Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1G535

Protein Details
Accession C1G535    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-167ESEKWDKRMEKKQRHRDDTABasic
255-277LRKAEEIRLKKRKDRGRGDEEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-270IRLKKRKDRG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pbn:PADG_02051  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MTDQKKQQSPVTDIPGTPKLTRRRTTKYETSEANGSSSACPDETPVSDAAAGPSSAEPENSKVADPAVSKTEDMRNRFKALQARAKNASERNLKETAAESQRLATDPGLLSSISRKHAFASHNLLKADTEAQGEDFERKRAWDWTIDESEKWDKRMEKKQRHRDDTAFQDYRQDARKIYKRQIRHMQPDLEAYEKERIIAVEKAAASGKLQIVEAEDGELVAVDKNGTFYSTAHSVDFAENKPDRAAVDRLVADLRKAEEIRLKKRKDRGRGDEEDDVTYINDQNKKFNQQLARFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.48
4 0.44
5 0.44
6 0.46
7 0.53
8 0.6
9 0.63
10 0.66
11 0.7
12 0.76
13 0.78
14 0.76
15 0.74
16 0.7
17 0.66
18 0.62
19 0.54
20 0.47
21 0.38
22 0.31
23 0.24
24 0.22
25 0.19
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.13
38 0.11
39 0.1
40 0.09
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.16
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.21
58 0.28
59 0.31
60 0.35
61 0.4
62 0.41
63 0.44
64 0.45
65 0.47
66 0.46
67 0.48
68 0.53
69 0.51
70 0.53
71 0.53
72 0.55
73 0.55
74 0.51
75 0.51
76 0.49
77 0.46
78 0.45
79 0.42
80 0.4
81 0.35
82 0.33
83 0.32
84 0.28
85 0.27
86 0.22
87 0.21
88 0.22
89 0.21
90 0.21
91 0.14
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.12
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.22
105 0.24
106 0.24
107 0.31
108 0.33
109 0.35
110 0.35
111 0.34
112 0.29
113 0.28
114 0.25
115 0.17
116 0.12
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.19
131 0.23
132 0.27
133 0.27
134 0.26
135 0.26
136 0.32
137 0.28
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.31
142 0.42
143 0.49
144 0.53
145 0.63
146 0.73
147 0.79
148 0.82
149 0.8
150 0.73
151 0.69
152 0.65
153 0.64
154 0.54
155 0.44
156 0.42
157 0.38
158 0.37
159 0.35
160 0.29
161 0.21
162 0.28
163 0.37
164 0.38
165 0.46
166 0.5
167 0.5
168 0.58
169 0.66
170 0.67
171 0.67
172 0.67
173 0.61
174 0.56
175 0.54
176 0.46
177 0.38
178 0.29
179 0.23
180 0.21
181 0.18
182 0.17
183 0.14
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.13
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.17
224 0.2
225 0.17
226 0.22
227 0.22
228 0.23
229 0.23
230 0.22
231 0.21
232 0.22
233 0.23
234 0.17
235 0.21
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.23
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.19
245 0.2
246 0.25
247 0.33
248 0.44
249 0.51
250 0.56
251 0.59
252 0.68
253 0.75
254 0.78
255 0.8
256 0.8
257 0.8
258 0.8
259 0.79
260 0.77
261 0.7
262 0.61
263 0.5
264 0.41
265 0.31
266 0.25
267 0.22
268 0.2
269 0.24
270 0.23
271 0.31
272 0.36
273 0.43
274 0.45
275 0.49
276 0.53
277 0.55
278 0.64
279 0.65
280 0.68
281 0.62
282 0.61
283 0.62
284 0.54
285 0.5
286 0.44
287 0.41
288 0.39
289 0.4
290 0.41
291 0.4
292 0.4
293 0.37