Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1G166

Protein Details
Accession C1G166    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAKRRTKKRTHLQAGSSSNAHydrophilic
228-252KRTGIPKRIRRLNPKEQRHRDRKTGBasic
369-406LDEAWEKRRKEKEQRRKEQKENIERKRKEKRGGGKGDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-250GIPKRIRRLNPKEQRHRDRK
305-318LQRMKGGEKKSSKP
375-404KRRKEKEQRRKEQKENIERKRKEKRGGGKG
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_00606  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRTKKRTHLQAGSSSNAAPKSASASMTKSPKSMVIRMGAGEVGPSVSQLVKDVRAMMEPDTASRLKERKSNKLKDYTVMTGPLGVTHLLLFSKSSTGNTNFRLALAPRGPTLHFRVENYSLCKDVVKALKHPKGWGKLHLTPPLLVMNNLMSSNTDNEHISKAVPKHLESLATTVFQSLFPLISPQTTPLSSIRRIMLLNRELSPEQTEDGLYILNLRHYAITTKRTGIPKRIRRLNPKEQRHRDRKTGALPNLGKLDDVADYLLDPSAAGYTSASETELDTDAEVEVLENTAKKVLNKRELQRMKGGEKKSSKPSDPNVEKRAVKLVELGPRMKLKLTKVEEGLCGGKVLWHHVLAKTEAETKELDEAWEKRRKEKEQRRKEQKENIERKRKEKRGGGKGDAIKEGEDGEDDGEDDEDLHDQWDGEDFDDGDEDMEDASPTIKGGTYHHLMWPWSPLFDMFFLYKVKRVVLKTVHDLLSNYTVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.73
3 0.63
4 0.53
5 0.46
6 0.38
7 0.31
8 0.22
9 0.17
10 0.19
11 0.2
12 0.21
13 0.2
14 0.24
15 0.31
16 0.39
17 0.39
18 0.35
19 0.34
20 0.39
21 0.42
22 0.42
23 0.4
24 0.36
25 0.36
26 0.36
27 0.35
28 0.29
29 0.23
30 0.18
31 0.13
32 0.1
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.1
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.19
45 0.2
46 0.19
47 0.21
48 0.19
49 0.19
50 0.22
51 0.22
52 0.21
53 0.26
54 0.3
55 0.29
56 0.36
57 0.42
58 0.48
59 0.58
60 0.67
61 0.69
62 0.74
63 0.73
64 0.71
65 0.7
66 0.63
67 0.55
68 0.47
69 0.38
70 0.3
71 0.27
72 0.22
73 0.17
74 0.12
75 0.1
76 0.08
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.16
86 0.21
87 0.26
88 0.28
89 0.31
90 0.29
91 0.29
92 0.31
93 0.26
94 0.29
95 0.26
96 0.25
97 0.22
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.29
102 0.3
103 0.29
104 0.29
105 0.34
106 0.37
107 0.4
108 0.41
109 0.38
110 0.31
111 0.29
112 0.28
113 0.23
114 0.25
115 0.27
116 0.25
117 0.31
118 0.4
119 0.46
120 0.47
121 0.52
122 0.53
123 0.56
124 0.56
125 0.55
126 0.53
127 0.54
128 0.58
129 0.6
130 0.53
131 0.45
132 0.43
133 0.4
134 0.32
135 0.25
136 0.19
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.16
152 0.17
153 0.21
154 0.23
155 0.22
156 0.24
157 0.25
158 0.26
159 0.21
160 0.23
161 0.18
162 0.17
163 0.16
164 0.13
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.15
180 0.19
181 0.2
182 0.22
183 0.21
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.25
188 0.24
189 0.25
190 0.23
191 0.25
192 0.23
193 0.24
194 0.23
195 0.17
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.1
211 0.12
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.23
216 0.29
217 0.32
218 0.39
219 0.46
220 0.51
221 0.58
222 0.65
223 0.67
224 0.72
225 0.78
226 0.8
227 0.8
228 0.81
229 0.84
230 0.84
231 0.88
232 0.87
233 0.83
234 0.79
235 0.73
236 0.67
237 0.65
238 0.63
239 0.55
240 0.54
241 0.49
242 0.43
243 0.41
244 0.36
245 0.27
246 0.19
247 0.17
248 0.09
249 0.09
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.04
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.18
286 0.26
287 0.34
288 0.41
289 0.46
290 0.54
291 0.59
292 0.6
293 0.59
294 0.57
295 0.54
296 0.55
297 0.53
298 0.5
299 0.51
300 0.53
301 0.56
302 0.57
303 0.54
304 0.53
305 0.57
306 0.59
307 0.62
308 0.64
309 0.6
310 0.6
311 0.57
312 0.52
313 0.53
314 0.42
315 0.34
316 0.31
317 0.3
318 0.31
319 0.33
320 0.33
321 0.29
322 0.3
323 0.31
324 0.28
325 0.28
326 0.24
327 0.3
328 0.34
329 0.35
330 0.36
331 0.37
332 0.35
333 0.34
334 0.32
335 0.23
336 0.18
337 0.14
338 0.13
339 0.11
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.16
344 0.18
345 0.21
346 0.2
347 0.21
348 0.19
349 0.23
350 0.22
351 0.21
352 0.2
353 0.18
354 0.2
355 0.19
356 0.18
357 0.17
358 0.2
359 0.27
360 0.34
361 0.34
362 0.4
363 0.48
364 0.57
365 0.63
366 0.71
367 0.74
368 0.78
369 0.89
370 0.92
371 0.93
372 0.93
373 0.91
374 0.91
375 0.91
376 0.9
377 0.9
378 0.9
379 0.85
380 0.86
381 0.87
382 0.85
383 0.82
384 0.81
385 0.8
386 0.8
387 0.84
388 0.79
389 0.77
390 0.74
391 0.69
392 0.62
393 0.52
394 0.42
395 0.33
396 0.28
397 0.19
398 0.14
399 0.11
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.1
415 0.11
416 0.1
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.11
436 0.18
437 0.21
438 0.23
439 0.26
440 0.29
441 0.29
442 0.29
443 0.33
444 0.28
445 0.24
446 0.24
447 0.21
448 0.2
449 0.2
450 0.22
451 0.15
452 0.17
453 0.2
454 0.21
455 0.25
456 0.24
457 0.28
458 0.31
459 0.33
460 0.39
461 0.43
462 0.48
463 0.51
464 0.56
465 0.54
466 0.49
467 0.48
468 0.43