Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GIB4

Protein Details
Accession C1GIB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
337-357DTINKLLKKQAPKRRGKISAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-332MARRRKNLSEKRNE
340-353NKLLKKQAPKRRGK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 12.833, mito 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029523  INO80B/Ies2  
IPR006880  INO80B_C  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG pbn:PADG_07000  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04795  PAPA-1  
Amino Acid Sequences MSTQRSLRSHTGLTHVSSPLSNSISRYRRTTDEAVPPPSVTVSRLPLSPPKDAHRSIRLKVKMPSSKLREVTGGAEKRHHNIFTEPVIVTGPRNSRSKKTLVEVDTDEDEEVEESMGEEDGEQSHTSDADGSDGEENGNDSEDADAEADGDDDVDMDDALPIPPNVKQAVSRPTVSVTAAGESRLNHADSTMNLDDDDDEELSELDSEADADGEPDETVMPEEPEEPEEPEEIVEDDDMEEEEEEEEEEEEEEEEEVELESDSGTPITGSRSSTPDVSKMTKRQRGRMELGGDFLQLPMEPQVKKHLTAEEHAMRRAEMARRRKNLSEKRNEEEKMDTINKLLKKQAPKRRGKISAAETAAGGETTPRAQELQEPEKPEPTMIRYVSNREGCRVGVPEEWFGTPAGRIFENGSTTRSMGSGQGHRRLVEEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.32
4 0.29
5 0.28
6 0.26
7 0.25
8 0.23
9 0.22
10 0.31
11 0.36
12 0.4
13 0.43
14 0.43
15 0.45
16 0.51
17 0.53
18 0.52
19 0.55
20 0.58
21 0.58
22 0.55
23 0.5
24 0.43
25 0.39
26 0.32
27 0.24
28 0.21
29 0.21
30 0.22
31 0.23
32 0.26
33 0.31
34 0.34
35 0.38
36 0.39
37 0.4
38 0.47
39 0.5
40 0.53
41 0.56
42 0.59
43 0.58
44 0.63
45 0.62
46 0.6
47 0.62
48 0.65
49 0.63
50 0.63
51 0.67
52 0.65
53 0.68
54 0.64
55 0.61
56 0.53
57 0.46
58 0.44
59 0.44
60 0.42
61 0.35
62 0.39
63 0.39
64 0.4
65 0.43
66 0.39
67 0.32
68 0.3
69 0.33
70 0.29
71 0.31
72 0.27
73 0.23
74 0.23
75 0.21
76 0.19
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.3
81 0.33
82 0.38
83 0.43
84 0.48
85 0.47
86 0.48
87 0.52
88 0.47
89 0.48
90 0.44
91 0.42
92 0.38
93 0.34
94 0.27
95 0.19
96 0.17
97 0.12
98 0.1
99 0.07
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.16
156 0.23
157 0.25
158 0.25
159 0.23
160 0.24
161 0.24
162 0.23
163 0.19
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.17
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.06
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.14
259 0.15
260 0.18
261 0.19
262 0.2
263 0.22
264 0.25
265 0.29
266 0.36
267 0.44
268 0.49
269 0.52
270 0.57
271 0.62
272 0.65
273 0.65
274 0.62
275 0.57
276 0.49
277 0.48
278 0.4
279 0.32
280 0.24
281 0.19
282 0.13
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.22
290 0.24
291 0.26
292 0.28
293 0.3
294 0.28
295 0.3
296 0.37
297 0.36
298 0.36
299 0.37
300 0.35
301 0.29
302 0.29
303 0.31
304 0.31
305 0.31
306 0.4
307 0.47
308 0.53
309 0.58
310 0.63
311 0.69
312 0.73
313 0.75
314 0.75
315 0.72
316 0.74
317 0.77
318 0.71
319 0.63
320 0.57
321 0.48
322 0.45
323 0.41
324 0.34
325 0.28
326 0.33
327 0.33
328 0.32
329 0.36
330 0.35
331 0.43
332 0.53
333 0.61
334 0.66
335 0.73
336 0.79
337 0.82
338 0.84
339 0.79
340 0.78
341 0.73
342 0.71
343 0.62
344 0.55
345 0.44
346 0.37
347 0.31
348 0.22
349 0.16
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.16
358 0.23
359 0.3
360 0.34
361 0.39
362 0.4
363 0.44
364 0.44
365 0.4
366 0.35
367 0.31
368 0.34
369 0.31
370 0.36
371 0.35
372 0.41
373 0.48
374 0.52
375 0.49
376 0.45
377 0.45
378 0.39
379 0.4
380 0.36
381 0.31
382 0.28
383 0.29
384 0.29
385 0.29
386 0.29
387 0.26
388 0.23
389 0.21
390 0.17
391 0.16
392 0.16
393 0.14
394 0.15
395 0.17
396 0.2
397 0.24
398 0.24
399 0.24
400 0.24
401 0.24
402 0.23
403 0.21
404 0.19
405 0.18
406 0.23
407 0.3
408 0.35
409 0.43
410 0.45
411 0.45