Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4S4C6

Protein Details
Accession A0A1E4S4C6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-367VINKLRRKPAVLGNRKKKRKIDPAQQQQQQQQQRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-353KLRRKPAVLGNRKKKRK
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 8.5, extr 8, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004600  TFIIH_Tfb4/GTF2H3  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF03850  Tfb4  
Amino Acid Sequences MDAIADKAFTTEKVSKSSSVESPSLLAVILDTNPVQWEQLGEKDALKRVLRSLLIAINSHLALNSANTVVVIASHTDGAKVIFPTTSDDEHHRQHQHQHQHHGQGQQQHSTEKEQSPDSVSRSATPASEARSSNGRSFIKSQMYRQFKLVDDTFIQNLDSLLSSIPSTKPPKNMLSSSLSLALSYINKVQQKDSLVKSRILIVNTSPDEHLKYIPIMNCIFAAQKMKIPINVCQLSSQATFLQQAADATNGVYLNIDNLDGLVQYFATAFFIDPSLRNIVIKPTTRDIDFRASCFQTGKVVDIGFVCSVCLCILSEIPKDEKCPACDSDFDHHVINKLRRKPAVLGNRKKKRKIDPAQQQQQQQQQRQGTTSATPTPAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.37
4 0.41
5 0.39
6 0.38
7 0.37
8 0.32
9 0.31
10 0.28
11 0.24
12 0.19
13 0.14
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.09
24 0.11
25 0.12
26 0.15
27 0.17
28 0.17
29 0.2
30 0.24
31 0.28
32 0.32
33 0.32
34 0.3
35 0.31
36 0.35
37 0.33
38 0.3
39 0.29
40 0.27
41 0.27
42 0.26
43 0.24
44 0.2
45 0.19
46 0.18
47 0.14
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.15
72 0.17
73 0.19
74 0.19
75 0.24
76 0.28
77 0.32
78 0.39
79 0.39
80 0.39
81 0.46
82 0.53
83 0.57
84 0.59
85 0.65
86 0.64
87 0.67
88 0.69
89 0.65
90 0.6
91 0.57
92 0.53
93 0.49
94 0.45
95 0.38
96 0.35
97 0.34
98 0.36
99 0.3
100 0.3
101 0.26
102 0.25
103 0.28
104 0.3
105 0.28
106 0.26
107 0.24
108 0.23
109 0.24
110 0.23
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.21
116 0.2
117 0.2
118 0.25
119 0.27
120 0.27
121 0.32
122 0.29
123 0.27
124 0.3
125 0.34
126 0.37
127 0.37
128 0.41
129 0.43
130 0.48
131 0.47
132 0.46
133 0.43
134 0.36
135 0.39
136 0.34
137 0.27
138 0.22
139 0.23
140 0.21
141 0.18
142 0.17
143 0.12
144 0.11
145 0.09
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.13
154 0.18
155 0.2
156 0.25
157 0.29
158 0.33
159 0.36
160 0.36
161 0.34
162 0.33
163 0.32
164 0.29
165 0.27
166 0.23
167 0.18
168 0.17
169 0.14
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.11
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.17
178 0.19
179 0.24
180 0.26
181 0.3
182 0.3
183 0.3
184 0.3
185 0.32
186 0.31
187 0.27
188 0.24
189 0.16
190 0.2
191 0.2
192 0.21
193 0.16
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.15
198 0.1
199 0.11
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.13
210 0.11
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.19
215 0.2
216 0.23
217 0.28
218 0.29
219 0.27
220 0.25
221 0.25
222 0.24
223 0.23
224 0.2
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.11
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.19
267 0.24
268 0.27
269 0.29
270 0.3
271 0.33
272 0.34
273 0.35
274 0.33
275 0.37
276 0.34
277 0.33
278 0.34
279 0.33
280 0.33
281 0.32
282 0.29
283 0.24
284 0.24
285 0.23
286 0.2
287 0.18
288 0.18
289 0.17
290 0.19
291 0.14
292 0.13
293 0.11
294 0.08
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.06
299 0.07
300 0.09
301 0.12
302 0.15
303 0.18
304 0.22
305 0.23
306 0.25
307 0.31
308 0.34
309 0.34
310 0.36
311 0.36
312 0.35
313 0.36
314 0.39
315 0.38
316 0.37
317 0.35
318 0.33
319 0.31
320 0.34
321 0.39
322 0.43
323 0.45
324 0.5
325 0.56
326 0.56
327 0.59
328 0.6
329 0.62
330 0.64
331 0.67
332 0.7
333 0.73
334 0.81
335 0.86
336 0.89
337 0.88
338 0.88
339 0.88
340 0.88
341 0.88
342 0.88
343 0.9
344 0.92
345 0.89
346 0.86
347 0.82
348 0.81
349 0.8
350 0.76
351 0.74
352 0.7
353 0.67
354 0.62
355 0.57
356 0.5
357 0.44
358 0.41
359 0.38