FuNGI

C1G2B3

Protein Details

Accession

C1G2B3

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-30	GGGDHSPEKKTKRKRASEKTDRPNKKAAL	Basic
64-89	VPLTAYTKPRQKRLPKHNATRSVEIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-27	EKKTKRKRASEKTDRPNKK
464-497	VKSKAEAGARRIAKLRVPVEFPKVSRGPGVRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	pbn:PADG_02279 -
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MGGGDHSPEKKTKRKRASEKTDRPNKKAALAPVAATVKVQFVENTNGLLPVIASTPGINVPSSVPLTAYTKPRQKRLPKHNATRSVEILNSELLLQSSAHPKLDFVGKEGENELDTLWNHYVAIYDPDAGTLQLAEARKMTVRGCVRRVPRKDINGEEEDGEGVAISNWAQRTALTEAFGTKQSRKAIQSLAANALLSSAPAGSGPSAVESALLSSIPKEAVTSPQKTAQAEIQAVKPLPQPNLSATHPSDVYAIETLVPNGLATLRTMHVKDWQDAIAAGEPVLSSSRFVAHRVEHVVRSRNKTMLQLLRFIMILIELSRSLKPSRGAGPATPGAAGTKKLPPREDLRRILSGIPLSKGAAAAPTDPKTPLLPDSFLDALRRKFVPQGSFLSKSDITLLHTTICALSLHIPPETGFAANELATDPADLRDDLRLEHQTIQQYFRELGCKVDKPRESEFAKWGVKSKAEAGARRIAKLRVPVEFPKVSRGPGVRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.86
3	0.9
4	0.94
5	0.95
6	0.95
7	0.95
8	0.95
9	0.93
10	0.87
11	0.85
12	0.77
13	0.72
14	0.67
15	0.62
16	0.6
17	0.52
18	0.47
19	0.45
20	0.43
21	0.36
22	0.3
23	0.25
24	0.19
25	0.17
26	0.17
27	0.12
28	0.14
29	0.2
30	0.2
31	0.21
32	0.2
33	0.19
34	0.18
35	0.17
36	0.14
37	0.08
38	0.09
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.08
43	0.1
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.14
49	0.15
50	0.14
51	0.13
52	0.14
53	0.18
54	0.22
55	0.28
56	0.33
57	0.41
58	0.47
59	0.54
60	0.62
61	0.69
62	0.75
63	0.8
64	0.83
65	0.84
66	0.9
67	0.91
68	0.92
69	0.87
70	0.81
71	0.73
72	0.65
73	0.55
74	0.45
75	0.36
76	0.26
77	0.2
78	0.15
79	0.12
80	0.09
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.15
85	0.16
86	0.18
87	0.17
88	0.17
89	0.19
90	0.25
91	0.23
92	0.19
93	0.25
94	0.24
95	0.25
96	0.26
97	0.25
98	0.19
99	0.18
100	0.16
101	0.12
102	0.12
103	0.14
104	0.13
105	0.12
106	0.12
107	0.11
108	0.12
109	0.1
110	0.13
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.11
115	0.11
116	0.1
117	0.09
118	0.06
119	0.06
120	0.08
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.11
126	0.13
127	0.14
128	0.18
129	0.25
130	0.31
131	0.35
132	0.41
133	0.49
134	0.57
135	0.62
136	0.63
137	0.63
138	0.64
139	0.66
140	0.64
141	0.62
142	0.56
143	0.51
144	0.43
145	0.35
146	0.28
147	0.21
148	0.16
149	0.09
150	0.06
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.1
160	0.14
161	0.14
162	0.13
163	0.13
164	0.14
165	0.16
166	0.19
167	0.18
168	0.17
169	0.21
170	0.23
171	0.27
172	0.28
173	0.3
174	0.28
175	0.31
176	0.32
177	0.29
178	0.28
179	0.24
180	0.22
181	0.19
182	0.17
183	0.12
184	0.08
185	0.06
186	0.04
187	0.03
188	0.03
189	0.04
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.06
208	0.13
209	0.19
210	0.21
211	0.22
212	0.26
213	0.29
214	0.28
215	0.29
216	0.23
217	0.21
218	0.2
219	0.2
220	0.17
221	0.17
222	0.17
223	0.17
224	0.18
225	0.18
226	0.17
227	0.17
228	0.17
229	0.17
230	0.21
231	0.21
232	0.21
233	0.2
234	0.2
235	0.18
236	0.18
237	0.16
238	0.12
239	0.12
240	0.08
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.16
258	0.18
259	0.19
260	0.19
261	0.19
262	0.17
263	0.17
264	0.17
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.09
276	0.09
277	0.11
278	0.13
279	0.13
280	0.16
281	0.21
282	0.23
283	0.23
284	0.27
285	0.34
286	0.36
287	0.42
288	0.41
289	0.39
290	0.38
291	0.38
292	0.41
293	0.4
294	0.36
295	0.34
296	0.32
297	0.29
298	0.28
299	0.25
300	0.17
301	0.1
302	0.09
303	0.05
304	0.06
305	0.05
306	0.07
307	0.08
308	0.1
309	0.11
310	0.14
311	0.15
312	0.17
313	0.21
314	0.24
315	0.26
316	0.24
317	0.29
318	0.27
319	0.26
320	0.22
321	0.18
322	0.15
323	0.14
324	0.14
325	0.12
326	0.17
327	0.21
328	0.25
329	0.27
330	0.29
331	0.36
332	0.45
333	0.51
334	0.51
335	0.52
336	0.51
337	0.51
338	0.48
339	0.43
340	0.36
341	0.3
342	0.24
343	0.2
344	0.17
345	0.16
346	0.15
347	0.12
348	0.11
349	0.09
350	0.11
351	0.15
352	0.16
353	0.17
354	0.18
355	0.19
356	0.18
357	0.19
358	0.2
359	0.18
360	0.18
361	0.17
362	0.21
363	0.22
364	0.21
365	0.24
366	0.25
367	0.23
368	0.26
369	0.26
370	0.23
371	0.27
372	0.31
373	0.31
374	0.31
375	0.36
376	0.39
377	0.42
378	0.41
379	0.42
380	0.37
381	0.33
382	0.32
383	0.25
384	0.23
385	0.21
386	0.21
387	0.16
388	0.16
389	0.16
390	0.14
391	0.14
392	0.1
393	0.08
394	0.12
395	0.14
396	0.15
397	0.15
398	0.16
399	0.15
400	0.17
401	0.17
402	0.14
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.11
407	0.11
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.09
412	0.08
413	0.08
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.13
418	0.14
419	0.15
420	0.19
421	0.22
422	0.23
423	0.27
424	0.3
425	0.34
426	0.36
427	0.39
428	0.36
429	0.35
430	0.34
431	0.32
432	0.32
433	0.25
434	0.28
435	0.31
436	0.37
437	0.4
438	0.47
439	0.5
440	0.51
441	0.57
442	0.59
443	0.57
444	0.55
445	0.54
446	0.53
447	0.53
448	0.49
449	0.5
450	0.46
451	0.44
452	0.42
453	0.4
454	0.4
455	0.42
456	0.45
457	0.43
458	0.48
459	0.47
460	0.48
461	0.49
462	0.44
463	0.42
464	0.46
465	0.45
466	0.41
467	0.45
468	0.47
469	0.5
470	0.53
471	0.5
472	0.5
473	0.48
474	0.45
475	0.46
476	0.47
477	0.5

C1G2B3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer