FuNGI

A0A1C1CM09

Protein Details

Accession

A0A1C1CM09

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
630-695	HDVSARPTPKVKKPRAKRKSDSGDPATPKEPKKRKKAASKTEESSKRENAPRKRGKKNKALSEEKI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
264-277	KVGSRGKGRAPPKK
329-340	SKPKTAAKRAGP
636-688	PTPKVKKPRAKRKSDSGDPATPKEPKKRKKAASKTEESSKRENAPRKRGKKNK

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_mito 7, mito 6.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MSSAVVVIISSSPPPAFAPSPTPAESPSRSKSPSTPVRDGAKRFKRSGQSRHGFSPCFSSAHALLARPGAENILLQSPGRSKFRPQASNHVRDDSGSPTTTTHYARKRTESRTEQLSNHFKPSKSCAPLTGTRVKVAQQEDQLGFEDGCEALLSPGSKEKSSNVRYSSLPPMEKAVPRRLDWTPVKSNEHSSETPVSGSQESRFANALLDAYAYPASANGPLTAAKTVNGNGDQSKRKRIDLVMATATTPASSVSQSRTAKDAKVGSRGKGRAPPKKALTITALATSAYCNGQDKEGKLQPMVEYLTSTQAAVGNDGESVIDVSLKKFSKPKTAAKRAGPSNKASVKSRLVSPASAMKTTLEQPVLFGPASQLARDESPTLMRDTMDALKQSEEIPSDPFSPQRTQPFSIESTSPRVVHGTNRLVRRRNLWSAAGRDADNALLQVETVDMTDSPAVRQALAGKDALMQSDGLHQHTRHVDEGNTRSPGARTPYIRRVRPVIDIYDIETPGLRGPAVHTTNPPVRGMHTVRTVEGRHDDSCAEHQPGGAQSKPTDASPRPKAVMPSYGGWSDHELKKQIATYGFKSIRKREKMIELLERCWKSKHGIVQDSDGPDDAADTLSHGDFLSKVHDVSARPTPKVKKPRAKRKSDSGDPATPKEPKKRKKAASKTEESSKRENAPRKRGKKNKALSEEKIMDVDDIDETNVEQAAAENEDLPALVNEPKEIRVNVGHVLTSLATPPPSLPKSESTVSTIEVENVDMDNAEVPPAVLTPKQTQPTDVMVQIHAAIHHPPATRPQGLDSHDHQRSPTWREKILMFDPIVLEELTAWLNTEGFKAIGEDGEVSLLEVRSWCEQNGVCCLGWRGRGKHGEGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.16
3	0.17
4	0.19
5	0.24
6	0.27
7	0.32
8	0.34
9	0.34
10	0.32
11	0.37
12	0.39
13	0.4
14	0.42
15	0.44
16	0.44
17	0.47
18	0.49
19	0.53
20	0.58
21	0.6
22	0.61
23	0.61
24	0.67
25	0.71
26	0.73
27	0.73
28	0.74
29	0.73
30	0.7
31	0.72
32	0.73
33	0.75
34	0.78
35	0.78
36	0.77
37	0.75
38	0.79
39	0.77
40	0.68
41	0.59
42	0.57
43	0.48
44	0.4
45	0.35
46	0.32
47	0.26
48	0.3
49	0.31
50	0.24
51	0.23
52	0.24
53	0.24
54	0.21
55	0.2
56	0.15
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.14
62	0.13
63	0.16
64	0.2
65	0.25
66	0.3
67	0.3
68	0.34
69	0.41
70	0.51
71	0.57
72	0.57
73	0.63
74	0.67
75	0.74
76	0.72
77	0.67
78	0.58
79	0.5
80	0.47
81	0.41
82	0.35
83	0.26
84	0.24
85	0.2
86	0.23
87	0.26
88	0.28
89	0.31
90	0.36
91	0.43
92	0.48
93	0.57
94	0.62
95	0.65
96	0.72
97	0.71
98	0.69
99	0.7
100	0.7
101	0.64
102	0.65
103	0.67
104	0.6
105	0.61
106	0.6
107	0.52
108	0.51
109	0.55
110	0.55
111	0.51
112	0.49
113	0.45
114	0.46
115	0.51
116	0.54
117	0.55
118	0.47
119	0.43
120	0.43
121	0.41
122	0.41
123	0.38
124	0.37
125	0.31
126	0.36
127	0.34
128	0.34
129	0.34
130	0.29
131	0.25
132	0.19
133	0.16
134	0.1
135	0.1
136	0.08
137	0.07
138	0.05
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.14
143	0.16
144	0.17
145	0.18
146	0.23
147	0.31
148	0.37
149	0.42
150	0.4
151	0.41
152	0.42
153	0.46
154	0.5
155	0.46
156	0.42
157	0.36
158	0.37
159	0.39
160	0.42
161	0.43
162	0.43
163	0.41
164	0.41
165	0.45
166	0.42
167	0.46
168	0.47
169	0.49
170	0.49
171	0.5
172	0.55
173	0.52
174	0.57
175	0.52
176	0.52
177	0.45
178	0.41
179	0.39
180	0.33
181	0.32
182	0.26
183	0.24
184	0.2
185	0.2
186	0.17
187	0.2
188	0.19
189	0.2
190	0.2
191	0.18
192	0.17
193	0.16
194	0.15
195	0.09
196	0.1
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.07
207	0.08
208	0.09
209	0.1
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.11
214	0.12
215	0.15
216	0.15
217	0.16
218	0.18
219	0.24
220	0.32
221	0.34
222	0.42
223	0.42
224	0.42
225	0.44
226	0.42
227	0.45
228	0.41
229	0.42
230	0.36
231	0.34
232	0.33
233	0.29
234	0.27
235	0.18
236	0.13
237	0.09
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.11
242	0.2
243	0.21
244	0.22
245	0.26
246	0.27
247	0.27
248	0.31
249	0.34
250	0.28
251	0.37
252	0.38
253	0.38
254	0.44
255	0.45
256	0.43
257	0.45
258	0.51
259	0.5
260	0.54
261	0.58
262	0.54
263	0.6
264	0.57
265	0.52
266	0.47
267	0.41
268	0.36
269	0.29
270	0.25
271	0.17
272	0.16
273	0.14
274	0.11
275	0.09
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.13
280	0.16
281	0.17
282	0.23
283	0.26
284	0.27
285	0.25
286	0.26
287	0.23
288	0.23
289	0.22
290	0.15
291	0.12
292	0.12
293	0.14
294	0.13
295	0.12
296	0.1
297	0.12
298	0.12
299	0.11
300	0.11
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.12
312	0.12
313	0.14
314	0.19
315	0.22
316	0.31
317	0.37
318	0.46
319	0.51
320	0.61
321	0.67
322	0.68
323	0.73
324	0.71
325	0.74
326	0.67
327	0.59
328	0.57
329	0.54
330	0.51
331	0.46
332	0.43
333	0.39
334	0.37
335	0.36
336	0.34
337	0.31
338	0.28
339	0.26
340	0.28
341	0.26
342	0.24
343	0.22
344	0.17
345	0.17
346	0.19
347	0.2
348	0.14
349	0.12
350	0.12
351	0.13
352	0.14
353	0.12
354	0.1
355	0.08
356	0.11
357	0.12
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.11
362	0.12
363	0.12
364	0.08
365	0.1
366	0.11
367	0.12
368	0.11
369	0.11
370	0.1
371	0.12
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.13
378	0.13
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.13
385	0.12
386	0.14
387	0.16
388	0.17
389	0.2
390	0.25
391	0.28
392	0.29
393	0.3
394	0.31
395	0.3
396	0.29
397	0.27
398	0.22
399	0.23
400	0.22
401	0.21
402	0.18
403	0.18
404	0.17
405	0.18
406	0.23
407	0.25
408	0.28
409	0.34
410	0.39
411	0.42
412	0.43
413	0.45
414	0.45
415	0.42
416	0.4
417	0.37
418	0.36
419	0.34
420	0.36
421	0.32
422	0.26
423	0.22
424	0.19
425	0.15
426	0.12
427	0.09
428	0.06
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.11
447	0.12
448	0.12
449	0.09
450	0.11
451	0.11
452	0.11
453	0.09
454	0.07
455	0.06
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.14
460	0.13
461	0.17
462	0.19
463	0.2
464	0.17
465	0.18
466	0.17
467	0.21
468	0.25
469	0.25
470	0.24
471	0.22
472	0.21
473	0.21
474	0.22
475	0.21
476	0.22
477	0.22
478	0.27
479	0.37
480	0.44
481	0.46
482	0.45
483	0.45
484	0.42
485	0.44
486	0.4
487	0.32
488	0.27
489	0.25
490	0.25
491	0.24
492	0.21
493	0.16
494	0.13
495	0.12
496	0.1
497	0.1
498	0.07
499	0.04
500	0.06
501	0.14
502	0.16
503	0.17
504	0.17
505	0.22
506	0.26
507	0.28
508	0.27
509	0.2
510	0.19
511	0.24
512	0.26
513	0.25
514	0.27
515	0.26
516	0.26
517	0.29
518	0.28
519	0.24
520	0.25
521	0.24
522	0.19
523	0.19
524	0.19
525	0.17
526	0.2
527	0.21
528	0.19
529	0.16
530	0.15
531	0.16
532	0.19
533	0.2
534	0.18
535	0.16
536	0.14
537	0.17
538	0.18
539	0.17
540	0.2
541	0.21
542	0.28
543	0.33
544	0.36
545	0.35
546	0.36
547	0.38
548	0.35
549	0.36
550	0.3
551	0.26
552	0.25
553	0.24
554	0.23
555	0.21
556	0.23
557	0.23
558	0.24
559	0.25
560	0.25
561	0.24
562	0.25
563	0.26
564	0.25
565	0.24
566	0.24
567	0.24
568	0.31
569	0.36
570	0.39
571	0.43
572	0.49
573	0.54
574	0.56
575	0.58
576	0.53
577	0.56
578	0.58
579	0.58
580	0.59
581	0.52
582	0.49
583	0.54
584	0.51
585	0.43
586	0.38
587	0.35
588	0.29
589	0.3
590	0.34
591	0.35
592	0.39
593	0.4
594	0.42
595	0.44
596	0.42
597	0.38
598	0.31
599	0.22
600	0.15
601	0.14
602	0.1
603	0.07
604	0.05
605	0.05
606	0.07
607	0.06
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.06
612	0.07
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.14
618	0.14
619	0.18
620	0.26
621	0.27
622	0.27
623	0.34
624	0.4
625	0.46
626	0.56
627	0.63
628	0.64
629	0.72
630	0.82
631	0.86
632	0.9
633	0.87
634	0.88
635	0.87
636	0.85
637	0.83
638	0.79
639	0.77
640	0.7
641	0.67
642	0.6
643	0.57
644	0.54
645	0.55
646	0.59
647	0.59
648	0.66
649	0.73
650	0.78
651	0.83
652	0.88
653	0.89
654	0.89
655	0.87
656	0.82
657	0.82
658	0.81
659	0.74
660	0.69
661	0.64
662	0.61
663	0.62
664	0.66
665	0.65
666	0.68
667	0.74
668	0.77
669	0.83
670	0.86
671	0.87
672	0.88
673	0.88
674	0.87
675	0.86
676	0.85
677	0.78
678	0.77
679	0.7
680	0.61
681	0.52
682	0.41
683	0.32
684	0.23
685	0.2
686	0.11
687	0.09
688	0.08
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.06
694	0.05
695	0.05
696	0.06
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.06
705	0.07
706	0.09
707	0.09
708	0.11
709	0.12
710	0.15
711	0.18
712	0.18
713	0.19
714	0.19
715	0.21
716	0.23
717	0.23
718	0.2
719	0.17
720	0.18
721	0.15
722	0.13
723	0.12
724	0.1
725	0.09
726	0.1
727	0.11
728	0.18
729	0.19
730	0.21
731	0.23
732	0.26
733	0.31
734	0.33
735	0.34
736	0.3
737	0.3
738	0.29
739	0.28
740	0.24
741	0.2
742	0.18
743	0.16
744	0.13
745	0.12
746	0.1
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.07
751	0.07
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.07
756	0.09
757	0.09
758	0.13
759	0.18
760	0.25
761	0.31
762	0.32
763	0.33
764	0.35
765	0.4
766	0.39
767	0.37
768	0.32
769	0.26
770	0.26
771	0.25
772	0.22
773	0.16
774	0.14
775	0.13
776	0.13
777	0.17
778	0.18
779	0.18
780	0.26
781	0.32
782	0.33
783	0.33
784	0.35
785	0.37
786	0.39
787	0.43
788	0.4
789	0.44
790	0.45
791	0.44
792	0.41
793	0.41
794	0.45
795	0.47
796	0.51
797	0.47
798	0.47
799	0.49
800	0.5
801	0.51
802	0.48
803	0.47
804	0.38
805	0.34
806	0.32
807	0.29
808	0.29
809	0.21
810	0.17
811	0.1
812	0.11
813	0.09
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.08
818	0.09
819	0.1
820	0.1
821	0.09
822	0.1
823	0.1
824	0.1
825	0.1
826	0.11
827	0.11
828	0.09
829	0.1
830	0.1
831	0.09
832	0.11
833	0.1
834	0.1
835	0.1
836	0.12
837	0.17
838	0.19
839	0.18
840	0.22
841	0.23
842	0.26
843	0.32
844	0.33
845	0.28
846	0.28
847	0.32
848	0.31
849	0.37
850	0.41
851	0.39
852	0.45
853	0.52

A0A1C1CM09

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer