Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E4S2D0

Protein Details
Accession A0A1E4S2D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
702-721NYLTKSIRIQQKQKRIVQLEHydrophilic
769-793GEQHVRHFGCKKPTKNNKLNILSMTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 9.832, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
Amino Acid Sequences MKQPFITQIAQSPLEGWPSSVLHTDKFTLVGTSDGHIVQYSDTLQLQTSIPVSRAPIEHISQISSNYVVLAGGEVTVYDETFDELEKLPFKDILALDVKHGKQPSLAIATKYTLIVYTYWDHLEMTAQHKFAEKLVAVKFVADGVIAASNTSFYRVNENDESTTKLDVPSSGFSILTKNVSILDSSQGIILSRGSSKLLYSKKLGPKRMTFTGDAQAIVEPFIIAKTGNHIHAYDIQRNKHWFTQKVDKLLLVATYDREIVTVSKTSISKFVLKPDKEIINSISDIQSAIDLISQMNYQEKHLKLRQLQVQLATDLFKRGDISSAMDKFIEFCACPLEVIELYPRYISQRDISISNEDELDKKSVELLTYFLSDCRRKISKLINAPENKLPYKNGSLTLDLFTDSNHSIDEIRTAVDTTLFKCYTLINPGLIGSLIRVDNHCDPQLVVTTLKKAHAVDELIDFYFKRGLHEEALHMLSDTSTDQVVKYLQRLKNDNLNLIMKYASPAIDKEEGYGIQIFINSPYSDEFDRYTVMKYLEKHDTLERMFLEYIVYELHEKATIFHTKLALLYLEKLQPDPDDLVYKKMYKFLQIGNYDKRNVLSKFPSSDSPSLILLKSFILSGMGLHKQVLDIQVNSLKKPALAIQYIREHNTQELFLELLSLLQRNNDKDSTLRLLSSTTTSTPISAVLDLMPSFKVHDLENYLTKSIRIQQKQKRIVQLEKNLLDVERVSTALDLMQKENQKVNVDQSTMCEICGRRIGGSVLLWDAGEQHVRHFGCKKPTKNNKLNILSMTDYDDEKDLVVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.2
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.24
11 0.26
12 0.23
13 0.23
14 0.22
15 0.17
16 0.16
17 0.17
18 0.15
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.17
40 0.19
41 0.2
42 0.22
43 0.25
44 0.26
45 0.29
46 0.29
47 0.3
48 0.27
49 0.28
50 0.24
51 0.2
52 0.18
53 0.13
54 0.12
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.16
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.23
79 0.21
80 0.23
81 0.26
82 0.25
83 0.26
84 0.33
85 0.34
86 0.33
87 0.34
88 0.29
89 0.25
90 0.27
91 0.29
92 0.29
93 0.31
94 0.27
95 0.28
96 0.29
97 0.29
98 0.27
99 0.22
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.16
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.24
117 0.24
118 0.22
119 0.25
120 0.2
121 0.22
122 0.24
123 0.27
124 0.24
125 0.24
126 0.23
127 0.17
128 0.17
129 0.1
130 0.08
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.18
142 0.19
143 0.25
144 0.28
145 0.31
146 0.31
147 0.31
148 0.34
149 0.28
150 0.28
151 0.23
152 0.2
153 0.18
154 0.16
155 0.17
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.16
162 0.17
163 0.16
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.18
185 0.22
186 0.24
187 0.27
188 0.35
189 0.44
190 0.51
191 0.58
192 0.57
193 0.6
194 0.63
195 0.66
196 0.61
197 0.55
198 0.5
199 0.48
200 0.42
201 0.35
202 0.29
203 0.23
204 0.19
205 0.16
206 0.13
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.09
214 0.12
215 0.14
216 0.15
217 0.15
218 0.17
219 0.24
220 0.29
221 0.32
222 0.35
223 0.36
224 0.4
225 0.43
226 0.44
227 0.44
228 0.46
229 0.44
230 0.45
231 0.54
232 0.53
233 0.55
234 0.53
235 0.46
236 0.4
237 0.35
238 0.28
239 0.19
240 0.15
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.17
255 0.19
256 0.23
257 0.23
258 0.32
259 0.38
260 0.38
261 0.4
262 0.42
263 0.44
264 0.38
265 0.39
266 0.31
267 0.25
268 0.25
269 0.23
270 0.18
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.09
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.17
287 0.19
288 0.25
289 0.29
290 0.35
291 0.36
292 0.42
293 0.47
294 0.45
295 0.46
296 0.41
297 0.39
298 0.33
299 0.29
300 0.24
301 0.17
302 0.14
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.13
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.16
317 0.14
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.16
339 0.17
340 0.18
341 0.18
342 0.17
343 0.16
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.19
363 0.21
364 0.2
365 0.26
366 0.32
367 0.35
368 0.43
369 0.47
370 0.5
371 0.5
372 0.52
373 0.5
374 0.46
375 0.39
376 0.32
377 0.28
378 0.23
379 0.24
380 0.22
381 0.21
382 0.19
383 0.2
384 0.2
385 0.19
386 0.17
387 0.14
388 0.12
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.13
407 0.13
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.13
412 0.16
413 0.16
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.08
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.1
426 0.12
427 0.14
428 0.15
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.15
433 0.13
434 0.12
435 0.1
436 0.12
437 0.13
438 0.14
439 0.15
440 0.13
441 0.13
442 0.14
443 0.14
444 0.12
445 0.13
446 0.14
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.09
451 0.12
452 0.11
453 0.11
454 0.12
455 0.14
456 0.16
457 0.17
458 0.17
459 0.16
460 0.17
461 0.15
462 0.13
463 0.11
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.08
473 0.09
474 0.13
475 0.21
476 0.23
477 0.28
478 0.33
479 0.35
480 0.41
481 0.42
482 0.39
483 0.34
484 0.34
485 0.29
486 0.25
487 0.23
488 0.14
489 0.14
490 0.12
491 0.1
492 0.08
493 0.09
494 0.12
495 0.14
496 0.14
497 0.14
498 0.15
499 0.14
500 0.15
501 0.15
502 0.11
503 0.08
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.1
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.12
516 0.13
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.16
521 0.18
522 0.18
523 0.23
524 0.27
525 0.27
526 0.28
527 0.28
528 0.3
529 0.28
530 0.29
531 0.24
532 0.21
533 0.2
534 0.18
535 0.16
536 0.11
537 0.11
538 0.08
539 0.08
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.08
545 0.09
546 0.14
547 0.17
548 0.17
549 0.19
550 0.19
551 0.18
552 0.19
553 0.18
554 0.15
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.15
559 0.15
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.16
564 0.16
565 0.14
566 0.18
567 0.18
568 0.22
569 0.23
570 0.27
571 0.25
572 0.29
573 0.28
574 0.26
575 0.29
576 0.3
577 0.36
578 0.38
579 0.43
580 0.46
581 0.49
582 0.47
583 0.44
584 0.41
585 0.39
586 0.35
587 0.35
588 0.32
589 0.33
590 0.35
591 0.36
592 0.4
593 0.39
594 0.39
595 0.35
596 0.32
597 0.29
598 0.27
599 0.25
600 0.2
601 0.15
602 0.13
603 0.12
604 0.1
605 0.08
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.1
610 0.12
611 0.12
612 0.12
613 0.12
614 0.12
615 0.13
616 0.16
617 0.15
618 0.13
619 0.16
620 0.22
621 0.23
622 0.23
623 0.24
624 0.2
625 0.17
626 0.18
627 0.2
628 0.2
629 0.23
630 0.24
631 0.29
632 0.36
633 0.39
634 0.41
635 0.38
636 0.34
637 0.32
638 0.32
639 0.26
640 0.19
641 0.17
642 0.14
643 0.12
644 0.11
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.09
649 0.08
650 0.12
651 0.16
652 0.18
653 0.23
654 0.23
655 0.23
656 0.24
657 0.29
658 0.31
659 0.29
660 0.27
661 0.22
662 0.23
663 0.23
664 0.24
665 0.21
666 0.16
667 0.17
668 0.17
669 0.17
670 0.16
671 0.16
672 0.15
673 0.12
674 0.12
675 0.09
676 0.11
677 0.1
678 0.11
679 0.1
680 0.09
681 0.11
682 0.12
683 0.13
684 0.12
685 0.16
686 0.2
687 0.23
688 0.29
689 0.3
690 0.29
691 0.28
692 0.28
693 0.27
694 0.31
695 0.36
696 0.4
697 0.48
698 0.56
699 0.67
700 0.76
701 0.8
702 0.81
703 0.79
704 0.8
705 0.79
706 0.79
707 0.78
708 0.7
709 0.65
710 0.56
711 0.48
712 0.4
713 0.31
714 0.23
715 0.15
716 0.14
717 0.12
718 0.11
719 0.11
720 0.12
721 0.16
722 0.15
723 0.17
724 0.23
725 0.27
726 0.3
727 0.35
728 0.37
729 0.37
730 0.37
731 0.42
732 0.41
733 0.39
734 0.36
735 0.35
736 0.38
737 0.34
738 0.32
739 0.29
740 0.25
741 0.27
742 0.32
743 0.3
744 0.23
745 0.25
746 0.26
747 0.24
748 0.25
749 0.22
750 0.17
751 0.16
752 0.15
753 0.13
754 0.13
755 0.12
756 0.16
757 0.15
758 0.15
759 0.23
760 0.23
761 0.29
762 0.32
763 0.37
764 0.43
765 0.53
766 0.6
767 0.63
768 0.74
769 0.8
770 0.85
771 0.88
772 0.87
773 0.85
774 0.81
775 0.72
776 0.66
777 0.58
778 0.49
779 0.44
780 0.35
781 0.29
782 0.25
783 0.23
784 0.18