FuNGI

A0A1C1CHS2

Protein Details

Accession

A0A1C1CHS2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
496-520	DALRLWDKIKKEKREREVKDDQVVQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000690 Matrin/U1-C_Znf_C2H2 IPR003604 Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2 IPR031774 SF3A3_dom IPR024598 SF3a60/Prp9_C IPR021966 SF3a60_bindingd IPR036236 Znf_C2H2_sf IPR013087 Znf_C2H2_type
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF16837 SF3A3 PF12108 SF3a60_bindingd PF11931 SF3a60_Prp9_C PF12874 zf-met
PROSITE	View protein in PROSITE PS50171 ZF_MATRIN PS00028 ZINC_FINGER_C2H2_1

Amino Acid Sequences

MLLEDQRFLHEDLERLEQAITDRVAEDPKNIKDRLIRDHQINGFLTRIQEQSKRLLDIYKDAEGLRTKEVQSLSTGEPFDEFYKQLEEVKDFHRRYPNEPVENLERAYKRRRPEEGEYIPSEVDNMFSGEESNGRFLDLTQLHEEYLNLPGVKRLTYLQYLDSFDAFEPPRLPIKRQNKITDQYLQYVAGLDGYLEGFVRRTRPLEDLPKLFLRYQREFDTAWDKGEVPGWTKETREQDTSAGPQTEGSGTGTWCPACEKEFTNQNVYNSHLTGKKHIKNAAAKKSDSTDRAGTDDKNDGTSSRPSSLPISGTALKERAIASHEHRIRSLADLLSNERSNTRVNVERKQGMTERERQAELDALFAEDDAAVLASDRRAANKRTGGGGGDDSGSEDEGDEKIYNPLKLPLAWDGKPIPYWLYKLHGLGVEFSCEICGNFVYMGRRAFDKHFSEARHIYGLKCLGITGSALSGVSSGGGGVAASGGLSLFREITAIEDALRLWDKIKKEKREREVKDDQVVQMEDGEGNVMPERIYLDLQKQGIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.24
4	0.22
5	0.22
6	0.23
7	0.21
8	0.15
9	0.16
10	0.16
11	0.21
12	0.21
13	0.25
14	0.28
15	0.34
16	0.4
17	0.4
18	0.43
19	0.45
20	0.5
21	0.52
22	0.55
23	0.54
24	0.51
25	0.59
26	0.58
27	0.57
28	0.53
29	0.46
30	0.37
31	0.33
32	0.31
33	0.26
34	0.26
35	0.25
36	0.28
37	0.29
38	0.36
39	0.39
40	0.39
41	0.37
42	0.39
43	0.36
44	0.39
45	0.4
46	0.34
47	0.32
48	0.29
49	0.33
50	0.32
51	0.32
52	0.29
53	0.29
54	0.27
55	0.3
56	0.31
57	0.27
58	0.25
59	0.27
60	0.26
61	0.26
62	0.26
63	0.21
64	0.21
65	0.22
66	0.21
67	0.19
68	0.17
69	0.14
70	0.17
71	0.18
72	0.21
73	0.22
74	0.22
75	0.23
76	0.28
77	0.37
78	0.35
79	0.41
80	0.46
81	0.46
82	0.5
83	0.58
84	0.61
85	0.57
86	0.57
87	0.56
88	0.53
89	0.52
90	0.47
91	0.43
92	0.37
93	0.37
94	0.45
95	0.45
96	0.47
97	0.53
98	0.59
99	0.59
100	0.64
101	0.7
102	0.68
103	0.68
104	0.63
105	0.56
106	0.49
107	0.41
108	0.34
109	0.23
110	0.16
111	0.1
112	0.09
113	0.07
114	0.07
115	0.08
116	0.07
117	0.1
118	0.1
119	0.11
120	0.1
121	0.1
122	0.1
123	0.1
124	0.17
125	0.17
126	0.19
127	0.2
128	0.21
129	0.21
130	0.21
131	0.21
132	0.14
133	0.15
134	0.14
135	0.11
136	0.11
137	0.13
138	0.14
139	0.14
140	0.14
141	0.13
142	0.15
143	0.18
144	0.19
145	0.19
146	0.22
147	0.23
148	0.23
149	0.22
150	0.19
151	0.16
152	0.2
153	0.17
154	0.16
155	0.14
156	0.16
157	0.23
158	0.24
159	0.28
160	0.33
161	0.43
162	0.5
163	0.57
164	0.62
165	0.62
166	0.65
167	0.66
168	0.64
169	0.56
170	0.5
171	0.43
172	0.36
173	0.29
174	0.24
175	0.2
176	0.12
177	0.09
178	0.06
179	0.05
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.06
186	0.08
187	0.09
188	0.11
189	0.13
190	0.17
191	0.23
192	0.31
193	0.35
194	0.35
195	0.37
196	0.38
197	0.38
198	0.36
199	0.35
200	0.33
201	0.32
202	0.34
203	0.33
204	0.33
205	0.31
206	0.32
207	0.34
208	0.28
209	0.25
210	0.22
211	0.19
212	0.17
213	0.2
214	0.18
215	0.14
216	0.16
217	0.18
218	0.18
219	0.18
220	0.23
221	0.25
222	0.28
223	0.27
224	0.26
225	0.25
226	0.26
227	0.27
228	0.25
229	0.2
230	0.16
231	0.14
232	0.14
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.08
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.1
246	0.11
247	0.15
248	0.22
249	0.24
250	0.29
251	0.31
252	0.3
253	0.3
254	0.3
255	0.28
256	0.21
257	0.21
258	0.19
259	0.17
260	0.23
261	0.31
262	0.33
263	0.36
264	0.39
265	0.42
266	0.47
267	0.55
268	0.57
269	0.53
270	0.49
271	0.45
272	0.45
273	0.43
274	0.37
275	0.32
276	0.25
277	0.21
278	0.23
279	0.24
280	0.21
281	0.2
282	0.21
283	0.18
284	0.17
285	0.16
286	0.14
287	0.15
288	0.18
289	0.18
290	0.17
291	0.16
292	0.17
293	0.18
294	0.19
295	0.18
296	0.15
297	0.17
298	0.18
299	0.18
300	0.18
301	0.17
302	0.16
303	0.17
304	0.16
305	0.12
306	0.11
307	0.13
308	0.16
309	0.25
310	0.28
311	0.27
312	0.27
313	0.28
314	0.27
315	0.26
316	0.25
317	0.17
318	0.15
319	0.15
320	0.18
321	0.2
322	0.2
323	0.18
324	0.15
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.18
329	0.22
330	0.26
331	0.32
332	0.37
333	0.4
334	0.39
335	0.42
336	0.41
337	0.39
338	0.4
339	0.43
340	0.43
341	0.41
342	0.41
343	0.37
344	0.35
345	0.33
346	0.28
347	0.2
348	0.14
349	0.12
350	0.11
351	0.1
352	0.09
353	0.05
354	0.05
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.07
362	0.08
363	0.12
364	0.16
365	0.19
366	0.26
367	0.3
368	0.31
369	0.31
370	0.32
371	0.28
372	0.26
373	0.24
374	0.18
375	0.14
376	0.12
377	0.11
378	0.1
379	0.09
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.08
385	0.07
386	0.08
387	0.12
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.19
392	0.19
393	0.19
394	0.21
395	0.23
396	0.26
397	0.26
398	0.29
399	0.27
400	0.28
401	0.28
402	0.27
403	0.22
404	0.19
405	0.21
406	0.19
407	0.22
408	0.23
409	0.23
410	0.25
411	0.24
412	0.22
413	0.23
414	0.22
415	0.19
416	0.17
417	0.16
418	0.15
419	0.13
420	0.12
421	0.09
422	0.09
423	0.07
424	0.08
425	0.11
426	0.13
427	0.16
428	0.18
429	0.18
430	0.19
431	0.22
432	0.25
433	0.3
434	0.31
435	0.34
436	0.38
437	0.39
438	0.45
439	0.44
440	0.43
441	0.41
442	0.38
443	0.32
444	0.33
445	0.32
446	0.26
447	0.23
448	0.2
449	0.15
450	0.14
451	0.14
452	0.09
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.04
461	0.04
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.04
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.08
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.11
484	0.15
485	0.16
486	0.14
487	0.14
488	0.19
489	0.24
490	0.34
491	0.44
492	0.51
493	0.61
494	0.71
495	0.79
496	0.85
497	0.87
498	0.86
499	0.87
500	0.83
501	0.8
502	0.75
503	0.66
504	0.61
505	0.55
506	0.45
507	0.36
508	0.29
509	0.21
510	0.16
511	0.15
512	0.09
513	0.09
514	0.1
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.1
519	0.11
520	0.13
521	0.15
522	0.19
523	0.25

A0A1C1CHS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer