Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E4S5Q1

Protein Details
Accession A0A1E4S5Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
621-649DTSENKPVKKQHHQKKRKYKAKNVDPTSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
626-642KPVKKQHHQKKRKYKAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR030391  MeTrfase_TrmA_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR002792  TRAM_dom  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01938  TRAM  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS50926  TRAM  
PS01230  TRMA_1  
PS01231  TRMA_2  
Amino Acid Sequences MAQLSLADVDSVVELPTDSFKASITPDKTFLNDNPDWLAARKLVDQSPHEFAPWNSLVTITEQLLTKYPTPSQAVKDVITSTFDELLTRFPLFFGYWKKYTSLQYQMNGLDESIKVLSRSLVAFPSSVDLWVDYLTILVSNCQDKSKIKLEFETAISNVGHHFLSHEVWDKYIEWEQGQNNSLEVIKILLRVIRIPLHQYSRYYQSFNTMRQTISAQQLQKLDKELESATGVDEYYNTIFLQTQEYVSAIWPFESQIKQPYFNITPLSDEEVDIWDSYLNLLIQRHSTDASPLNKDQTVATFERAIVPTALASKFWFKYLSWYITNYSDEFEPLNNIYRKILDVFLPVSMTLKLRLNYASFLEFHNRDTQTVAEVYLGIMKHAHSKNDYEPVSRTENDFTKVAKWLDSVVTVFYKPQTASDIGIKRFATLLNTRTIVIPIIELININWIHLKNDSNVRKYLAQFSLAEDLFGSSPFWTLKYKYFKYYRDYQELEQTVAFIKDKSSLPLTVINAILLDYTDVLAQQVPESLSTQSAYETINSLEYFVSNPFSSRYEQDEQLKKRLWQESGHAAVSIQKPFIVNSVLSKNCGTTMSVTEPLKRAASPVRAGEGAITPVHKKQDTSENKPVKKQHHQKKRKYKAKNVDPTSPSGVLQFEIEQILAEREITESDIQNDISGVLNDESIAAQYHRNVTDVEIIALTSNAEGLALIANPLDPKKQQVVIVPFAITGDVCEIRVFKTHPNYVESDLLKILKPSPERQDELIRCRYFGKCSGCQYQELPYATQLEYKRRTVENAYAHLAPDLLKQGKLPEIGETVASPKQFGYRTKLTPHFDLPRKKTLTYRPTLGFGSKGKPTWRDTDGGDSGVVDIEECIIGTPIINVGMANERRQFEQDWKKYKKGATILLREHTRVATESCNTIEFNNEQEGSRDEAGNVSVIVDKNGDDVLVKSCVTNTRQIVTEYINGFTFEFCAGEFFQNNNSILPIVTEYVCSNLQIPRKEGDPLYLVDAYCGSGLFSITASKGVDRVVGVDVSKESIKFATKNAERNGVKNATFIDGQAEKIFGSIDTPSDLTSVIIDPSRKGCDEVFLNQLSDYRPARVVYVSCNVHSQARDIQWFLNSTKNGGEYKVESIRGFDFFPQTHHVEGVAVLSRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.13
9 0.17
10 0.25
11 0.27
12 0.29
13 0.32
14 0.34
15 0.36
16 0.38
17 0.37
18 0.37
19 0.34
20 0.33
21 0.32
22 0.32
23 0.32
24 0.28
25 0.28
26 0.21
27 0.23
28 0.24
29 0.26
30 0.28
31 0.33
32 0.35
33 0.38
34 0.41
35 0.4
36 0.37
37 0.34
38 0.31
39 0.33
40 0.31
41 0.26
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.21
46 0.24
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.18
51 0.2
52 0.23
53 0.23
54 0.23
55 0.25
56 0.28
57 0.32
58 0.36
59 0.37
60 0.4
61 0.41
62 0.38
63 0.38
64 0.35
65 0.3
66 0.29
67 0.26
68 0.21
69 0.2
70 0.19
71 0.18
72 0.16
73 0.18
74 0.19
75 0.18
76 0.15
77 0.13
78 0.15
79 0.15
80 0.21
81 0.25
82 0.29
83 0.31
84 0.33
85 0.35
86 0.38
87 0.43
88 0.45
89 0.47
90 0.46
91 0.45
92 0.49
93 0.48
94 0.45
95 0.4
96 0.32
97 0.25
98 0.18
99 0.18
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.17
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.16
130 0.19
131 0.21
132 0.27
133 0.34
134 0.38
135 0.38
136 0.41
137 0.43
138 0.44
139 0.44
140 0.41
141 0.33
142 0.29
143 0.26
144 0.23
145 0.19
146 0.16
147 0.14
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.14
153 0.2
154 0.18
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.23
159 0.26
160 0.25
161 0.2
162 0.25
163 0.27
164 0.31
165 0.31
166 0.28
167 0.23
168 0.22
169 0.21
170 0.16
171 0.13
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.18
181 0.19
182 0.22
183 0.27
184 0.32
185 0.35
186 0.37
187 0.38
188 0.42
189 0.43
190 0.41
191 0.36
192 0.39
193 0.41
194 0.41
195 0.44
196 0.38
197 0.35
198 0.34
199 0.37
200 0.33
201 0.34
202 0.36
203 0.31
204 0.33
205 0.39
206 0.39
207 0.37
208 0.36
209 0.32
210 0.26
211 0.26
212 0.23
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.14
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.14
241 0.16
242 0.17
243 0.23
244 0.26
245 0.28
246 0.28
247 0.34
248 0.32
249 0.32
250 0.33
251 0.25
252 0.25
253 0.25
254 0.29
255 0.22
256 0.2
257 0.18
258 0.17
259 0.18
260 0.15
261 0.13
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.15
276 0.21
277 0.24
278 0.28
279 0.28
280 0.31
281 0.3
282 0.3
283 0.27
284 0.23
285 0.24
286 0.21
287 0.21
288 0.19
289 0.18
290 0.22
291 0.22
292 0.2
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.15
297 0.15
298 0.11
299 0.12
300 0.16
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.15
305 0.23
306 0.28
307 0.32
308 0.28
309 0.3
310 0.31
311 0.32
312 0.34
313 0.27
314 0.22
315 0.17
316 0.17
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.19
322 0.19
323 0.2
324 0.2
325 0.2
326 0.2
327 0.2
328 0.2
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.18
346 0.17
347 0.14
348 0.16
349 0.21
350 0.2
351 0.2
352 0.26
353 0.25
354 0.23
355 0.24
356 0.22
357 0.18
358 0.18
359 0.17
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.09
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.16
369 0.18
370 0.2
371 0.19
372 0.23
373 0.26
374 0.34
375 0.34
376 0.28
377 0.28
378 0.3
379 0.33
380 0.3
381 0.29
382 0.25
383 0.26
384 0.27
385 0.26
386 0.23
387 0.2
388 0.24
389 0.22
390 0.19
391 0.17
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.11
397 0.12
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.13
405 0.13
406 0.14
407 0.21
408 0.26
409 0.24
410 0.28
411 0.27
412 0.24
413 0.24
414 0.23
415 0.19
416 0.18
417 0.19
418 0.18
419 0.19
420 0.19
421 0.19
422 0.19
423 0.15
424 0.12
425 0.1
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.14
438 0.15
439 0.13
440 0.23
441 0.28
442 0.29
443 0.3
444 0.32
445 0.33
446 0.34
447 0.37
448 0.29
449 0.26
450 0.23
451 0.24
452 0.26
453 0.22
454 0.21
455 0.14
456 0.14
457 0.12
458 0.11
459 0.1
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.09
465 0.11
466 0.18
467 0.26
468 0.29
469 0.35
470 0.41
471 0.44
472 0.48
473 0.55
474 0.54
475 0.53
476 0.54
477 0.47
478 0.49
479 0.45
480 0.41
481 0.31
482 0.25
483 0.19
484 0.17
485 0.16
486 0.08
487 0.07
488 0.1
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.13
493 0.14
494 0.18
495 0.18
496 0.16
497 0.16
498 0.13
499 0.11
500 0.11
501 0.09
502 0.06
503 0.05
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.07
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.1
538 0.12
539 0.13
540 0.18
541 0.2
542 0.23
543 0.3
544 0.37
545 0.38
546 0.42
547 0.42
548 0.39
549 0.41
550 0.42
551 0.37
552 0.3
553 0.31
554 0.32
555 0.32
556 0.3
557 0.24
558 0.2
559 0.23
560 0.23
561 0.21
562 0.14
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.13
567 0.1
568 0.07
569 0.09
570 0.15
571 0.14
572 0.16
573 0.16
574 0.15
575 0.14
576 0.14
577 0.12
578 0.09
579 0.11
580 0.12
581 0.17
582 0.17
583 0.18
584 0.19
585 0.19
586 0.19
587 0.16
588 0.15
589 0.15
590 0.18
591 0.19
592 0.18
593 0.19
594 0.18
595 0.18
596 0.17
597 0.13
598 0.11
599 0.09
600 0.09
601 0.08
602 0.1
603 0.13
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.24
608 0.31
609 0.39
610 0.47
611 0.53
612 0.55
613 0.6
614 0.64
615 0.61
616 0.64
617 0.65
618 0.65
619 0.68
620 0.77
621 0.82
622 0.87
623 0.91
624 0.9
625 0.89
626 0.89
627 0.89
628 0.89
629 0.88
630 0.82
631 0.79
632 0.71
633 0.65
634 0.58
635 0.48
636 0.37
637 0.28
638 0.23
639 0.15
640 0.14
641 0.11
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.04
651 0.04
652 0.05
653 0.06
654 0.07
655 0.07
656 0.09
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.05
673 0.06
674 0.07
675 0.1
676 0.1
677 0.11
678 0.11
679 0.12
680 0.16
681 0.15
682 0.15
683 0.11
684 0.11
685 0.1
686 0.1
687 0.09
688 0.04
689 0.03
690 0.03
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.03
698 0.04
699 0.05
700 0.05
701 0.07
702 0.07
703 0.1
704 0.13
705 0.16
706 0.17
707 0.22
708 0.27
709 0.28
710 0.28
711 0.25
712 0.22
713 0.2
714 0.18
715 0.12
716 0.07
717 0.07
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.11
724 0.12
725 0.15
726 0.22
727 0.25
728 0.27
729 0.3
730 0.31
731 0.32
732 0.35
733 0.31
734 0.25
735 0.23
736 0.22
737 0.19
738 0.18
739 0.17
740 0.17
741 0.19
742 0.23
743 0.29
744 0.33
745 0.35
746 0.38
747 0.45
748 0.45
749 0.49
750 0.53
751 0.46
752 0.41
753 0.42
754 0.41
755 0.34
756 0.36
757 0.37
758 0.33
759 0.38
760 0.45
761 0.43
762 0.43
763 0.41
764 0.39
765 0.39
766 0.35
767 0.3
768 0.24
769 0.25
770 0.23
771 0.28
772 0.25
773 0.28
774 0.3
775 0.32
776 0.34
777 0.33
778 0.36
779 0.34
780 0.39
781 0.36
782 0.36
783 0.37
784 0.33
785 0.32
786 0.29
787 0.25
788 0.18
789 0.14
790 0.16
791 0.14
792 0.14
793 0.14
794 0.16
795 0.18
796 0.19
797 0.18
798 0.14
799 0.15
800 0.15
801 0.15
802 0.13
803 0.13
804 0.14
805 0.14
806 0.12
807 0.11
808 0.15
809 0.18
810 0.21
811 0.26
812 0.3
813 0.34
814 0.41
815 0.49
816 0.49
817 0.49
818 0.52
819 0.54
820 0.55
821 0.61
822 0.59
823 0.61
824 0.6
825 0.59
826 0.59
827 0.6
828 0.61
829 0.56
830 0.57
831 0.49
832 0.49
833 0.49
834 0.43
835 0.37
836 0.31
837 0.3
838 0.27
839 0.28
840 0.29
841 0.32
842 0.35
843 0.37
844 0.36
845 0.35
846 0.33
847 0.37
848 0.35
849 0.31
850 0.27
851 0.21
852 0.18
853 0.16
854 0.14
855 0.06
856 0.05
857 0.04
858 0.04
859 0.04
860 0.04
861 0.04
862 0.04
863 0.04
864 0.04
865 0.04
866 0.05
867 0.05
868 0.05
869 0.05
870 0.13
871 0.15
872 0.18
873 0.22
874 0.23
875 0.24
876 0.27
877 0.28
878 0.31
879 0.4
880 0.46
881 0.53
882 0.58
883 0.61
884 0.64
885 0.65
886 0.63
887 0.58
888 0.58
889 0.56
890 0.59
891 0.59
892 0.61
893 0.6
894 0.53
895 0.48
896 0.39
897 0.32
898 0.25
899 0.22
900 0.2
901 0.19
902 0.2
903 0.2
904 0.21
905 0.2
906 0.18
907 0.19
908 0.16
909 0.17
910 0.19
911 0.19
912 0.17
913 0.19
914 0.21
915 0.21
916 0.22
917 0.2
918 0.16
919 0.16
920 0.16
921 0.15
922 0.12
923 0.09
924 0.1
925 0.1
926 0.11
927 0.1
928 0.1
929 0.1
930 0.1
931 0.1
932 0.07
933 0.08
934 0.1
935 0.12
936 0.12
937 0.11
938 0.13
939 0.19
940 0.21
941 0.27
942 0.26
943 0.27
944 0.29
945 0.3
946 0.31
947 0.28
948 0.32
949 0.25
950 0.24
951 0.22
952 0.21
953 0.2
954 0.18
955 0.16
956 0.1
957 0.09
958 0.07
959 0.09
960 0.1
961 0.13
962 0.14
963 0.14
964 0.17
965 0.21
966 0.22
967 0.2
968 0.19
969 0.17
970 0.15
971 0.15
972 0.13
973 0.11
974 0.1
975 0.11
976 0.11
977 0.14
978 0.14
979 0.13
980 0.14
981 0.17
982 0.24
983 0.26
984 0.29
985 0.27
986 0.29
987 0.33
988 0.31
989 0.3
990 0.26
991 0.24
992 0.26
993 0.26
994 0.24
995 0.2
996 0.2
997 0.17
998 0.14
999 0.13
1000 0.08
1001 0.06
1002 0.07
1003 0.06
1004 0.07
1005 0.07
1006 0.08
1007 0.1
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.13
1013 0.11
1014 0.13
1015 0.13
1016 0.13
1017 0.13
1018 0.14
1019 0.14
1020 0.15
1021 0.16
1022 0.14
1023 0.14
1024 0.15
1025 0.19
1026 0.19
1027 0.21
1028 0.29
1029 0.33
1030 0.42
1031 0.44
1032 0.52
1033 0.49
1034 0.51
1035 0.56
1036 0.51
1037 0.46
1038 0.4
1039 0.37
1040 0.31
1041 0.29
1042 0.27
1043 0.25
1044 0.2
1045 0.21
1046 0.2
1047 0.19
1048 0.15
1049 0.15
1050 0.15
1051 0.09
1052 0.09
1053 0.09
1054 0.09
1055 0.11
1056 0.11
1057 0.12
1058 0.12
1059 0.12
1060 0.1
1061 0.11
1062 0.11
1063 0.1
1064 0.13
1065 0.14
1066 0.16
1067 0.2
1068 0.24
1069 0.23
1070 0.25
1071 0.24
1072 0.27
1073 0.3
1074 0.32
1075 0.34
1076 0.31
1077 0.31
1078 0.29
1079 0.31
1080 0.26
1081 0.29
1082 0.26
1083 0.23
1084 0.24
1085 0.24
1086 0.26
1087 0.28
1088 0.27
1089 0.26
1090 0.33
1091 0.33
1092 0.31
1093 0.34
1094 0.34
1095 0.35
1096 0.34
1097 0.32
1098 0.31
1099 0.34
1100 0.36
1101 0.35
1102 0.35
1103 0.34
1104 0.37
1105 0.35
1106 0.35
1107 0.3
1108 0.28
1109 0.29
1110 0.31
1111 0.29
1112 0.27
1113 0.3
1114 0.25
1115 0.31
1116 0.34
1117 0.35
1118 0.31
1119 0.33
1120 0.33
1121 0.31
1122 0.3
1123 0.26
1124 0.27
1125 0.24
1126 0.28
1127 0.31
1128 0.31
1129 0.31
1130 0.29
1131 0.26
1132 0.21
1133 0.2
1134 0.2