FuNGI

A0A1E4S542

Protein Details

Accession

A0A1E4S542

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
179-206	REKHKRIQIAMKRRRRFNKFKNRDGSEK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-201	PKKEEDMTKEEREKHKRIQIAMKRRRRFNKFKNR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002675 Ribosomal_L38e IPR038464 Ribosomal_L38e_sf IPR003196 TFIIF_beta IPR040450 TFIIF_beta_HTH IPR040504 TFIIF_beta_N IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF01781 Ribosomal_L38e PF02270 TFIIF_beta PF17683 TFIIF_beta_N
CDD	cd07980 TFIIF_beta

Amino Acid Sequences

MSVEPKTKKKDAPAEPQLTKEQEILIQQQNNDNSDDEEFLSDGAEVVDANDATQIAESLNLDMKGIDQQVWLVRVPRFLAERWRDHGSLKGQELGKVKIRRDLPLDQRGVAKLVLNSDSTNSEIPHNYDLQLTRAQVENQYVFTEQNLQRFTERDDSKTELDFTKKNPKKEEDMTKEEREKHKRIQIAMKRRRRFNKFKNRDGSEKVLPFVKTIPKKTALVGTVVHEAQIVPSLKDPNYSKIIAQRSQLMKEEPRPSVTLLQEHSGVSLSNAGLTLRTDTSSFLKPSIEKKNKNDGRAIRMPQKDLFDLLFKLFDQYDYWSLKGLKERTKQPEAYLKENLEQVAVLIKRGPYALKYTLKKEFKELKDQERAERLGELAKDNEADEEEDNEEDVEMEDREIKDIKKFLELTRRADVKSASIKVNKKINAAGKVSKQTKFKVRGSRHLYTLIVADEDKAKKLQQALPSTLEVTQI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.74
3	0.73
4	0.7
5	0.63
6	0.55
7	0.45
8	0.36
9	0.3
10	0.31
11	0.33
12	0.34
13	0.34
14	0.34
15	0.4
16	0.42
17	0.4
18	0.38
19	0.33
20	0.27
21	0.25
22	0.25
23	0.19
24	0.17
25	0.15
26	0.13
27	0.13
28	0.1
29	0.09
30	0.07
31	0.06
32	0.05
33	0.05
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.07
39	0.07
40	0.08
41	0.07
42	0.05
43	0.07
44	0.07
45	0.08
46	0.11
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.14
52	0.15
53	0.14
54	0.11
55	0.13
56	0.16
57	0.18
58	0.18
59	0.19
60	0.2
61	0.21
62	0.22
63	0.24
64	0.23
65	0.24
66	0.33
67	0.36
68	0.4
69	0.42
70	0.47
71	0.44
72	0.43
73	0.47
74	0.44
75	0.42
76	0.39
77	0.4
78	0.35
79	0.39
80	0.41
81	0.39
82	0.41
83	0.4
84	0.4
85	0.41
86	0.42
87	0.41
88	0.44
89	0.48
90	0.49
91	0.52
92	0.53
93	0.48
94	0.48
95	0.45
96	0.4
97	0.32
98	0.26
99	0.17
100	0.18
101	0.18
102	0.16
103	0.16
104	0.15
105	0.16
106	0.16
107	0.16
108	0.14
109	0.15
110	0.15
111	0.18
112	0.19
113	0.19
114	0.17
115	0.19
116	0.19
117	0.19
118	0.21
119	0.19
120	0.18
121	0.18
122	0.19
123	0.18
124	0.21
125	0.19
126	0.17
127	0.18
128	0.17
129	0.15
130	0.15
131	0.22
132	0.2
133	0.24
134	0.25
135	0.25
136	0.25
137	0.26
138	0.29
139	0.3
140	0.3
141	0.26
142	0.29
143	0.32
144	0.32
145	0.32
146	0.31
147	0.24
148	0.26
149	0.26
150	0.27
151	0.34
152	0.37
153	0.41
154	0.46
155	0.48
156	0.51
157	0.57
158	0.63
159	0.6
160	0.63
161	0.64
162	0.63
163	0.64
164	0.65
165	0.65
166	0.63
167	0.6
168	0.6
169	0.59
170	0.57
171	0.57
172	0.6
173	0.6
174	0.63
175	0.68
176	0.71
177	0.71
178	0.76
179	0.81
180	0.8
181	0.82
182	0.81
183	0.83
184	0.82
185	0.85
186	0.86
187	0.81
188	0.77
189	0.71
190	0.66
191	0.6
192	0.52
193	0.43
194	0.37
195	0.33
196	0.28
197	0.26
198	0.28
199	0.27
200	0.28
201	0.31
202	0.31
203	0.31
204	0.32
205	0.33
206	0.26
207	0.22
208	0.2
209	0.18
210	0.18
211	0.17
212	0.15
213	0.11
214	0.1
215	0.08
216	0.12
217	0.11
218	0.08
219	0.1
220	0.12
221	0.12
222	0.17
223	0.18
224	0.17
225	0.2
226	0.21
227	0.2
228	0.24
229	0.29
230	0.27
231	0.27
232	0.3
233	0.29
234	0.3
235	0.31
236	0.28
237	0.26
238	0.3
239	0.34
240	0.28
241	0.28
242	0.27
243	0.27
244	0.29
245	0.28
246	0.24
247	0.2
248	0.2
249	0.19
250	0.18
251	0.16
252	0.12
253	0.1
254	0.07
255	0.08
256	0.06
257	0.05
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.07
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.09
267	0.12
268	0.15
269	0.16
270	0.15
271	0.16
272	0.18
273	0.25
274	0.34
275	0.41
276	0.44
277	0.5
278	0.6
279	0.63
280	0.64
281	0.65
282	0.59
283	0.58
284	0.58
285	0.57
286	0.55
287	0.53
288	0.53
289	0.48
290	0.46
291	0.38
292	0.31
293	0.28
294	0.21
295	0.19
296	0.17
297	0.14
298	0.12
299	0.13
300	0.11
301	0.11
302	0.1
303	0.12
304	0.16
305	0.17
306	0.17
307	0.19
308	0.2
309	0.22
310	0.28
311	0.31
312	0.35
313	0.4
314	0.48
315	0.53
316	0.6
317	0.59
318	0.56
319	0.59
320	0.55
321	0.54
322	0.5
323	0.44
324	0.39
325	0.39
326	0.35
327	0.25
328	0.21
329	0.15
330	0.16
331	0.14
332	0.12
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.15
338	0.11
339	0.16
340	0.23
341	0.3
342	0.33
343	0.38
344	0.47
345	0.52
346	0.51
347	0.55
348	0.58
349	0.54
350	0.62
351	0.63
352	0.62
353	0.66
354	0.67
355	0.64
356	0.61
357	0.57
358	0.47
359	0.42
360	0.34
361	0.28
362	0.27
363	0.24
364	0.18
365	0.18
366	0.17
367	0.16
368	0.16
369	0.13
370	0.13
371	0.12
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.11
384	0.11
385	0.14
386	0.17
387	0.17
388	0.21
389	0.25
390	0.26
391	0.29
392	0.31
393	0.35
394	0.43
395	0.47
396	0.47
397	0.52
398	0.55
399	0.48
400	0.49
401	0.44
402	0.4
403	0.44
404	0.42
405	0.4
406	0.44
407	0.49
408	0.53
409	0.61
410	0.57
411	0.52
412	0.55
413	0.56
414	0.56
415	0.56
416	0.56
417	0.54
418	0.61
419	0.64
420	0.62
421	0.61
422	0.6
423	0.65
424	0.66
425	0.68
426	0.69
427	0.7
428	0.75
429	0.78
430	0.76
431	0.7
432	0.66
433	0.58
434	0.49
435	0.43
436	0.33
437	0.26
438	0.21
439	0.18
440	0.21
441	0.22
442	0.23
443	0.23
444	0.23
445	0.26
446	0.33
447	0.37
448	0.38
449	0.45
450	0.47
451	0.49
452	0.49
453	0.47

A0A1E4S542

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer