FuNGI

A0A1E4S7Y2

Protein Details

Accession

A0A1E4S7Y2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MPSRPVGRRPIKSERPKKIPVAPKQEA	Hydrophilic
65-86	SESFTKPVRLHRKETRNLQYQL	Hydrophilic
161-181	PDGGARKKLFKDNRKTRQVRV	Basic
548-570	KDLIIKLKSKLKNPENRSRIKLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-19	GRRPIKSERPKKI
166-169	RKKL

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MPSRPVGRRPIKSERPKKIPVAPKQEAEDPADYKEYSLVACKDEDIENMRTNVLKFQSKHKINPSESFTKPVRLHRKETRNLQYQLTRAEIEQRQRENAEARRIAEEERLAREKAKAEEPGRVVFDIKNDPNVAPEPEPEPKTEEEKRIEKMAKQQANIAPDGGARKKLFKDNRKTRQVRVMKEEDRKLRYEEFYPWVMEDWDGQNTWVGQYEAANADTYCLLVLKDDKFTMIPVDKVYKFTPRNKYATLTLEEAEARMEKHNTVPRWLMKHLDEKEQKLTRYERTKKKLKTVEGTSENDNGKRDSDNDDLDFDEEFADDEEAPIIDGNEEENKESERKMKREMLGANAMGLHDQDGEEEDDVDDLFEARKVDKDGERVRKTLMKTEGTGIYDSEDEVNPYLNESDLEIDNSEEEIIAADLGKSVSPAGSSVQTRQSSPAPGTRIKVKSINSPIGFVVLKGLPSVLMQFPRGEWNPNAKRRVPEYTGSDDESRYTKRIKLEDDEHSIPTTVKSEEPIQIPTVQASNGDLLTAEDVLSVVRNAENITVKDLIIKLKSKLKNPENRSRIKLLVNQLLKTENGFLVPKETTKVET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.86
3	0.85
4	0.84
5	0.83
6	0.82
7	0.81
8	0.81
9	0.77
10	0.73
11	0.69
12	0.68
13	0.61
14	0.56
15	0.51
16	0.42
17	0.39
18	0.38
19	0.33
20	0.27
21	0.25
22	0.21
23	0.16
24	0.21
25	0.2
26	0.18
27	0.19
28	0.19
29	0.2
30	0.21
31	0.23
32	0.23
33	0.25
34	0.27
35	0.27
36	0.28
37	0.27
38	0.27
39	0.29
40	0.3
41	0.33
42	0.31
43	0.4
44	0.49
45	0.54
46	0.61
47	0.65
48	0.69
49	0.67
50	0.73
51	0.7
52	0.67
53	0.63
54	0.61
55	0.53
56	0.52
57	0.52
58	0.54
59	0.58
60	0.56
61	0.64
62	0.68
63	0.76
64	0.76
65	0.82
66	0.82
67	0.8
68	0.77
69	0.75
70	0.7
71	0.63
72	0.58
73	0.5
74	0.41
75	0.32
76	0.38
77	0.36
78	0.39
79	0.44
80	0.43
81	0.44
82	0.44
83	0.47
84	0.46
85	0.48
86	0.49
87	0.44
88	0.43
89	0.42
90	0.42
91	0.4
92	0.36
93	0.34
94	0.28
95	0.31
96	0.33
97	0.3
98	0.31
99	0.33
100	0.33
101	0.33
102	0.34
103	0.36
104	0.35
105	0.4
106	0.42
107	0.42
108	0.39
109	0.35
110	0.32
111	0.25
112	0.27
113	0.28
114	0.27
115	0.27
116	0.27
117	0.26
118	0.27
119	0.29
120	0.28
121	0.21
122	0.21
123	0.22
124	0.27
125	0.28
126	0.26
127	0.27
128	0.27
129	0.33
130	0.36
131	0.39
132	0.39
133	0.42
134	0.44
135	0.48
136	0.49
137	0.45
138	0.49
139	0.52
140	0.51
141	0.47
142	0.51
143	0.47
144	0.47
145	0.44
146	0.34
147	0.25
148	0.21
149	0.25
150	0.2
151	0.22
152	0.2
153	0.24
154	0.27
155	0.36
156	0.45
157	0.5
158	0.6
159	0.65
160	0.75
161	0.81
162	0.82
163	0.78
164	0.79
165	0.77
166	0.72
167	0.69
168	0.68
169	0.65
170	0.69
171	0.71
172	0.68
173	0.63
174	0.59
175	0.55
176	0.5
177	0.44
178	0.39
179	0.36
180	0.32
181	0.3
182	0.28
183	0.25
184	0.22
185	0.19
186	0.17
187	0.14
188	0.12
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.08
197	0.07
198	0.07
199	0.09
200	0.09
201	0.1
202	0.1
203	0.08
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.08
212	0.09
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.12
222	0.18
223	0.18
224	0.21
225	0.22
226	0.27
227	0.31
228	0.39
229	0.47
230	0.47
231	0.51
232	0.5
233	0.51
234	0.47
235	0.45
236	0.4
237	0.31
238	0.26
239	0.22
240	0.2
241	0.17
242	0.14
243	0.11
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.14
249	0.2
250	0.21
251	0.23
252	0.27
253	0.28
254	0.32
255	0.32
256	0.3
257	0.27
258	0.35
259	0.34
260	0.39
261	0.39
262	0.38
263	0.45
264	0.45
265	0.43
266	0.38
267	0.4
268	0.37
269	0.44
270	0.51
271	0.53
272	0.58
273	0.66
274	0.66
275	0.72
276	0.72
277	0.67
278	0.66
279	0.61
280	0.61
281	0.57
282	0.55
283	0.47
284	0.45
285	0.4
286	0.34
287	0.3
288	0.22
289	0.18
290	0.16
291	0.16
292	0.16
293	0.18
294	0.18
295	0.18
296	0.18
297	0.18
298	0.18
299	0.16
300	0.11
301	0.08
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.04
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.11
323	0.19
324	0.23
325	0.26
326	0.31
327	0.37
328	0.37
329	0.42
330	0.43
331	0.4
332	0.37
333	0.34
334	0.28
335	0.22
336	0.2
337	0.14
338	0.12
339	0.08
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.08
358	0.1
359	0.13
360	0.16
361	0.24
362	0.31
363	0.41
364	0.44
365	0.43
366	0.45
367	0.46
368	0.45
369	0.45
370	0.42
371	0.34
372	0.32
373	0.34
374	0.35
375	0.31
376	0.3
377	0.22
378	0.17
379	0.15
380	0.14
381	0.12
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.09
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.04
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.06
415	0.07
416	0.1
417	0.12
418	0.15
419	0.22
420	0.23
421	0.24
422	0.26
423	0.28
424	0.27
425	0.28
426	0.31
427	0.28
428	0.3
429	0.32
430	0.38
431	0.38
432	0.39
433	0.42
434	0.39
435	0.43
436	0.47
437	0.53
438	0.45
439	0.44
440	0.4
441	0.38
442	0.35
443	0.26
444	0.22
445	0.14
446	0.14
447	0.12
448	0.12
449	0.09
450	0.09
451	0.12
452	0.11
453	0.12
454	0.13
455	0.14
456	0.15
457	0.22
458	0.23
459	0.25
460	0.25
461	0.35
462	0.43
463	0.51
464	0.56
465	0.53
466	0.58
467	0.58
468	0.63
469	0.57
470	0.53
471	0.51
472	0.53
473	0.51
474	0.49
475	0.45
476	0.38
477	0.35
478	0.33
479	0.3
480	0.26
481	0.26
482	0.26
483	0.32
484	0.37
485	0.4
486	0.44
487	0.48
488	0.52
489	0.56
490	0.55
491	0.5
492	0.45
493	0.4
494	0.33
495	0.28
496	0.23
497	0.17
498	0.15
499	0.16
500	0.19
501	0.23
502	0.25
503	0.26
504	0.25
505	0.25
506	0.25
507	0.24
508	0.21
509	0.16
510	0.15
511	0.14
512	0.14
513	0.12
514	0.11
515	0.1
516	0.09
517	0.1
518	0.09
519	0.08
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.08
529	0.13
530	0.17
531	0.18
532	0.21
533	0.22
534	0.21
535	0.24
536	0.25
537	0.26
538	0.26
539	0.29
540	0.3
541	0.39
542	0.45
543	0.49
544	0.58
545	0.63
546	0.68
547	0.74
548	0.8
549	0.8
550	0.82
551	0.81
552	0.76
553	0.72
554	0.68
555	0.66
556	0.64
557	0.64
558	0.61
559	0.55
560	0.51
561	0.48
562	0.42
563	0.36
564	0.31
565	0.22
566	0.2
567	0.2
568	0.19
569	0.21
570	0.22
571	0.22
572	0.22

A0A1E4S7Y2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer