14
1047	0.11
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.07
1051	0.06
1052	0.07
1053	0.07
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.09
1058	0.08
1059	0.09
1060	0.11
1061	0.12
1062	0.12
1063	0.16
1064	0.16
1065	0.18
1066	0.18
1067	0.18
1068	0.17
1069	0.16
1070	0.14
1071	0.11
1072	0.1
1073	0.09
1074	0.09
1075	0.09
1076	0.09
1077	0.09
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.09
1084	0.09

A0A1C1CKR4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer