Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4S5Q1

Protein Details
Accession A0A1E4S5Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
621-649DTSENKPVKKQHHQKKRKYKAKNVDPTSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
626-642KPVKKQHHQKKRKYKAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR030391  MeTrfase_TrmA_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR002792  TRAM_dom  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01938  TRAM  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS50926  TRAM  
PS01230  TRMA_1  
PS01231  TRMA_2  
Amino Acid Sequences MAQLSLADVDSVVELPTDSFKASITPDKTFLNDNPDWLAARKLVDQSPHEFAPWNSLVTITEQLLTKYPTPSQAVKDVITSTFDELLTRFPLFFGYWKKYTSLQYQMNGLDESIKVLSRSLVAFPSSVDLWVDYLTILVSNCQDKSKIKLEFETAISNVGHHFLSHEVWDKYIEWEQGQNNSLEVIKILLRVIRIPLHQYSRYYQSFNTMRQTISAQQLQKLDKELESATGVDEYYNTIFLQTQEYVSAIWPFESQIKQPYFNITPLSDEEVDIWDSYLNLLIQRHSTDASPLNKDQTVATFERAIVPTALASKFWFKYLSWYITNYSDEFEPLNNIYRKILDVFLPVSMTLKLRLNYASFLEFHNRDTQTVAEVYLGIMKHAHSKNDYEPVSRTENDFTKVAKWLDSVVTVFYKPQTASDIGIKRFATLLNTRTIVIPIIELININWIHLKNDSNVRKYLAQFSLAEDLFGSSPFWTLKYKYFKYYRDYQELEQTVAFIKDKSSLPLTVINAILLDYTDVLAQQVPESLSTQSAYETINSLEYFVSNPFSSRYEQDEQLKKRLWQESGHAAVSIQKPFIVNSVLSKNCGTTMSVTEPLKRAASPVRAGEGAITPVHKKQDTSENKPVKKQHHQKKRKYKAKNVDPTSPSGVLQFEIEQILAEREITESDIQNDISGVLNDESIAAQYHRNVTDVEIIALTSNAEGLALIANPLDPKKQQVVIVPFAITGDVCEIRVFKTHPNYVESDLLKILKPSPERQDELIRCRYFGKCSGCQYQELPYATQLEYKRRTVENAYAHLAPDLLKQGKLPEIGETVASPKQFGYRTKLTPHFDLPRKKTLTYRPTLGFGSKGKPTWRDTDGGDSGVVDIEECIIGTPIINVGMANERRQFEQDWKKYKKGATILLREHTRVATESCNTIEFNNEQEGSRDEAGNVSVIVDKNGDDVLVKSCVTNTRQIVTEYINGFTFEFCAGEFFQNNNSILPIVTEYVCSNLQIPRKEGDPLYLVDAYCGSGLFSITASKGVDRVVGVDVSKESIKFATKNAERNGVKNATFIDGQAEKIFGSIDTPSDLTSVIIDPSRKGCDEVFLNQLSDYRPARVVYVSCNVHSQARDIQWFLNSTKNGGEYKVESIRGFDFFPQTHHVEGVAVLSRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.13
9 0.17
10 0.25
11 0.27
12 0.29
13 0.32
14 0.34
15 0.36
16 0.38
17 0.37
18 0.37
19 0.34
20 0.33
21 0.32
22 0.32
23 0.32
24 0.28
25 0.28
26 0.21
27 0.23
28 0.24
29 0.26
30 0.28
31 0.33
32 0.35
33 0.38
34 0.41
35 0.4
36 0.37
37 0.34
38 0.31
39 0.33
40 0.31
41 0.26
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.21
46 0.24
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.18
51 0.2
52 0.23
53 0.23
54 0.23
55 0.25
56 0.28
57 0.32
58 0.36
59 0.37
60 0.4
61 0.41
62 0.38
63 0.38
64 0.35
65 0.3
66 0.29
67 0.26
68 0.21
69 0.2
70 0.19
71 0.18
72 0.16
73 0.18
74 0.19
75 0.18
76 0.15
77 0.13
78 0.15
79 0.15
80 0.21
81 0.25
82 0.29
83 0.31
84 0.33
85 0.35
86 0.38
87 0.43
88 0.45
89 0.47
90 0.46
91 0.45
92 0.49
93 0.48
94 0.45
95 0.4
96 0.32
97 0.25
98 0.18
99 0.18
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.17
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.16
130 0.19
131 0.21
132 0.27
133 0.34
134 0.38
135 0.38
136 0.41
137 0.43
138 0.44
139 0.44
140 0.41
141 0.33
142 0.29
143 0.26
144 0.23
145 0.19
146 0.16
147 0.14
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.14
153 0.2
154 0.18
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.23
159 0.26
160 0.25
161 0.2
162 0.25
163 0.27
164 0.31
165 0.31
166 0.28
167 0.23
168 0.22
169 0.21
170 0.16
171 0.13
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.18
181 0.19
182 0.22
183 0.27
184 0.32
185 0.35
186 0.37
187 0.38
188 0.42
189 0.43
190 0.41
191 0.36
192 0.39
193 0.41
194 0.41
195 0.44
196 0.38
197 0.35
198 0.34
199 0.37
200 0.33
201 0.34
202 0.36
203 0.31
204 0.33
205 0.39
206 0.39
207 0.37
208 0.36
209 0.32
210 0.26
211 0.26
212 0.23
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.14
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.14
241 0.16
242 0.17
243 0.23
244 0.26
245 0.28
246 0.28
247 0.34
248 0.32
249 0.32
250 0.33
251 0.25
252 0.25
253 0.25
254 0.29
255 0.22
256 0.2
257 0.18
258 0.17
259 0.18
260 0.15
261 0.13
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.15
276 0.21
277 0.24
278 0.28
279 0.28
280 0.31
281 0.3
282 0.3
283 0.27
284 0.23
285 0.24
286 0.21
287 0.21
288 0.19
289 0.18
290 0.22
291 0.22
292 0.2
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.15
297 0.15
298 0.11
299 0.12
300 0.16
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.15
305 0.23
306 0.28
307 0.32
308 0.28
309 0.3
310 0.31
311 0.32
312 0.34
313 0.27
314 0.22
315 0.17
316 0.17
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.19
322 0.19
323 0.2
324 0.2
325 0.2
326 0.2
327 0.2
328 0.2
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.18
346 0.17
347 0.14
348 0.16
349 0.21
350 0.2
351 0.2
352 0.26
353 0.25
354 0.23
355 0.24
356 0.22
357 0.18
358 0.18
359 0.17
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.09
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.16
369 0.18
370 0.2
371 0.19
372 0.23
373 0.26
374 0.34
375 0.34
376 0.28
377 0.28
378 0.3
379 0.33
380 0.3
381 0.29
382 0.25
383 0.26
384 0.27
385 0.26
386 0.23
387 0.2
388 0.24
389 0.22
390 0.19
391 0.17
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.11
397 0.12
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.13
405 0.13
406 0.14
407 0.21
408 0.26
409 0.24
410 0.28
411 0.27
412 0.24
413 0.24
414 0.23
415 0.19
416 0.18
417 0.19
418 0.18
419 0.19
420 0.19
421 0.19
422 0.19
423 0.15
424 0.12
425 0.1
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.14
438 0.15
439 0.13
440 0.23
441 0.28
442 0.29
443 0.3
444 0.32
445 0.33
446 0.34
447 0.37
448 0.29
449 0.26
450 0.23
451 0.24
452 0.26
453 0.22
454 0.21
455 0.14
456 0.14
457 0.12
458 0.11
459 0.1
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.09
465 0.11
466 0.18
467 0.26
468 0.29
469 0.35
470 0.41
471 0.44
472 0.48
473 0.55
474 0.54
475 0.53
476 0.54
477 0.47
478 0.49
479 0.45
480 0.41
481 0.31
482 0.25
483 0.19
484 0.17
485 0.16
486 0.08
487 0.07
488 0.1
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.13
493 0.14
494 0.18
495 0.18
496 0.16
497 0.16
498 0.13
499 0.11
500 0.11
501 0.09
502 0.06
503 0.05
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.07
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.1
538 0.12
539 0.13
540 0.18
541 0.2
542 0.23
543 0.3
544 0.37
545 0.38
546 0.42
547 0.42
548 0.39
549 0.41
550 0.42
551 0.37
552 0.3
553 0.31
554 0.32
555 0.32
556 0.3
557 0.24
558 0.2
559 0.23
560 0.23
561 0.21
562 0.14
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.13
567 0.1
568 0.07
569 0.09
570 0.15
571 0.14
572 0.16
573 0.16
574 0.15
575 0.14
576 0.14
577 0.12
578 0.09
579 0.11
580 0.12
581 0.17
582 0.17
583 0.18
584 0.19
585 0.19
586 0.19
587 0.16
588 0.15
589 0.15
590 0.18
591 0.19
592 0.18
593 0.19
594 0.18
595 0.18
596 0.17
597 0.13
598 0.11
599 0.09
600 0.09
601 0.08
602 0.1
603 0.13
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.24
608 0.31
609 0.39
610 0.47
611 0.53
612 0.55
613 0.6
614 0.64
615 0.61
616 0.64
617 0.65
618 0.65
619 0.68
620 0.77
621 0.82
622 0.87
623 0.91
624 0.9
625 0.89
626 0.89
627 0.89
628 0.89
629 0.88
630 0.82
631 0.79
632 0.71
633 0.65
634 0.58
635 0.48
636 0.37
637 0.28
638 0.23
639 0.15
640 0.14
641 0.11
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.04
651 0.04
652 0.05
653 0.06
654 0.07
655 0.07
656 0.09
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.05
673 0.06
674 0.07
675 0.1
676 0.1
677 0.11
678 0.11
679 0.12
680 0.16
681 0.15
682 0.15
683 0.11
684 0.11
685 0.1
686 0.1
687 0.09
688 0.04
689 0.03
690 0.03
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.03
698 0.04
699 0.05
700 0.05
701 0.07
702 0.07
703 0.1
704 0.13
705 0.16
706 0.17
707 0.22
708 0.27
709 0.28
710 0.28
711 0.25
712 0.22
713 0.2
714 0.18
715 0.12
716 0.07
717 0.07
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.11
724 0.12
725 0.15
726 0.22
727 0.25
728 0.27
729 0.3
730 0.31
731 0.32
732 0.35
733 0.31
734 0.25
735 0.23
736 0.22
737 0.19
738 0.18
739 0.17
740 0.17
741 0.19
742 0.23
743 0.29
744 0.33
745 0.35
746 0.38
747 0.45
748 0.45
749 0.49
750 0.53
751 0.46
752 0.41
753 0.42
754 0.41
755 0.34
756 0.36
757 0.37
758 0.33
759 0.38
760 0.45
761 0.43
762 0.43
763 0.41
764 0.39
765 0.39
766 0.35
767 0.3
768 0.24
769 0.25
770 0.23
771 0.28
772 0.25
773 0.28
774 0.3
775 0.32
776 0.34
777 0.33
778 0.36
779 0.34
780 0.39
781 0.36
782 0.36
783 0.37
784 0.33
785 0.32
786 0.29
787 0.25
788 0.18
789 0.14
790 0.16
791 0.14
792 0.14
793 0.14
794 0.16
795 0.18
796 0.19
797 0.18
798 0.14
799 0.15
800 0.15
801 0.15
802 0.13
803 0.13
804 0.14
805 0.14
806 0.12
807 0.11
808 0.15
809 0.18
810 0.21
811 0.26
812 0.3
813 0.34
814 0.41
815 0.49
816 0.49
817 0.49
818 0.52
819 0.54
820 0.55
821 0.61
822 0.59
823 0.61
824 0.6
825 0.59
826 0.59
827 0.6
828 0.61
829 0.56
830 0.57
831 0.49
832 0.49
833 0.49
834 0.43
835 0.37
836 0.31
837 0.3
838 0.27
839 0.28
840 0.29
841 0.32
842 0.35
843 0.37
844 0.36
845 0.35
846 0.33
847 0.37
848 0.35
849 0.31
850 0.27
851 0.21
852 0.18
853 0.16
854 0.14
855 0.06
856 0.05
857 0.04
858 0.04
859 0.04
860 0.04
861 0.04
862 0.04
863 0.04
864 0.04
865 0.04
866 0.05
867 0.05
868 0.05
869 0.05
870 0.13
871 0.15
872 0.18
873 0.22
874 0.23
875 0.24
876 0.27
877 0.28
878 0.31
879 0.4
880 0.46
881 0.53
882 0.58
883 0.61
884 0.64
885 0.65
886 0.63
887 0.58
888 0.58
889 0.56
890 0.59
891 0.59
892 0.61
893 0.6
894 0.53
895 0.48
896 0.39
897 0.32
898 0.25
899 0.22
900 0.2
901 0.19
902 0.2
903 0.2
904 0.21
905 0.2
906 0.18
907 0.19
908 0.16
909 0.17
910 0.19
911 0.19
912 0.17
913 0.19
914 0.21
915 0.21
916 0.22
917 0.2
918 0.16
919 0.16
920 0.16
921 0.15
922 0.12
923 0.09
924 0.1
925 0.1
926 0.11
927 0.1
928 0.1
929 0.1
930 0.1
931 0.1
932 0.07
933 0.08
934 0.1
935 0.12
936 0.12
937 0.11
938 0.13
939 0.19
940 0.21
941 0.27
942 0.26
943 0.27
944 0.29
945 0.3
946 0.31
947 0.28
948 0.32
949 0.25
950 0.24
951 0.22
952 0.21
953 0.2
954 0.18
955 0.16
956 0.1
957 0.09
958 0.07
959 0.09
960 0.1
961 0.13
962 0.14
963 0.14
964 0.17
965 0.21
966 0.22
967 0.2
968 0.19
969 0.17
970 0.15
971 0.15
972 0.13
973 0.11
974 0.1
975 0.11
976 0.11
977 0.14
978 0.14
979 0.13
980 0.14
981 0.17
982 0.24
983 0.26
984 0.29
985 0.27
986 0.29
987 0.33
988 0.31
989 0.3
990 0.26
991 0.24
992 0.26
993 0.26
994 0.24
995 0.2
996 0.2
997 0.17
998 0.14
999 0.13
1000 0.08
1001 0.06
1002 0.07
1003 0.06
1004 0.07
1005 0.07
1006 0.08
1007 0.1
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.13
1013 0.11
1014 0.13
1015 0.13
1016 0.13
1017 0.13
1018 0.14
1019 0.14
1020 0.15
1021 0.16
1022 0.14
1023 0.14
1024 0.15
1025 0.19
1026 0.19
1027 0.21
1028 0.29
1029 0.33
1030 0.42
1031 0.44
1032 0.52
1033 0.49
1034 0.51
1035 0.56
1036 0.51
1037 0.46
1038 0.4
1039 0.37
1040 0.31
1041 0.29
1042 0.27
1043 0.25
1044 0.2
1045 0.21
1046 0.2
1047 0.19
1048 0.15
1049 0.15
1050 0.15
1051 0.09
1052 0.09
1053 0.09
1054 0.09
1055 0.11
1056 0.11
1057 0.12
1058 0.12
1059 0.12
1060 0.1
1061 0.11
1062 0.11
1063 0.1
1064 0.13
1065 0.14
1066 0.16
1067 0.2
1068 0.24
1069 0.23
1070 0.25
1071 0.24
1072 0.27
1073 0.3
1074 0.32
1075 0.34
1076 0.31
1077 0.31
1078 0.29
1079 0.31
1080 0.26
1081 0.29
1082 0.26
1083 0.23
1084 0.24
1085 0.24
1086 0.26
1087 0.28
1088 0.27
1089 0.26
1090 0.33
1091 0.33
1092 0.31
1093 0.34
1094 0.34
1095 0.35
1096 0.34
1097 0.32
1098 0.31
1099 0.34
1100 0.36
1101 0.35
1102 0.35
1103 0.34
1104 0.37
1105 0.35
1106 0.35
1107 0.3
1108 0.28
1109 0.29
1110 0.31
1111 0.29
1112 0.27
1113 0.3
1114 0.25
1115 0.31
1116 0.34
1117 0.35
1118 0.31
1119 0.33
1120 0.33
1121 0.31
1122 0.3
1123 0.26
1124 0.27
1125 0.24
1126 0.28
1127 0.31
1128 0.31
1129 0.31
1130 0.29
1131 0.26
1132 0.21
1133 0.2
1134 0.2