Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1C1CNV4

Protein Details
Accession A0A1C1CNV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-135AFHHQDRQPKSQNSKGKRREKKSGQNKARDFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-129NSKGKRREKKSGQN
289-298NRRPGKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR035587  DUS-like_FMN-bd  
IPR018517  tRNA_hU_synthase_CS  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0050660  F:flavin adenine dinucleotide binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0102265  F:tRNA-dihydrouridine47 synthase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01207  Dus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01136  UPF0034  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd02801  DUS_like_FMN  
Amino Acid Sequences MDETAAGQPPQPEGDMTSYGAPADIALPEPADTASPTAKRKITELDGSAGNNGSKRRKGTAPVKEEFLVKTDDLIESKPVRDDADDLIESKPVRDDADDDAAEAFHHQDRQPKSQNSKGKRREKKSGQNKARDFGSSRDEVGLCSTRVHRPEFSPDSCPFGDSCRFEHDLRKYLSQYKREDLSTFNGVCPVSEVKGRCPAGWKCRFVGSHSTEVEHADGRKELVLVQNADQMAKYARTSEEEEEVGVANILTAQQRIQLTKRKVPTPRSDEFLSWLDERAQNPADQGRNRRPGKGSRRPESLRNSSSPEPETLQDEMDGAAAQDARAAFLEAPLRPSEKRRLYFGAETPILAPLTTQGNLPYRRLSTSLGATFTYSEMAMSLPLLQGHKSEWALMKAHESDVQPPTFTIKSQENIVFDYDQRKDLCFGAQIAANKPWLAVKATEVLTTLLPKGLRVVDLNVGCPIDLVYREGAGSALMDSPPKLEKMLRGMNMVSGETPVTVKIRTGTKDKQPTAQKLVDRLVLGSGNGDSCGVAAITLHGRSRQQRYTRSADWEYITETASLIKALNAKADAMADTIHEPEERDQPNGHKGSKNGKVFFIGNGDVFSHEHYYDHIQHAGVDGVMAARGALIKPWLFEEIAAGQYLDKSSSERLQIVERFVRYGLEAWGSDEWGVGQTRRFLLEWLSFACRYVPIGLLEYLPPNIQDRPPRFRGRDELETLMASDNYKDWIKIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.2
5 0.19
6 0.18
7 0.17
8 0.14
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.17
22 0.22
23 0.25
24 0.31
25 0.35
26 0.35
27 0.38
28 0.43
29 0.43
30 0.45
31 0.44
32 0.41
33 0.4
34 0.4
35 0.38
36 0.32
37 0.27
38 0.23
39 0.27
40 0.3
41 0.33
42 0.36
43 0.4
44 0.44
45 0.53
46 0.6
47 0.64
48 0.65
49 0.63
50 0.64
51 0.6
52 0.57
53 0.48
54 0.4
55 0.33
56 0.24
57 0.22
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.19
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.23
67 0.22
68 0.22
69 0.23
70 0.2
71 0.24
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.24
76 0.23
77 0.21
78 0.2
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.17
83 0.19
84 0.26
85 0.25
86 0.23
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.15
92 0.1
93 0.14
94 0.16
95 0.23
96 0.29
97 0.39
98 0.48
99 0.54
100 0.6
101 0.65
102 0.73
103 0.75
104 0.81
105 0.82
106 0.83
107 0.85
108 0.85
109 0.87
110 0.88
111 0.9
112 0.9
113 0.91
114 0.9
115 0.9
116 0.86
117 0.79
118 0.71
119 0.64
120 0.55
121 0.48
122 0.44
123 0.35
124 0.32
125 0.3
126 0.28
127 0.24
128 0.26
129 0.25
130 0.2
131 0.21
132 0.23
133 0.25
134 0.29
135 0.32
136 0.3
137 0.31
138 0.39
139 0.44
140 0.44
141 0.44
142 0.41
143 0.44
144 0.41
145 0.38
146 0.29
147 0.27
148 0.3
149 0.27
150 0.28
151 0.28
152 0.32
153 0.32
154 0.4
155 0.41
156 0.43
157 0.44
158 0.46
159 0.44
160 0.5
161 0.56
162 0.56
163 0.55
164 0.52
165 0.52
166 0.49
167 0.47
168 0.41
169 0.38
170 0.37
171 0.33
172 0.28
173 0.27
174 0.25
175 0.23
176 0.23
177 0.19
178 0.14
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.27
183 0.28
184 0.26
185 0.32
186 0.38
187 0.44
188 0.52
189 0.51
190 0.44
191 0.5
192 0.5
193 0.46
194 0.49
195 0.43
196 0.42
197 0.4
198 0.39
199 0.33
200 0.33
201 0.31
202 0.23
203 0.19
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.14
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.18
218 0.15
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.14
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.18
230 0.17
231 0.16
232 0.13
233 0.09
234 0.07
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.09
242 0.1
243 0.13
244 0.17
245 0.26
246 0.31
247 0.38
248 0.43
249 0.46
250 0.52
251 0.58
252 0.63
253 0.62
254 0.59
255 0.57
256 0.54
257 0.47
258 0.44
259 0.38
260 0.31
261 0.24
262 0.22
263 0.19
264 0.2
265 0.2
266 0.2
267 0.19
268 0.16
269 0.17
270 0.2
271 0.23
272 0.25
273 0.32
274 0.36
275 0.46
276 0.47
277 0.5
278 0.5
279 0.54
280 0.61
281 0.64
282 0.65
283 0.61
284 0.68
285 0.67
286 0.7
287 0.69
288 0.66
289 0.6
290 0.53
291 0.53
292 0.46
293 0.46
294 0.4
295 0.33
296 0.27
297 0.23
298 0.24
299 0.18
300 0.16
301 0.13
302 0.12
303 0.1
304 0.09
305 0.08
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.07
317 0.1
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.13
322 0.13
323 0.17
324 0.25
325 0.3
326 0.32
327 0.34
328 0.37
329 0.39
330 0.41
331 0.4
332 0.36
333 0.29
334 0.27
335 0.24
336 0.21
337 0.17
338 0.13
339 0.11
340 0.06
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.15
346 0.16
347 0.18
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.2
352 0.19
353 0.16
354 0.17
355 0.18
356 0.16
357 0.16
358 0.15
359 0.14
360 0.12
361 0.1
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.15
383 0.13
384 0.14
385 0.16
386 0.15
387 0.17
388 0.2
389 0.19
390 0.17
391 0.16
392 0.19
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.14
397 0.15
398 0.18
399 0.2
400 0.18
401 0.19
402 0.2
403 0.17
404 0.16
405 0.2
406 0.18
407 0.19
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.14
414 0.13
415 0.11
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.11
425 0.11
426 0.09
427 0.09
428 0.13
429 0.14
430 0.14
431 0.14
432 0.14
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.12
444 0.15
445 0.15
446 0.16
447 0.15
448 0.15
449 0.13
450 0.12
451 0.11
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.19
474 0.26
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.27
479 0.26
480 0.24
481 0.17
482 0.11
483 0.1
484 0.08
485 0.08
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.11
491 0.15
492 0.18
493 0.25
494 0.3
495 0.38
496 0.48
497 0.49
498 0.54
499 0.58
500 0.61
501 0.61
502 0.6
503 0.53
504 0.48
505 0.49
506 0.44
507 0.36
508 0.3
509 0.24
510 0.19
511 0.16
512 0.12
513 0.1
514 0.08
515 0.07
516 0.07
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.03
523 0.05
524 0.07
525 0.09
526 0.1
527 0.11
528 0.16
529 0.22
530 0.3
531 0.36
532 0.42
533 0.49
534 0.55
535 0.61
536 0.61
537 0.62
538 0.58
539 0.53
540 0.47
541 0.4
542 0.36
543 0.29
544 0.25
545 0.17
546 0.14
547 0.12
548 0.1
549 0.1
550 0.08
551 0.08
552 0.11
553 0.12
554 0.14
555 0.13
556 0.13
557 0.13
558 0.14
559 0.12
560 0.09
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.12
569 0.21
570 0.21
571 0.23
572 0.25
573 0.28
574 0.37
575 0.4
576 0.42
577 0.36
578 0.4
579 0.47
580 0.53
581 0.57
582 0.5
583 0.47
584 0.46
585 0.44
586 0.41
587 0.35
588 0.28
589 0.21
590 0.19
591 0.18
592 0.16
593 0.15
594 0.16
595 0.14
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.2
600 0.22
601 0.25
602 0.24
603 0.22
604 0.22
605 0.22
606 0.21
607 0.15
608 0.1
609 0.08
610 0.06
611 0.06
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.09
619 0.09
620 0.1
621 0.12
622 0.14
623 0.13
624 0.13
625 0.15
626 0.14
627 0.15
628 0.15
629 0.13
630 0.11
631 0.12
632 0.13
633 0.11
634 0.09
635 0.1
636 0.14
637 0.18
638 0.21
639 0.22
640 0.23
641 0.29
642 0.32
643 0.36
644 0.38
645 0.35
646 0.33
647 0.32
648 0.31
649 0.25
650 0.24
651 0.2
652 0.17
653 0.16
654 0.17
655 0.17
656 0.17
657 0.16
658 0.14
659 0.12
660 0.12
661 0.14
662 0.13
663 0.14
664 0.18
665 0.19
666 0.22
667 0.22
668 0.2
669 0.24
670 0.26
671 0.27
672 0.26
673 0.3
674 0.27
675 0.28
676 0.28
677 0.23
678 0.21
679 0.2
680 0.19
681 0.15
682 0.18
683 0.19
684 0.19
685 0.19
686 0.2
687 0.19
688 0.17
689 0.16
690 0.17
691 0.19
692 0.24
693 0.32
694 0.38
695 0.46
696 0.54
697 0.63
698 0.64
699 0.67
700 0.71
701 0.69
702 0.7
703 0.67
704 0.62
705 0.54
706 0.51
707 0.45
708 0.38
709 0.3
710 0.22
711 0.18
712 0.14
713 0.16
714 0.17