Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RVF6

Protein Details
Accession A0A1E4RVF6    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-311DLNMKAKSQEDKRQERKKKSGVNEGPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-278RHRRRSVKSKRRSE
289-303KAKSQEDKRQERKKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSQSSSPLKRQPSEPQEGGDSKRAKVGISSHGTPSVDDILEGDIDSSLAAIEGGDSLLHIPSNLPSASVSAMDTPTLMSIELQADISVPASSESKEQQIQSQLTAAKQEPSPSQAQIKQEGSTANGATNNNSTANNDAANSTNAGSNSNTNNENSANTKPSGGDPDKLSDALVSAGVDLKAEEALLNSTILAKKAAEEDSIPKGPVIVDTPFLDPQQVNWFMGKVLSANGLKHSSQLDPSLIGLITYATEEWVKNIITGAIILSRHRRRSVKSKRRSELSIALRDLNMKAKSQEDKRQERKKKSGVNEGPEKEATEEIQHKATNATVAMMTGKKKKYDWMNSGGGSSKSPANDISTRFREAREEPGVVVRDLLNTLEKKRMGVEKTITKGYAKLKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.58
3 0.57
4 0.57
5 0.56
6 0.54
7 0.47
8 0.39
9 0.41
10 0.39
11 0.32
12 0.31
13 0.32
14 0.32
15 0.36
16 0.38
17 0.36
18 0.4
19 0.4
20 0.36
21 0.34
22 0.28
23 0.21
24 0.18
25 0.16
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.1
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.03
38 0.03
39 0.03
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.06
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.1
80 0.12
81 0.16
82 0.19
83 0.2
84 0.23
85 0.29
86 0.29
87 0.27
88 0.29
89 0.27
90 0.24
91 0.27
92 0.24
93 0.2
94 0.2
95 0.22
96 0.19
97 0.22
98 0.24
99 0.23
100 0.28
101 0.29
102 0.31
103 0.34
104 0.35
105 0.31
106 0.3
107 0.28
108 0.24
109 0.23
110 0.2
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.17
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.22
149 0.21
150 0.22
151 0.2
152 0.22
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.13
157 0.12
158 0.09
159 0.08
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.12
186 0.16
187 0.17
188 0.16
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.11
202 0.11
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.06
212 0.06
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.18
251 0.24
252 0.28
253 0.34
254 0.38
255 0.41
256 0.52
257 0.62
258 0.64
259 0.69
260 0.76
261 0.77
262 0.78
263 0.77
264 0.71
265 0.69
266 0.66
267 0.62
268 0.53
269 0.47
270 0.42
271 0.4
272 0.35
273 0.32
274 0.26
275 0.2
276 0.2
277 0.24
278 0.31
279 0.36
280 0.44
281 0.47
282 0.56
283 0.66
284 0.75
285 0.8
286 0.83
287 0.86
288 0.86
289 0.86
290 0.82
291 0.83
292 0.8
293 0.79
294 0.79
295 0.71
296 0.66
297 0.57
298 0.5
299 0.4
300 0.33
301 0.25
302 0.22
303 0.24
304 0.21
305 0.24
306 0.24
307 0.23
308 0.23
309 0.22
310 0.18
311 0.14
312 0.14
313 0.1
314 0.1
315 0.13
316 0.15
317 0.18
318 0.24
319 0.28
320 0.3
321 0.31
322 0.38
323 0.46
324 0.53
325 0.56
326 0.55
327 0.58
328 0.56
329 0.56
330 0.52
331 0.43
332 0.34
333 0.29
334 0.24
335 0.19
336 0.19
337 0.19
338 0.21
339 0.25
340 0.29
341 0.36
342 0.37
343 0.41
344 0.41
345 0.41
346 0.41
347 0.39
348 0.43
349 0.4
350 0.37
351 0.33
352 0.39
353 0.4
354 0.34
355 0.32
356 0.24
357 0.2
358 0.19
359 0.19
360 0.19
361 0.2
362 0.23
363 0.29
364 0.29
365 0.29
366 0.34
367 0.4
368 0.37
369 0.42
370 0.47
371 0.49
372 0.53
373 0.57
374 0.53
375 0.46
376 0.49