Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QM36

Protein Details
Accession A0A1E3QM36    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-61ESDLKREIKKLQRFRDQIKTWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences RKLQQEIDRVFKRVNEGLATFTAIYDKFTYSEIPAQREKLESDLKREIKKLQRFRDQIKTWLSGNEVKDKKPLIEHRKLIEYEMERFKEVEKGMKIKSFSNEGLSMDLDPRQKLKHDACTFVQDSLEELEKQADTLEGQVDQLQAAVKKTRRDAAKQEQIAAIDEILQRNHWHQGRLEQVLKMLENSQLEPEQISEIQDDIQYFVESNQDPDFADDEGIYDELNLREIEEVGPEVVEAPKDAPPGLAPYAQKSLRSNTATPRVSTVLPSRASTPAPPGLSRQPTLMGTPLTGPVDPQPAPGVPVDVSTSLSNLLPALTAATKRLTRPQTMDEIKPVLENSLLNCPDSFDSEKPRLYKPSKPHPTPTNYPQEPLVDLLSGSQHAIFRKIDESTLFYLFYYNAGEYLQYIAAKELMTRGWLFHRELKTWFLKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.34
3 0.31
4 0.32
5 0.31
6 0.31
7 0.24
8 0.2
9 0.2
10 0.16
11 0.18
12 0.16
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.18
17 0.18
18 0.26
19 0.28
20 0.32
21 0.35
22 0.37
23 0.38
24 0.38
25 0.36
26 0.35
27 0.4
28 0.37
29 0.4
30 0.48
31 0.52
32 0.54
33 0.56
34 0.59
35 0.59
36 0.67
37 0.7
38 0.69
39 0.73
40 0.76
41 0.8
42 0.82
43 0.76
44 0.73
45 0.69
46 0.63
47 0.53
48 0.48
49 0.45
50 0.41
51 0.4
52 0.42
53 0.39
54 0.37
55 0.41
56 0.41
57 0.39
58 0.41
59 0.49
60 0.49
61 0.55
62 0.59
63 0.58
64 0.64
65 0.62
66 0.55
67 0.52
68 0.45
69 0.42
70 0.45
71 0.42
72 0.36
73 0.35
74 0.35
75 0.33
76 0.31
77 0.31
78 0.28
79 0.31
80 0.34
81 0.37
82 0.38
83 0.36
84 0.38
85 0.36
86 0.32
87 0.31
88 0.3
89 0.26
90 0.26
91 0.23
92 0.21
93 0.16
94 0.19
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.2
100 0.27
101 0.31
102 0.38
103 0.39
104 0.43
105 0.43
106 0.48
107 0.47
108 0.4
109 0.35
110 0.24
111 0.22
112 0.19
113 0.19
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.16
134 0.18
135 0.22
136 0.24
137 0.3
138 0.33
139 0.37
140 0.45
141 0.49
142 0.56
143 0.53
144 0.53
145 0.48
146 0.44
147 0.4
148 0.31
149 0.2
150 0.14
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.19
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.24
162 0.29
163 0.33
164 0.33
165 0.27
166 0.27
167 0.26
168 0.25
169 0.2
170 0.16
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.12
235 0.15
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.22
240 0.24
241 0.27
242 0.3
243 0.3
244 0.31
245 0.39
246 0.38
247 0.37
248 0.36
249 0.32
250 0.28
251 0.29
252 0.27
253 0.24
254 0.23
255 0.24
256 0.23
257 0.23
258 0.24
259 0.22
260 0.22
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.22
265 0.27
266 0.3
267 0.3
268 0.27
269 0.24
270 0.24
271 0.24
272 0.23
273 0.16
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.14
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.1
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.13
308 0.15
309 0.17
310 0.25
311 0.28
312 0.31
313 0.35
314 0.38
315 0.44
316 0.47
317 0.47
318 0.43
319 0.4
320 0.36
321 0.33
322 0.29
323 0.2
324 0.17
325 0.15
326 0.13
327 0.2
328 0.2
329 0.2
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.24
334 0.26
335 0.2
336 0.27
337 0.32
338 0.36
339 0.38
340 0.41
341 0.46
342 0.47
343 0.52
344 0.54
345 0.6
346 0.67
347 0.7
348 0.74
349 0.73
350 0.77
351 0.77
352 0.76
353 0.76
354 0.67
355 0.63
356 0.57
357 0.49
358 0.42
359 0.36
360 0.28
361 0.17
362 0.15
363 0.14
364 0.13
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.17
371 0.17
372 0.18
373 0.2
374 0.21
375 0.21
376 0.21
377 0.24
378 0.24
379 0.25
380 0.23
381 0.2
382 0.2
383 0.18
384 0.17
385 0.15
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.12
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.21
405 0.25
406 0.29
407 0.35
408 0.4
409 0.4
410 0.42
411 0.47