Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GDC7

Protein Details
Accession C1GDC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-27TFNGTRCTKVRRTHHSNLSSLHydrophilic
147-174IALVPFHILRRRRRRRRHMKLPVLLNLEHydrophilic
260-283EDTRGHSRQPQKNKKDKWNLFPPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-166RRRRRRRRHMK
Subcellular Location(s) mito 8, nucl 5, cyto 4, plas 4, golg 3, extr 1, pero 1, E.R. 1
Family & Domain DBs
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG pbn:PADG_05263  -  
Amino Acid Sequences MSESVTTFNGTRCTKVRRTHHSNLSSLRVTKSSLPSQTAFKHHGASAAAPSFHTSSPGNPLPSISFSSNQVNLSSASMSSSHFNFTRISSSSSLSMEASTLASRTSMATGADMSAHNYQDPSNDEIVPLKRGAIIGGTVGVVVIFLIALVPFHILRRRRRRRRHMKLPVLLNLEKRSPLDEHTYRSSRHLERESGYSTRSMSVYSETGDLNRGEPLSPKLRRPHTRSLSNFLGHENESTDPILMQLEWMASQDVRRMGGEDTRGHSRQPQKNKKDKWNLFPPSTTREVVTRNPFNGRPMDVPNPFLDPPPVWEPGNTLQRPATPLYGFAQDSSRNSRGSTSFPPMPDVNRRIENSIPNPSRFVPLNFEFGMQAAQGAHGLVPLPLRSVAEPVPNPSTIRRNDSMSSQAHTNSTSSGSVIILPGRTSTSLSAVLVMTASDISWWRRNRSANELGFPSRRSYLFDFERRHSGLTDDNSTFGDTETSSFSEGVAEAVAIAPSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.56
3 0.63
4 0.66
5 0.74
6 0.79
7 0.83
8 0.81
9 0.8
10 0.76
11 0.73
12 0.68
13 0.61
14 0.54
15 0.45
16 0.41
17 0.41
18 0.43
19 0.43
20 0.42
21 0.44
22 0.43
23 0.48
24 0.51
25 0.5
26 0.48
27 0.43
28 0.41
29 0.37
30 0.38
31 0.34
32 0.3
33 0.3
34 0.28
35 0.26
36 0.22
37 0.25
38 0.24
39 0.22
40 0.23
41 0.18
42 0.17
43 0.25
44 0.29
45 0.29
46 0.26
47 0.28
48 0.28
49 0.3
50 0.32
51 0.26
52 0.23
53 0.24
54 0.3
55 0.31
56 0.29
57 0.27
58 0.24
59 0.22
60 0.21
61 0.19
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.14
68 0.16
69 0.16
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.22
74 0.21
75 0.25
76 0.22
77 0.24
78 0.25
79 0.24
80 0.24
81 0.19
82 0.17
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.11
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.15
107 0.18
108 0.19
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.22
113 0.24
114 0.23
115 0.2
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.1
121 0.09
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.03
137 0.04
138 0.04
139 0.07
140 0.13
141 0.19
142 0.3
143 0.42
144 0.53
145 0.63
146 0.74
147 0.84
148 0.9
149 0.94
150 0.96
151 0.95
152 0.94
153 0.91
154 0.86
155 0.81
156 0.76
157 0.67
158 0.59
159 0.5
160 0.41
161 0.34
162 0.29
163 0.25
164 0.19
165 0.2
166 0.24
167 0.25
168 0.28
169 0.33
170 0.36
171 0.35
172 0.37
173 0.41
174 0.36
175 0.4
176 0.4
177 0.36
178 0.35
179 0.38
180 0.38
181 0.32
182 0.3
183 0.24
184 0.2
185 0.19
186 0.17
187 0.13
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.14
203 0.2
204 0.23
205 0.27
206 0.34
207 0.43
208 0.51
209 0.57
210 0.63
211 0.63
212 0.69
213 0.67
214 0.67
215 0.62
216 0.55
217 0.48
218 0.38
219 0.33
220 0.24
221 0.21
222 0.15
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.12
246 0.15
247 0.14
248 0.16
249 0.21
250 0.21
251 0.2
252 0.26
253 0.34
254 0.38
255 0.47
256 0.55
257 0.6
258 0.7
259 0.78
260 0.82
261 0.84
262 0.83
263 0.8
264 0.8
265 0.76
266 0.68
267 0.63
268 0.55
269 0.49
270 0.46
271 0.38
272 0.28
273 0.25
274 0.26
275 0.29
276 0.34
277 0.32
278 0.3
279 0.34
280 0.34
281 0.34
282 0.32
283 0.29
284 0.24
285 0.25
286 0.3
287 0.27
288 0.28
289 0.26
290 0.28
291 0.25
292 0.23
293 0.2
294 0.14
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.17
299 0.17
300 0.2
301 0.25
302 0.34
303 0.3
304 0.28
305 0.26
306 0.28
307 0.3
308 0.28
309 0.24
310 0.15
311 0.17
312 0.17
313 0.2
314 0.18
315 0.17
316 0.18
317 0.17
318 0.19
319 0.25
320 0.25
321 0.23
322 0.23
323 0.25
324 0.24
325 0.27
326 0.29
327 0.29
328 0.3
329 0.3
330 0.33
331 0.32
332 0.34
333 0.37
334 0.36
335 0.34
336 0.36
337 0.37
338 0.36
339 0.39
340 0.41
341 0.37
342 0.44
343 0.43
344 0.39
345 0.41
346 0.38
347 0.39
348 0.34
349 0.31
350 0.28
351 0.26
352 0.3
353 0.27
354 0.27
355 0.23
356 0.21
357 0.2
358 0.13
359 0.11
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.12
375 0.13
376 0.19
377 0.2
378 0.23
379 0.25
380 0.26
381 0.27
382 0.28
383 0.34
384 0.32
385 0.38
386 0.36
387 0.38
388 0.38
389 0.4
390 0.42
391 0.37
392 0.35
393 0.31
394 0.3
395 0.27
396 0.26
397 0.23
398 0.18
399 0.18
400 0.15
401 0.13
402 0.12
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.15
416 0.15
417 0.15
418 0.14
419 0.13
420 0.11
421 0.1
422 0.08
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.08
427 0.13
428 0.21
429 0.25
430 0.3
431 0.37
432 0.44
433 0.49
434 0.55
435 0.61
436 0.58
437 0.59
438 0.59
439 0.58
440 0.54
441 0.5
442 0.45
443 0.39
444 0.35
445 0.35
446 0.35
447 0.38
448 0.43
449 0.5
450 0.52
451 0.52
452 0.6
453 0.56
454 0.53
455 0.45
456 0.39
457 0.37
458 0.37
459 0.4
460 0.32
461 0.32
462 0.31
463 0.31
464 0.29
465 0.22
466 0.18
467 0.11
468 0.12
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.15
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.12
477 0.09
478 0.08
479 0.06
480 0.07
481 0.07