FuNGI

C1GL70

Protein Details

Accession

C1GL70

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	MAVFKDVKKKPSKTAKSSASPAS	Hydrophilic
270-290	SSSVSDKKKSKKKSIPKSATA	Hydrophilic
363-392	SSSSSKSSVGKKKPKEAKKQTNSNAKSKSK	Hydrophilic
465-493	LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-285	KKKSKKKSIP
372-390	GKKKPKEAKKQTNSNAKSK
470-486	GKGFTKEKNKKKRGSYR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
KEGG	pbn:PADG_07856 -
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MAVFKDVKKKPSKTAKSSASPASNSTGIKSTTGKGKNVKDTSASERPALSPALLAMITSFLTAYGFDKTSNVFGEELKESKMIRKAGNKYSDSTTANRPLLVELFENWNRNLRKQGPEQKVVAKQSSEEDSDGSNYSDSDSSSSASSDSDVSMEDASSSSTSSSSSSDDDSSDEEEEEGEKGQEDNKATAPKSKTLKRKQDDASSSSSSGSDSDEGRPPAKRTKLPTNGKGKLKSNASDKSSSSDSSSESTSESSSGSSSDSDSDSDSDSSSVSDKKKSKKKSIPKSATAADVAAIAAKIPLPESEESDSANSSSSSSSSFSSSGSSDGEDMSADRKPSADSSATLGGNSSSSDSSDFSSSSSSSSSKSSVGKKKPKEAKKQTNSNAKSKSKFSSPSALKNPPSSTSTSNAKSTPLSTPAVSTPPVKHSGAKPTPLALASMKPHDHHPSNAYVPYAYAERAHKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGKSFKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.82
3	0.79
4	0.8
5	0.78
6	0.73
7	0.64
8	0.58
9	0.53
10	0.47
11	0.4
12	0.36
13	0.33
14	0.27
15	0.28
16	0.28
17	0.27
18	0.32
19	0.37
20	0.41
21	0.45
22	0.52
23	0.6
24	0.61
25	0.6
26	0.55
27	0.55
28	0.57
29	0.57
30	0.51
31	0.43
32	0.41
33	0.39
34	0.37
35	0.33
36	0.24
37	0.16
38	0.14
39	0.14
40	0.12
41	0.11
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.07
46	0.07
47	0.05
48	0.05
49	0.06
50	0.07
51	0.1
52	0.1
53	0.11
54	0.12
55	0.13
56	0.16
57	0.16
58	0.17
59	0.14
60	0.14
61	0.18
62	0.2
63	0.2
64	0.19
65	0.2
66	0.19
67	0.24
68	0.3
69	0.31
70	0.34
71	0.42
72	0.48
73	0.54
74	0.62
75	0.59
76	0.56
77	0.56
78	0.56
79	0.5
80	0.46
81	0.44
82	0.43
83	0.42
84	0.38
85	0.34
86	0.3
87	0.28
88	0.26
89	0.2
90	0.14
91	0.2
92	0.23
93	0.25
94	0.24
95	0.31
96	0.31
97	0.32
98	0.39
99	0.38
100	0.42
101	0.5
102	0.6
103	0.59
104	0.63
105	0.64
106	0.63
107	0.64
108	0.61
109	0.53
110	0.44
111	0.37
112	0.35
113	0.35
114	0.29
115	0.23
116	0.19
117	0.17
118	0.18
119	0.18
120	0.15
121	0.12
122	0.1
123	0.11
124	0.11
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.06
143	0.07
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.12
154	0.12
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.14
159	0.13
160	0.12
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.08
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.2
175	0.2
176	0.26
177	0.27
178	0.3
179	0.36
180	0.43
181	0.5
182	0.56
183	0.66
184	0.64
185	0.7
186	0.69
187	0.71
188	0.68
189	0.61
190	0.56
191	0.48
192	0.45
193	0.36
194	0.31
195	0.22
196	0.18
197	0.15
198	0.11
199	0.1
200	0.11
201	0.15
202	0.16
203	0.18
204	0.19
205	0.21
206	0.27
207	0.31
208	0.33
209	0.35
210	0.45
211	0.53
212	0.59
213	0.64
214	0.67
215	0.69
216	0.7
217	0.69
218	0.62
219	0.57
220	0.53
221	0.48
222	0.45
223	0.43
224	0.41
225	0.39
226	0.36
227	0.34
228	0.32
229	0.28
230	0.23
231	0.19
232	0.16
233	0.15
234	0.15
235	0.12
236	0.11
237	0.11
238	0.09
239	0.09
240	0.08
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.12
260	0.12
261	0.19
262	0.24
263	0.34
264	0.42
265	0.5
266	0.59
267	0.65
268	0.74
269	0.79
270	0.84
271	0.83
272	0.8
273	0.77
274	0.68
275	0.59
276	0.49
277	0.38
278	0.26
279	0.18
280	0.13
281	0.08
282	0.06
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.07
290	0.08
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.14
296	0.14
297	0.12
298	0.12
299	0.09
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.11
307	0.11
308	0.1
309	0.12
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.11
326	0.14
327	0.14
328	0.13
329	0.16
330	0.21
331	0.2
332	0.19
333	0.18
334	0.15
335	0.13
336	0.13
337	0.11
338	0.06
339	0.07
340	0.08
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.11
345	0.1
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.13
353	0.15
354	0.16
355	0.22
356	0.3
357	0.38
358	0.47
359	0.56
360	0.61
361	0.7
362	0.77
363	0.81
364	0.83
365	0.85
366	0.86
367	0.86
368	0.9
369	0.89
370	0.9
371	0.85
372	0.83
373	0.81
374	0.77
375	0.71
376	0.65
377	0.61
378	0.57
379	0.57
380	0.52
381	0.53
382	0.5
383	0.56
384	0.59
385	0.62
386	0.58
387	0.58
388	0.56
389	0.49
390	0.47
391	0.42
392	0.37
393	0.35
394	0.39
395	0.37
396	0.38
397	0.35
398	0.34
399	0.32
400	0.31
401	0.3
402	0.26
403	0.25
404	0.22
405	0.24
406	0.24
407	0.26
408	0.25
409	0.25
410	0.24
411	0.26
412	0.31
413	0.3
414	0.32
415	0.34
416	0.43
417	0.45
418	0.47
419	0.43
420	0.4
421	0.42
422	0.37
423	0.35
424	0.26
425	0.25
426	0.24
427	0.29
428	0.29
429	0.27
430	0.32
431	0.38
432	0.4
433	0.4
434	0.4
435	0.4
436	0.42
437	0.43
438	0.39
439	0.31
440	0.28
441	0.25
442	0.23
443	0.18
444	0.18
445	0.2
446	0.22
447	0.25
448	0.25
449	0.24
450	0.26
451	0.3
452	0.33
453	0.39
454	0.37
455	0.37
456	0.42
457	0.42
458	0.47
459	0.5
460	0.52
461	0.54
462	0.63
463	0.71
464	0.77
465	0.85
466	0.87
467	0.9
468	0.91
469	0.9
470	0.9
471	0.89
472	0.89
473	0.88
474	0.82
475	0.72
476	0.62
477	0.61
478	0.54
479	0.47
480	0.37
481	0.3
482	0.28

C1GL70

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer