Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4S3E3

Protein Details
Accession A0A1E4S3E3    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-84AAQARKQGDKTKVKTQEKRKRTKKKKKAPPTTSVKLVHydrophilic
204-231DLFAKDKPKPKAKDKKQAQKRAKGKAARBasic
255-282LEAPTKAVNPKKKPNRKGKAADKREPAVHydrophilic
288-319GEKPKPQSTGDKPKPKPKPKSAGKTTTKKTAKBasic
333-360DVTSNALKSKQKRPRKNPQTKNMTDSPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-76GKGPRAAQARKQGDKTKVKTQEKRKRTKKKKKAP
208-329KDKPKPKAKDKKQAQKRAKGKAARGKGEKGGKDGQSKLDTAKLGPAKLEAPTKAVNPKKKPNRKGKAADKREPAVKERKDGEKPKPQSTGDKPKPKPKPKSAGKTTTKKTAKAAGKTAGKAA
340-348KSKQKRPRK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 9, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MDAESVPSPGEQSRPSGADRCGLSPANGVCNGAQATASAGHNGKGPRAAQARKQGDKTKVKTQEKRKRTKKKKKAPPTTSVKLVVRLLPPELEPEEFWNKVKINRQQTDGCYYMKGKLFPTKPYKNVLYSRAYVSFKTAEYANAFVHSLKGLKFQDGEDDAGPMVMKSLFNKMPQDARREKSFEAMPEYLKFLQYQRGELEKLDLFAKDKPKPKAKDKKQAQKRAKGKAARGKGEKGGKDGQSKLDTAKLGPAKLEAPTKAVNPKKKPNRKGKAADKREPAVKERKDGEKPKPQSTGDKPKPKPKPKSAGKTTTKKTAKAAGKTAGKAAGDGDVTSNALKSKQKRPRKNPQTKNMTDSPQTPKISILKRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.3
3 0.33
4 0.33
5 0.35
6 0.35
7 0.33
8 0.33
9 0.32
10 0.29
11 0.29
12 0.29
13 0.29
14 0.27
15 0.26
16 0.21
17 0.24
18 0.23
19 0.18
20 0.16
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.15
25 0.14
26 0.15
27 0.15
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.22
32 0.22
33 0.26
34 0.34
35 0.38
36 0.41
37 0.51
38 0.59
39 0.61
40 0.67
41 0.67
42 0.69
43 0.75
44 0.73
45 0.73
46 0.74
47 0.78
48 0.8
49 0.83
50 0.84
51 0.84
52 0.9
53 0.91
54 0.91
55 0.93
56 0.95
57 0.95
58 0.95
59 0.96
60 0.96
61 0.96
62 0.94
63 0.92
64 0.9
65 0.85
66 0.8
67 0.75
68 0.66
69 0.59
70 0.52
71 0.46
72 0.38
73 0.34
74 0.29
75 0.24
76 0.22
77 0.21
78 0.21
79 0.18
80 0.16
81 0.19
82 0.23
83 0.23
84 0.23
85 0.24
86 0.24
87 0.28
88 0.36
89 0.39
90 0.45
91 0.47
92 0.52
93 0.52
94 0.54
95 0.55
96 0.49
97 0.41
98 0.33
99 0.31
100 0.31
101 0.29
102 0.28
103 0.24
104 0.3
105 0.32
106 0.38
107 0.46
108 0.48
109 0.49
110 0.53
111 0.54
112 0.52
113 0.54
114 0.51
115 0.46
116 0.41
117 0.4
118 0.4
119 0.37
120 0.31
121 0.29
122 0.25
123 0.21
124 0.2
125 0.18
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.08
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.18
143 0.18
144 0.2
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.1
156 0.12
157 0.14
158 0.16
159 0.17
160 0.24
161 0.27
162 0.34
163 0.36
164 0.37
165 0.39
166 0.41
167 0.39
168 0.36
169 0.34
170 0.28
171 0.27
172 0.25
173 0.22
174 0.19
175 0.22
176 0.19
177 0.17
178 0.16
179 0.12
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.21
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.11
193 0.15
194 0.21
195 0.24
196 0.31
197 0.37
198 0.45
199 0.52
200 0.61
201 0.69
202 0.72
203 0.77
204 0.8
205 0.84
206 0.86
207 0.9
208 0.88
209 0.87
210 0.85
211 0.84
212 0.82
213 0.77
214 0.75
215 0.73
216 0.72
217 0.69
218 0.65
219 0.59
220 0.57
221 0.58
222 0.51
223 0.47
224 0.45
225 0.42
226 0.42
227 0.41
228 0.39
229 0.34
230 0.34
231 0.3
232 0.28
233 0.24
234 0.2
235 0.24
236 0.22
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.17
241 0.19
242 0.23
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.22
247 0.29
248 0.35
249 0.42
250 0.46
251 0.56
252 0.64
253 0.73
254 0.8
255 0.82
256 0.86
257 0.87
258 0.89
259 0.9
260 0.9
261 0.89
262 0.88
263 0.83
264 0.78
265 0.74
266 0.67
267 0.62
268 0.61
269 0.55
270 0.53
271 0.52
272 0.56
273 0.59
274 0.64
275 0.67
276 0.67
277 0.7
278 0.7
279 0.71
280 0.65
281 0.65
282 0.67
283 0.69
284 0.69
285 0.73
286 0.73
287 0.76
288 0.85
289 0.86
290 0.86
291 0.85
292 0.86
293 0.86
294 0.9
295 0.9
296 0.9
297 0.89
298 0.89
299 0.84
300 0.83
301 0.78
302 0.7
303 0.65
304 0.64
305 0.62
306 0.59
307 0.6
308 0.58
309 0.59
310 0.57
311 0.55
312 0.49
313 0.41
314 0.34
315 0.29
316 0.23
317 0.17
318 0.16
319 0.14
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.15
326 0.22
327 0.27
328 0.37
329 0.47
330 0.58
331 0.68
332 0.78
333 0.85
334 0.89
335 0.94
336 0.94
337 0.94
338 0.94
339 0.89
340 0.86
341 0.82
342 0.77
343 0.7
344 0.66
345 0.64
346 0.61
347 0.57
348 0.5
349 0.48
350 0.51