Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GBC8

Protein Details
Accession C1GBC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-78TKGPSTKSSKPTSNNSKKKPAKRVKKENEAPVPRRTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-75SNNSKKKPAKRVKKENEAPVPR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
KEGG pbn:PADG_04929  -  
Amino Acid Sequences MTLEESVPELSDFERQRAANIAERDALLKKLTLEAQSSGLFTKGPSTKSSKPTSNNSKKKPAKRVKKENEAPVPRRTSSRLAGLTANSEIAKRKAEEEYEAQKAVAQAKRMRISGDLNMGDIVVGGQKWDSTTFLGTDATAPQRFARTFGEEDIKKTTDKELKSLREKMSGLNLWEPWEPNRIKITPERVYSMAFHPTESKPLVFAGDKLGNLGIFDASQTPPVNVKTEDDEDNDEEDPDPVIAIIKPHARTISAIRIHSSTPSKLYTASYDSSIRALDLEKSVSTEAYAPASKSDDEAVSGVDMAPIDPHVLYFTTLDGFFGRHDTRISGSGGSSDHKNRSTSNSDMYQLSEKKIGGFSLCPSQPHLFATASLDRFMRLWDIRKLSKKDPTPVGEHESKLSVSHAAFNSAGQVATSSYDNTIKIHDFGKKGFQSWNPGHTLDEDDMNPTTTIRHNCQTGRWVTILKPQWQASPQSGIQRLCIGNMNRFVDIYTATGDQLAQLSGEGLITAVPAVAVFHPTRDWVVGGTASGKVCLWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.27
4 0.32
5 0.35
6 0.35
7 0.36
8 0.36
9 0.32
10 0.33
11 0.34
12 0.29
13 0.28
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.2
18 0.23
19 0.23
20 0.24
21 0.24
22 0.26
23 0.25
24 0.25
25 0.22
26 0.19
27 0.16
28 0.13
29 0.2
30 0.21
31 0.22
32 0.26
33 0.33
34 0.41
35 0.49
36 0.56
37 0.57
38 0.59
39 0.67
40 0.74
41 0.78
42 0.8
43 0.8
44 0.84
45 0.85
46 0.88
47 0.89
48 0.89
49 0.89
50 0.9
51 0.93
52 0.92
53 0.94
54 0.93
55 0.92
56 0.91
57 0.9
58 0.84
59 0.81
60 0.76
61 0.67
62 0.62
63 0.57
64 0.52
65 0.46
66 0.49
67 0.43
68 0.39
69 0.4
70 0.36
71 0.34
72 0.29
73 0.26
74 0.18
75 0.17
76 0.19
77 0.18
78 0.21
79 0.19
80 0.21
81 0.24
82 0.26
83 0.29
84 0.32
85 0.36
86 0.36
87 0.36
88 0.33
89 0.3
90 0.3
91 0.33
92 0.28
93 0.28
94 0.29
95 0.37
96 0.41
97 0.4
98 0.39
99 0.35
100 0.36
101 0.34
102 0.37
103 0.29
104 0.25
105 0.25
106 0.23
107 0.2
108 0.16
109 0.12
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.16
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.23
134 0.23
135 0.24
136 0.26
137 0.33
138 0.29
139 0.31
140 0.34
141 0.31
142 0.27
143 0.27
144 0.31
145 0.29
146 0.29
147 0.35
148 0.38
149 0.45
150 0.52
151 0.58
152 0.53
153 0.52
154 0.52
155 0.46
156 0.46
157 0.4
158 0.35
159 0.3
160 0.29
161 0.25
162 0.26
163 0.25
164 0.19
165 0.25
166 0.23
167 0.23
168 0.27
169 0.26
170 0.28
171 0.32
172 0.39
173 0.37
174 0.38
175 0.39
176 0.34
177 0.35
178 0.34
179 0.3
180 0.28
181 0.23
182 0.21
183 0.22
184 0.22
185 0.24
186 0.24
187 0.21
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.06
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.13
211 0.15
212 0.13
213 0.14
214 0.15
215 0.18
216 0.19
217 0.18
218 0.2
219 0.19
220 0.2
221 0.19
222 0.16
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.07
227 0.06
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.17
240 0.23
241 0.23
242 0.23
243 0.23
244 0.24
245 0.23
246 0.26
247 0.25
248 0.17
249 0.16
250 0.17
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.12
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.15
323 0.17
324 0.2
325 0.22
326 0.23
327 0.23
328 0.28
329 0.32
330 0.31
331 0.32
332 0.3
333 0.3
334 0.29
335 0.3
336 0.3
337 0.26
338 0.25
339 0.23
340 0.21
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.14
345 0.13
346 0.14
347 0.18
348 0.19
349 0.18
350 0.22
351 0.23
352 0.23
353 0.22
354 0.23
355 0.16
356 0.16
357 0.2
358 0.21
359 0.2
360 0.21
361 0.2
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.15
367 0.19
368 0.24
369 0.3
370 0.36
371 0.45
372 0.5
373 0.51
374 0.57
375 0.59
376 0.6
377 0.62
378 0.59
379 0.56
380 0.54
381 0.55
382 0.5
383 0.45
384 0.39
385 0.33
386 0.29
387 0.24
388 0.21
389 0.17
390 0.13
391 0.18
392 0.17
393 0.18
394 0.18
395 0.17
396 0.18
397 0.16
398 0.15
399 0.09
400 0.09
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.15
410 0.15
411 0.16
412 0.19
413 0.23
414 0.23
415 0.24
416 0.33
417 0.32
418 0.32
419 0.36
420 0.37
421 0.4
422 0.42
423 0.45
424 0.39
425 0.38
426 0.37
427 0.33
428 0.33
429 0.25
430 0.24
431 0.19
432 0.18
433 0.18
434 0.19
435 0.17
436 0.14
437 0.15
438 0.18
439 0.23
440 0.26
441 0.3
442 0.34
443 0.35
444 0.39
445 0.45
446 0.42
447 0.41
448 0.38
449 0.36
450 0.32
451 0.4
452 0.42
453 0.4
454 0.44
455 0.41
456 0.44
457 0.45
458 0.48
459 0.42
460 0.42
461 0.39
462 0.41
463 0.45
464 0.41
465 0.39
466 0.41
467 0.38
468 0.33
469 0.37
470 0.32
471 0.32
472 0.39
473 0.4
474 0.34
475 0.34
476 0.32
477 0.26
478 0.24
479 0.19
480 0.14
481 0.13
482 0.12
483 0.13
484 0.12
485 0.11
486 0.11
487 0.1
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.05
502 0.05
503 0.1
504 0.1
505 0.12
506 0.13
507 0.15
508 0.17
509 0.17
510 0.17
511 0.14
512 0.16
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.17
517 0.16
518 0.16