Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RU08

Protein Details
Accession A0A1E4RU08    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21KKDSKRLKKQRSDKGKAEDLDBasic
364-384FWDWKTCKLIKKTKIDSKAITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-11KRLKKQR
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito 8, cyto_nucl 8, cyto 6.5, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences KKDSKRLKKQRSDKGKAEDLDGYSGPWAKYRSSSDEEDGVQDVEELGEEPQVEDEEAYQSDSEEENANPETTEFLGSSEVDYQGRTYMHVPTNVGVNLSSDESPGECFVPKKLIHKWDGHLRGTNRIQFFPNTNHLLLSCGNDNKIFLWSVYRKRECLRGYYGHTKPVKDINFNNNGTRFLSAGYDKFVKLWDTETGECLARFQLNSVPTVVKFNPFNDMEFLVGLSNHNIEHYDINEHKLIQKYDHHLGSINSITFLENKRFMSTSEDKTARVWDLQINIPIKLISDPTLHSMPFTRVHPEGKYIAAQSMDNTVLVFSTKDRYKTNKKKLFTGHNCAGFGIGIDFTPDGKTLISGDSSGLGVFWDWKTCKLIKKTKIDSKAITQVCWNTKEVSKCAFAGASGPIFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.86
3 0.76
4 0.7
5 0.64
6 0.55
7 0.5
8 0.4
9 0.32
10 0.26
11 0.28
12 0.24
13 0.22
14 0.22
15 0.2
16 0.26
17 0.31
18 0.36
19 0.37
20 0.42
21 0.41
22 0.44
23 0.43
24 0.39
25 0.35
26 0.27
27 0.22
28 0.17
29 0.13
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.13
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.18
75 0.22
76 0.24
77 0.24
78 0.22
79 0.26
80 0.24
81 0.23
82 0.17
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.18
97 0.19
98 0.24
99 0.3
100 0.37
101 0.41
102 0.45
103 0.48
104 0.52
105 0.56
106 0.54
107 0.53
108 0.47
109 0.5
110 0.51
111 0.51
112 0.44
113 0.39
114 0.38
115 0.34
116 0.36
117 0.33
118 0.33
119 0.31
120 0.29
121 0.28
122 0.26
123 0.25
124 0.23
125 0.2
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.09
135 0.15
136 0.2
137 0.28
138 0.37
139 0.38
140 0.4
141 0.41
142 0.49
143 0.44
144 0.44
145 0.42
146 0.37
147 0.42
148 0.49
149 0.48
150 0.48
151 0.49
152 0.44
153 0.4
154 0.43
155 0.39
156 0.34
157 0.38
158 0.37
159 0.43
160 0.44
161 0.45
162 0.39
163 0.37
164 0.33
165 0.29
166 0.21
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.16
206 0.16
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.12
222 0.12
223 0.15
224 0.16
225 0.15
226 0.18
227 0.21
228 0.21
229 0.19
230 0.23
231 0.26
232 0.31
233 0.31
234 0.28
235 0.26
236 0.25
237 0.26
238 0.23
239 0.17
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.18
248 0.19
249 0.19
250 0.2
251 0.25
252 0.29
253 0.3
254 0.35
255 0.36
256 0.34
257 0.35
258 0.37
259 0.3
260 0.25
261 0.21
262 0.16
263 0.18
264 0.2
265 0.24
266 0.23
267 0.22
268 0.21
269 0.19
270 0.17
271 0.15
272 0.14
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.16
277 0.17
278 0.16
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.22
286 0.25
287 0.25
288 0.27
289 0.26
290 0.24
291 0.25
292 0.21
293 0.21
294 0.19
295 0.18
296 0.15
297 0.16
298 0.15
299 0.12
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.13
307 0.17
308 0.21
309 0.26
310 0.35
311 0.46
312 0.56
313 0.66
314 0.68
315 0.68
316 0.73
317 0.77
318 0.79
319 0.77
320 0.76
321 0.72
322 0.68
323 0.65
324 0.56
325 0.48
326 0.36
327 0.27
328 0.19
329 0.12
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.09
351 0.1
352 0.15
353 0.16
354 0.19
355 0.25
356 0.29
357 0.38
358 0.45
359 0.55
360 0.57
361 0.67
362 0.75
363 0.8
364 0.84
365 0.82
366 0.77
367 0.74
368 0.75
369 0.66
370 0.57
371 0.52
372 0.51
373 0.5
374 0.49
375 0.43
376 0.38
377 0.41
378 0.46
379 0.45
380 0.42
381 0.39
382 0.36
383 0.37
384 0.33
385 0.27
386 0.24
387 0.23