Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H5C089

Protein Details
Accession A0A0H5C089    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-287ASSTQKSKKGAKQKARRKMGAMHydrophilic
379-403ADSVSRGKLAQKRKKQSGLKGLESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-283KSKKGAKQKARRK
367-394KKNPELDKLKKAADSVSRGKLAQKRKKQ
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSKRWDKNATTFRVVYRGHDDPRYHDSEASEHVLVPVENPNNRKVKNKSTLEKELGEQMHEIRNNEGEAALYGITFDDSKYDYMQHLKPMGQGDGVFIPSKTVKEKSKKKDILFKEDLKDVLPPEKTVQLTYQDQQAIPDDIAGFQPDMNPALREVLEALEDEAYVDDDDNIFDNLLKDGELVDEDEFEDQIDEWDLDNYEDEFAQYDDSHYQREGDEGWEADFRKFKATNKKKANDWDSDDEFEEEEEDNDVVPELPSLEGSKAASSTQKSKKGAKQKARRKMGAMTDLSSFSLSSSSVYRTEGLRLLDDKFEVMREKYENNRKEQEEEDDNKKPFDMSTERADLEDLLDDFLDNYEIEGGRRLVKKNPELDKLKKAADSVSRGKLAQKRKKQSGLKGLESSLSNMKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.48
3 0.46
4 0.45
5 0.43
6 0.48
7 0.48
8 0.45
9 0.52
10 0.53
11 0.47
12 0.43
13 0.39
14 0.35
15 0.38
16 0.37
17 0.29
18 0.24
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.18
23 0.21
24 0.22
25 0.27
26 0.29
27 0.36
28 0.42
29 0.45
30 0.53
31 0.53
32 0.58
33 0.64
34 0.7
35 0.72
36 0.73
37 0.8
38 0.76
39 0.7
40 0.61
41 0.59
42 0.5
43 0.42
44 0.35
45 0.28
46 0.3
47 0.3
48 0.3
49 0.24
50 0.25
51 0.24
52 0.22
53 0.2
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.09
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.08
66 0.09
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.2
71 0.22
72 0.26
73 0.27
74 0.27
75 0.29
76 0.3
77 0.29
78 0.24
79 0.21
80 0.18
81 0.17
82 0.17
83 0.14
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.17
89 0.21
90 0.29
91 0.39
92 0.49
93 0.56
94 0.66
95 0.72
96 0.74
97 0.78
98 0.76
99 0.76
100 0.73
101 0.7
102 0.62
103 0.57
104 0.52
105 0.42
106 0.38
107 0.29
108 0.27
109 0.22
110 0.2
111 0.19
112 0.23
113 0.23
114 0.22
115 0.23
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.28
120 0.25
121 0.24
122 0.24
123 0.24
124 0.2
125 0.16
126 0.16
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.08
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.14
211 0.13
212 0.17
213 0.19
214 0.24
215 0.33
216 0.42
217 0.51
218 0.59
219 0.63
220 0.63
221 0.7
222 0.7
223 0.64
224 0.61
225 0.57
226 0.5
227 0.47
228 0.42
229 0.34
230 0.28
231 0.22
232 0.17
233 0.11
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.12
254 0.13
255 0.22
256 0.29
257 0.36
258 0.4
259 0.47
260 0.54
261 0.61
262 0.69
263 0.71
264 0.74
265 0.77
266 0.84
267 0.85
268 0.81
269 0.73
270 0.7
271 0.66
272 0.64
273 0.55
274 0.46
275 0.39
276 0.36
277 0.33
278 0.26
279 0.19
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.14
290 0.16
291 0.19
292 0.18
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.19
298 0.17
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.17
304 0.18
305 0.23
306 0.32
307 0.42
308 0.45
309 0.49
310 0.56
311 0.54
312 0.56
313 0.54
314 0.51
315 0.5
316 0.51
317 0.51
318 0.51
319 0.49
320 0.46
321 0.43
322 0.37
323 0.28
324 0.29
325 0.27
326 0.23
327 0.29
328 0.33
329 0.33
330 0.32
331 0.33
332 0.26
333 0.21
334 0.2
335 0.14
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.06
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.13
349 0.19
350 0.24
351 0.27
352 0.32
353 0.41
354 0.48
355 0.54
356 0.6
357 0.63
358 0.67
359 0.71
360 0.73
361 0.7
362 0.66
363 0.59
364 0.52
365 0.49
366 0.48
367 0.49
368 0.47
369 0.48
370 0.47
371 0.45
372 0.52
373 0.53
374 0.57
375 0.6
376 0.63
377 0.67
378 0.75
379 0.84
380 0.85
381 0.88
382 0.88
383 0.86
384 0.83
385 0.77
386 0.68
387 0.62
388 0.54
389 0.47