Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C1CJ40

Protein Details
Accession A0A1C1CJ40    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-254SATGARKRGRPKTPVSDRQPRKRRKKGTGNPGGWSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-259ARKRGRPKTPVSDRQPRKRRKKGTGNPGGWSKGMKIG
740-750RGRHRKRLPKR
792-827ARKVERNRKDRPPARFQAAPPKYEFKAKRPTAKERD
Subcellular Location(s) nucl 9cyto_nucl 9, cyto 7, mito 6, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGLSPDGSVPPASIASSFSIPQYSWQAYIPPLAPEEVHSRGEPRPSESEDDGFGLVSPLRGLGPRPPVHTATPLEQTLSAGHFFSRYQPQPQHSAAATHSRLLTFSQSLFQSQPQILDHPSARPQPPGAVVPDTQLHHSVYPDPTNRAPDRLSTHVPHHPQQQVQHGEDRVWDAPQHVAQTWAQPPTEVEFGGASNVSMTQSEQAASHEDVVVAGSASATGARKRGRPKTPVSDRQPRKRRKKGTGNPGGWSKGMKIGPRPAIDPGPEFNSLYTQALEAFIDEQDSDKALDLVTKALAINPEIYSAHALRAELLFARGEDENALATLFLAAHASPTDPEVWFQAASAHLERYKGRREVALQQANYCFSRIIHVGSARDRHIEARFQRAAVNRELTNYTKAMKDLEIILEVMPRNSSVLRQIAEICIDLRDITRAKEVYEKTLAYYRENGFEDEESFSWADILVYAQILALEEPPDLAISNALKVLKQLSRWLLGRADEAYWDRITGDDREFDSEDEPRRVLVPDFDPGRYPPEAYGAGLPLEIRVRLGMLRLRQGQEALDEALAHFEWLEPDARDESANVFEYPDLFLEVAEALHEAKEYDQALRYYQALKETNAYSHTDFWLGIGASSYMCGNNLQAVECYEEAKQGDEKSVEARTQLSKLFADYGDKELAMENAREAVRLAESLLPDHGKRKYEPKQLRYAREDAEKALKEAFQLSGNYTGGVPVERIESKLEMVGRGRHRKRLPKRLPTEMNLAGEGGEERENRPGEGLEDGDDLPPASEREMARLIARKVERNRKDRPPARFQAAPPKYEFKAKRPTAKERDARRTDAINGLYQSLLDSTEAMRAGDELAQHAWMGCAETLLKDFRANRTFYSDDRIVKVSGLAREALVETRKRWQEQQEINQAEDQELDPDIPIPSVESNLPTEYREIAFSDWLDIFLEYALLLSQSPDPDAQHRCYTTIDAALGCIIWKRDRQTLLQIHITYLACAMALRDEDTLYNVVLRWFLKTYEFNNDAYRLFAAINLLYPHELDKSGKDGQMKNAMFRGRSMHQFVLKQLLLADSSLPMDYNPPGVGPVPDFMRKGADAEEQSTRTKDDLTATPASRSARSTESGERAATQTPAYGNFRIRESTGETPGPAEQAERRHSETPAFVDQLEPQPRTAPEQQQGQQQPSGITELNALLLLLYGQILNAAGTFSGALNYFLRAQSLDPQNPVILLSIALTYMHLTFIKKCSNRHMMLLQGWAFFEQYADARREWAQRKLQDQKEESEGQPDLEGLEVLIEREVEFNRARCWHMLGMADLAVSGYQKMLSLAVPSSGIDREDTMKDTDFTMDAAYAMSTIYAMSGNMEMARDVTEKYLVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.16
5 0.16
6 0.15
7 0.17
8 0.16
9 0.2
10 0.25
11 0.24
12 0.23
13 0.23
14 0.25
15 0.24
16 0.29
17 0.27
18 0.22
19 0.21
20 0.21
21 0.2
22 0.21
23 0.26
24 0.25
25 0.26
26 0.25
27 0.27
28 0.3
29 0.37
30 0.36
31 0.36
32 0.38
33 0.4
34 0.45
35 0.45
36 0.43
37 0.37
38 0.37
39 0.31
40 0.25
41 0.2
42 0.16
43 0.13
44 0.11
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.12
50 0.17
51 0.27
52 0.3
53 0.35
54 0.39
55 0.42
56 0.44
57 0.48
58 0.46
59 0.41
60 0.42
61 0.38
62 0.35
63 0.32
64 0.29
65 0.25
66 0.23
67 0.19
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.14
72 0.19
73 0.26
74 0.28
75 0.36
76 0.43
77 0.47
78 0.53
79 0.54
80 0.54
81 0.45
82 0.44
83 0.38
84 0.41
85 0.38
86 0.33
87 0.33
88 0.28
89 0.27
90 0.26
91 0.27
92 0.2
93 0.2
94 0.22
95 0.21
96 0.24
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.25
101 0.26
102 0.24
103 0.25
104 0.25
105 0.28
106 0.28
107 0.27
108 0.32
109 0.37
110 0.37
111 0.37
112 0.37
113 0.35
114 0.37
115 0.36
116 0.33
117 0.3
118 0.28
119 0.28
120 0.31
121 0.28
122 0.27
123 0.26
124 0.24
125 0.21
126 0.23
127 0.25
128 0.25
129 0.31
130 0.33
131 0.35
132 0.37
133 0.44
134 0.45
135 0.44
136 0.4
137 0.39
138 0.41
139 0.43
140 0.46
141 0.41
142 0.45
143 0.49
144 0.54
145 0.53
146 0.55
147 0.54
148 0.53
149 0.54
150 0.58
151 0.56
152 0.54
153 0.55
154 0.48
155 0.42
156 0.39
157 0.39
158 0.3
159 0.25
160 0.22
161 0.17
162 0.2
163 0.21
164 0.22
165 0.18
166 0.2
167 0.2
168 0.25
169 0.28
170 0.28
171 0.25
172 0.23
173 0.24
174 0.25
175 0.26
176 0.19
177 0.16
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.09
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.07
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.07
208 0.09
209 0.14
210 0.18
211 0.25
212 0.34
213 0.44
214 0.51
215 0.57
216 0.65
217 0.7
218 0.78
219 0.82
220 0.82
221 0.83
222 0.84
223 0.88
224 0.89
225 0.89
226 0.89
227 0.9
228 0.91
229 0.91
230 0.93
231 0.92
232 0.93
233 0.93
234 0.86
235 0.8
236 0.75
237 0.66
238 0.55
239 0.46
240 0.36
241 0.32
242 0.32
243 0.3
244 0.3
245 0.36
246 0.42
247 0.42
248 0.43
249 0.39
250 0.4
251 0.38
252 0.35
253 0.29
254 0.27
255 0.27
256 0.25
257 0.22
258 0.21
259 0.2
260 0.19
261 0.16
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.1
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.1
301 0.11
302 0.09
303 0.08
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.17
338 0.2
339 0.24
340 0.3
341 0.31
342 0.31
343 0.32
344 0.35
345 0.41
346 0.49
347 0.51
348 0.45
349 0.44
350 0.45
351 0.44
352 0.4
353 0.32
354 0.22
355 0.14
356 0.17
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.18
361 0.2
362 0.24
363 0.28
364 0.25
365 0.26
366 0.25
367 0.25
368 0.25
369 0.3
370 0.29
371 0.34
372 0.34
373 0.33
374 0.36
375 0.38
376 0.39
377 0.35
378 0.36
379 0.28
380 0.29
381 0.31
382 0.29
383 0.27
384 0.25
385 0.22
386 0.19
387 0.19
388 0.18
389 0.16
390 0.15
391 0.13
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.14
406 0.15
407 0.16
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.17
412 0.13
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.16
421 0.16
422 0.16
423 0.23
424 0.24
425 0.25
426 0.28
427 0.27
428 0.24
429 0.29
430 0.29
431 0.24
432 0.29
433 0.25
434 0.27
435 0.28
436 0.27
437 0.23
438 0.22
439 0.22
440 0.18
441 0.17
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.08
448 0.06
449 0.06
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.13
473 0.13
474 0.14
475 0.18
476 0.19
477 0.23
478 0.24
479 0.26
480 0.24
481 0.23
482 0.23
483 0.2
484 0.17
485 0.15
486 0.15
487 0.16
488 0.13
489 0.13
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.14
497 0.17
498 0.17
499 0.17
500 0.17
501 0.19
502 0.21
503 0.2
504 0.19
505 0.16
506 0.17
507 0.17
508 0.16
509 0.15
510 0.14
511 0.17
512 0.19
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.22
517 0.19
518 0.18
519 0.13
520 0.15
521 0.15
522 0.14
523 0.14
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.07
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.06
535 0.08
536 0.1
537 0.11
538 0.17
539 0.2
540 0.22
541 0.22
542 0.22
543 0.2
544 0.18
545 0.17
546 0.12
547 0.09
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.05
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.07
558 0.06
559 0.07
560 0.08
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.1
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.1
571 0.1
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.1
590 0.11
591 0.12
592 0.13
593 0.13
594 0.13
595 0.13
596 0.18
597 0.17
598 0.17
599 0.19
600 0.19
601 0.19
602 0.19
603 0.21
604 0.16
605 0.16
606 0.16
607 0.13
608 0.12
609 0.11
610 0.11
611 0.09
612 0.08
613 0.07
614 0.06
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.04
619 0.04
620 0.05
621 0.04
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.1
634 0.11
635 0.1
636 0.11
637 0.1
638 0.11
639 0.11
640 0.13
641 0.12
642 0.11
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.14
647 0.13
648 0.12
649 0.12
650 0.13
651 0.11
652 0.12
653 0.11
654 0.13
655 0.12
656 0.12
657 0.11
658 0.1
659 0.11
660 0.1
661 0.09
662 0.06
663 0.09
664 0.09
665 0.09
666 0.09
667 0.08
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.08
675 0.09
676 0.09
677 0.13
678 0.15
679 0.15
680 0.16
681 0.25
682 0.33
683 0.42
684 0.51
685 0.52
686 0.6
687 0.64
688 0.69
689 0.65
690 0.59
691 0.51
692 0.47
693 0.43
694 0.34
695 0.34
696 0.28
697 0.24
698 0.21
699 0.19
700 0.15
701 0.15
702 0.14
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.12
707 0.12
708 0.12
709 0.11
710 0.1
711 0.08
712 0.08
713 0.07
714 0.05
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.11
722 0.1
723 0.1
724 0.11
725 0.17
726 0.23
727 0.32
728 0.34
729 0.41
730 0.47
731 0.56
732 0.65
733 0.7
734 0.73
735 0.73
736 0.77
737 0.79
738 0.77
739 0.7
740 0.66
741 0.58
742 0.48
743 0.38
744 0.32
745 0.22
746 0.17
747 0.14
748 0.08
749 0.08
750 0.07
751 0.08
752 0.12
753 0.13
754 0.13
755 0.13
756 0.12
757 0.11
758 0.11
759 0.11
760 0.08
761 0.09
762 0.09
763 0.08
764 0.08
765 0.07
766 0.06
767 0.07
768 0.06
769 0.05
770 0.09
771 0.09
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.15
776 0.2
777 0.2
778 0.22
779 0.24
780 0.28
781 0.35
782 0.45
783 0.51
784 0.53
785 0.61
786 0.64
787 0.73
788 0.73
789 0.73
790 0.72
791 0.69
792 0.67
793 0.64
794 0.56
795 0.56
796 0.53
797 0.47
798 0.4
799 0.39
800 0.35
801 0.4
802 0.4
803 0.36
804 0.44
805 0.46
806 0.52
807 0.55
808 0.64
809 0.64
810 0.71
811 0.72
812 0.7
813 0.76
814 0.71
815 0.69
816 0.61
817 0.55
818 0.47
819 0.45
820 0.37
821 0.28
822 0.24
823 0.21
824 0.18
825 0.16
826 0.14
827 0.09
828 0.08
829 0.05
830 0.05
831 0.05
832 0.07
833 0.08
834 0.07
835 0.07
836 0.07
837 0.07
838 0.08
839 0.08
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.07
845 0.06
846 0.05
847 0.06
848 0.05
849 0.05
850 0.05
851 0.05
852 0.07
853 0.08
854 0.09
855 0.11
856 0.12
857 0.19
858 0.23
859 0.24
860 0.24
861 0.3
862 0.31
863 0.29
864 0.34
865 0.32
866 0.29
867 0.3
868 0.31
869 0.25
870 0.22
871 0.24
872 0.2
873 0.17
874 0.16
875 0.14
876 0.12
877 0.13
878 0.13
879 0.13
880 0.14
881 0.14
882 0.15
883 0.22
884 0.26
885 0.28
886 0.32
887 0.37
888 0.43
889 0.5
890 0.57
891 0.59
892 0.57
893 0.55
894 0.52
895 0.45
896 0.35
897 0.28
898 0.19
899 0.1
900 0.09
901 0.08
902 0.06
903 0.07
904 0.07
905 0.06
906 0.06
907 0.06
908 0.06
909 0.07
910 0.08
911 0.08
912 0.1
913 0.11
914 0.12
915 0.12
916 0.13
917 0.13
918 0.13
919 0.13
920 0.12
921 0.12
922 0.12
923 0.12
924 0.13
925 0.11
926 0.11
927 0.1
928 0.09
929 0.08
930 0.07
931 0.07
932 0.04
933 0.04
934 0.04
935 0.03
936 0.03
937 0.05
938 0.06
939 0.06
940 0.08
941 0.09
942 0.1
943 0.15
944 0.2
945 0.23
946 0.26
947 0.26
948 0.27
949 0.27
950 0.28
951 0.24
952 0.21
953 0.18
954 0.13
955 0.13
956 0.11
957 0.1
958 0.08
959 0.08
960 0.08
961 0.1
962 0.13
963 0.17
964 0.23
965 0.25
966 0.28
967 0.36
968 0.41
969 0.43
970 0.46
971 0.42
972 0.37
973 0.39
974 0.36
975 0.27
976 0.21
977 0.16
978 0.09
979 0.09
980 0.09
981 0.06
982 0.06
983 0.07
984 0.07
985 0.08
986 0.08
987 0.1
988 0.11
989 0.09
990 0.09
991 0.08
992 0.08
993 0.1
994 0.11
995 0.11
996 0.11
997 0.12
998 0.16
999 0.19
1000 0.21
1001 0.28
1002 0.3
1003 0.29
1004 0.3
1005 0.31
1006 0.28
1007 0.25
1008 0.23
1009 0.15
1010 0.13
1011 0.12
1012 0.11
1013 0.09
1014 0.1
1015 0.1
1016 0.1
1017 0.09
1018 0.1
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.11
1022 0.11
1023 0.12
1024 0.16
1025 0.19
1026 0.21
1027 0.26
1028 0.28
1029 0.32
1030 0.41
1031 0.4
1032 0.37
1033 0.39
1034 0.39
1035 0.33
1036 0.32
1037 0.32
1038 0.26
1039 0.31
1040 0.34
1041 0.33
1042 0.35
1043 0.36
1044 0.36
1045 0.38
1046 0.34
1047 0.29
1048 0.25
1049 0.21
1050 0.17
1051 0.16
1052 0.15
1053 0.08
1054 0.09
1055 0.08
1056 0.08
1057 0.07
1058 0.09
1059 0.09
1060 0.1
1061 0.09
1062 0.09
1063 0.1
1064 0.1
1065 0.11
1066 0.1
1067 0.12
1068 0.14
1069 0.17
1070 0.18
1071 0.17
1072 0.19
1073 0.19
1074 0.19
1075 0.19
1076 0.21
1077 0.19
1078 0.22
1079 0.26
1080 0.25
1081 0.27
1082 0.27
1083 0.26
1084 0.21
1085 0.21
1086 0.19
1087 0.19
1088 0.21
1089 0.24
1090 0.3
1091 0.29
1092 0.3
1093 0.32
1094 0.33
1095 0.3
1096 0.27
1097 0.25
1098 0.22
1099 0.24
1100 0.27
1101 0.3
1102 0.33
1103 0.33
1104 0.32
1105 0.31
1106 0.29
1107 0.28
1108 0.24
1109 0.18
1110 0.16
1111 0.15
1112 0.19
1113 0.21
1114 0.23
1115 0.25
1116 0.26
1117 0.28
1118 0.28
1119 0.27
1120 0.26
1121 0.28
1122 0.3
1123 0.31
1124 0.3
1125 0.28
1126 0.27
1127 0.27
1128 0.25
1129 0.19
1130 0.16
1131 0.15
1132 0.21
1133 0.26
1134 0.28
1135 0.33
1136 0.35
1137 0.36
1138 0.37
1139 0.36
1140 0.35
1141 0.35
1142 0.31
1143 0.26
1144 0.25
1145 0.27
1146 0.33
1147 0.36
1148 0.31
1149 0.27
1150 0.3
1151 0.31
1152 0.36
1153 0.4
1154 0.39
1155 0.38
1156 0.46
1157 0.49
1158 0.55
1159 0.59
1160 0.56
1161 0.51
1162 0.44
1163 0.39
1164 0.32
1165 0.32
1166 0.23
1167 0.18
1168 0.16
1169 0.14
1170 0.13
1171 0.12
1172 0.1
1173 0.07
1174 0.06
1175 0.06
1176 0.04
1177 0.04
1178 0.03
1179 0.03
1180 0.04
1181 0.04
1182 0.04
1183 0.04
1184 0.04
1185 0.04
1186 0.04
1187 0.05
1188 0.05
1189 0.06
1190 0.07
1191 0.09
1192 0.09
1193 0.11
1194 0.13
1195 0.13
1196 0.14
1197 0.13
1198 0.14
1199 0.21
1200 0.29
1201 0.31
1202 0.31
1203 0.32
1204 0.31
1205 0.31
1206 0.3
1207 0.22
1208 0.13
1209 0.1
1210 0.09
1211 0.08
1212 0.07
1213 0.07
1214 0.07
1215 0.07
1216 0.07
1217 0.09
1218 0.1
1219 0.11
1220 0.15
1221 0.2
1222 0.3
1223 0.33
1224 0.36
1225 0.44
1226 0.52
1227 0.53
1228 0.55
1229 0.53
1230 0.5
1231 0.48
1232 0.51
1233 0.44
1234 0.35
1235 0.33
1236 0.28
1237 0.24
1238 0.18
1239 0.15
1240 0.1
1241 0.11
1242 0.15
1243 0.17
1244 0.17
1245 0.19
1246 0.24
1247 0.33
1248 0.37
1249 0.43
1250 0.48
1251 0.52
1252 0.61
1253 0.69
1254 0.72
1255 0.73
1256 0.71
1257 0.66
1258 0.64
1259 0.63
1260 0.54
1261 0.49
1262 0.42
1263 0.33
1264 0.3
1265 0.25
1266 0.18
1267 0.14
1268 0.13
1269 0.07
1270 0.08
1271 0.07
1272 0.07
1273 0.07
1274 0.07
1275 0.07
1276 0.1
1277 0.11
1278 0.14
1279 0.18
1280 0.19
1281 0.24
1282 0.28
1283 0.31
1284 0.3
1285 0.34
1286 0.32
1287 0.31
1288 0.31
1289 0.28
1290 0.26
1291 0.23
1292 0.21
1293 0.16
1294 0.13
1295 0.1
1296 0.08
1297 0.07
1298 0.06
1299 0.06
1300 0.06
1301 0.07
1302 0.08
1303 0.08
1304 0.1
1305 0.11
1306 0.11
1307 0.12
1308 0.12
1309 0.14
1310 0.14
1311 0.14
1312 0.13
1313 0.14
1314 0.17
1315 0.19
1316 0.22
1317 0.22
1318 0.23
1319 0.23
1320 0.23
1321 0.23
1322 0.2
1323 0.17
1324 0.16
1325 0.13
1326 0.11
1327 0.1
1328 0.09
1329 0.07
1330 0.07
1331 0.06
1332 0.05
1333 0.04
1334 0.05
1335 0.05
1336 0.05
1337 0.06
1338 0.07
1339 0.08
1340 0.09
1341 0.09
1342 0.09
1343 0.09
1344 0.12
1345 0.12
1346 0.12
1347 0.13