Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H5CB42

Protein Details
Accession A0A0H5CB42    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37YPPDFDPSKIIKKRKKVKTGSASLPTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-27IKKRKKV
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVINKYYPPDFDPSKIIKKRKKVKTGSASLPTVRFMTPYSLRCDNCGEYTSKARKFNARKENTEETYLGLKTVKLHIKCPRCASEIIFQTDPKSADYVLIFGAKKLYDSGNTNQKLQDETLEETLSRLEKEEQEEAKLKEGKTGNKTTTVEELEAKLNALRREQEMNEELDEIQQKNVRLQEKSQTIVKSQKEQQLAKQKMQEEEDEKIAQDAFSSKRQTELMNIYKSSDDESNDDSSDESDYDQPINNLIKRPTSKVVLKRKVNTLGVSTKRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.48
3 0.46
4 0.48
5 0.51
6 0.55
7 0.62
8 0.64
9 0.71
10 0.79
11 0.82
12 0.86
13 0.85
14 0.87
15 0.88
16 0.88
17 0.86
18 0.82
19 0.76
20 0.68
21 0.6
22 0.51
23 0.42
24 0.33
25 0.25
26 0.2
27 0.23
28 0.26
29 0.28
30 0.32
31 0.38
32 0.38
33 0.39
34 0.43
35 0.39
36 0.35
37 0.34
38 0.3
39 0.27
40 0.36
41 0.42
42 0.43
43 0.46
44 0.47
45 0.54
46 0.61
47 0.67
48 0.69
49 0.67
50 0.67
51 0.7
52 0.75
53 0.68
54 0.62
55 0.52
56 0.43
57 0.39
58 0.33
59 0.26
60 0.18
61 0.16
62 0.14
63 0.21
64 0.25
65 0.23
66 0.3
67 0.38
68 0.45
69 0.5
70 0.54
71 0.51
72 0.47
73 0.48
74 0.45
75 0.44
76 0.41
77 0.41
78 0.36
79 0.32
80 0.3
81 0.32
82 0.29
83 0.22
84 0.17
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.1
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.14
100 0.19
101 0.27
102 0.28
103 0.29
104 0.29
105 0.29
106 0.28
107 0.24
108 0.22
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.12
122 0.17
123 0.17
124 0.19
125 0.23
126 0.23
127 0.26
128 0.28
129 0.25
130 0.26
131 0.29
132 0.31
133 0.33
134 0.37
135 0.33
136 0.36
137 0.37
138 0.32
139 0.33
140 0.29
141 0.24
142 0.2
143 0.2
144 0.16
145 0.15
146 0.13
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.18
154 0.18
155 0.22
156 0.2
157 0.21
158 0.2
159 0.19
160 0.17
161 0.15
162 0.18
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.15
167 0.17
168 0.22
169 0.24
170 0.23
171 0.25
172 0.31
173 0.32
174 0.34
175 0.36
176 0.32
177 0.32
178 0.38
179 0.39
180 0.38
181 0.41
182 0.44
183 0.47
184 0.47
185 0.52
186 0.55
187 0.57
188 0.54
189 0.54
190 0.51
191 0.48
192 0.48
193 0.45
194 0.38
195 0.36
196 0.35
197 0.3
198 0.27
199 0.23
200 0.21
201 0.16
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.18
206 0.22
207 0.21
208 0.24
209 0.26
210 0.26
211 0.28
212 0.34
213 0.36
214 0.37
215 0.37
216 0.36
217 0.36
218 0.35
219 0.32
220 0.26
221 0.2
222 0.19
223 0.22
224 0.23
225 0.22
226 0.22
227 0.19
228 0.17
229 0.17
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.15
237 0.19
238 0.24
239 0.25
240 0.29
241 0.3
242 0.37
243 0.39
244 0.45
245 0.45
246 0.47
247 0.53
248 0.57
249 0.66
250 0.68
251 0.73
252 0.74
253 0.76
254 0.77
255 0.73
256 0.66
257 0.62
258 0.61
259 0.61