Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GDB7

Protein Details
Accession C1GDB7    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-165GDSPRSSGSHRTRSRRSRNCNSDDDMHydrophilic
233-284ADVLQRARSRHRSKSRRRAESLDRGRDHNREHRHRHRRHRSRSSPDSRVKTLBasic
312-333GNSNHGRRSRSRRRRGSESGSDBasic
358-382LIERARSKSRSRKGERSRSRIRQGLHydrophilic
471-490ESSFRRRSRHRSVSRSHSRNHydrophilic
508-530HDGGRKHRSSRHKERSRSRTRDLBasic
545-568REYTQRQERKKAEKGRRKYARDHDBasic
797-820GLDRSRLRFHSRPHHRLRTHTSYHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-278RARSRHRSKSRRRAESLDRGRDHNREHRHRHRRHRSRSSPD
301-349ARKKSQRSEKAGNSNHGRRSRSRRRRGSESGSDNGRNPAHRNKRMAEAG
356-379AGLIERARSKSRSRKGERSRSRIR
404-405KK
412-417RHHRHR
511-526GRKHRSSRHKERSRSR
552-562ERKKAEKGRRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024436  DUF3824  
KEGG pbn:PADG_05253  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12868  DUF3824  
Amino Acid Sequences MASSYRDSNWDEADRQSEQRYYSVKRYVIPSEQSSMYRRDGPAMSERELTIRPHHDRDDRYNYEYRREKDYDQVYRASSHAPSHHESDYQLVSRPDTDERWALRSPRDPRDDDYYYSRSTREYDDGRHHYDEYEERYYAGDSPRSSGSHRTRSRRSRNCNSDDDMVYSRRGRYYRDESPHHYKRHLAEGALVGVGAAELVRHRSKKRDGEEESSALSRIGTDVGAGALGAVAADVLQRARSRHRSKSRRRAESLDRGRDHNREHRHRHRRHRSRSSPDSRVKTLAGLGLGAAAIAGAVALARKKSQRSEKAGNSNHGRRSRSRRRRGSESGSDNGRNPAHRNKRMAEAGLAGAAVAGLIERARSKSRSRKGERSRSRIRQGLPIAAASLGSAAIAGLYEKHKEKKENESSERHHRHRSRSRSVAPSSAYSDPSGSAPQLIEYGDDPVYGSIPTNHYYGRPSSRQSSPRAIESSFRRRSRHRSVSRSHSRNQHRYRDGGSGSNSSFSDHDGGRKHRSSRHKERSRSRTRDLATAGLAAAGAGLAAREYTQRQERKKAEKGRRKYARDHDYTDSYEEGYDPVPHVPSPPPNGANYYPHSNHFPPPPGSTPVPPNHQGGPYNPADYPPSPGAPPMTQANYSYPPPPPPAADPYSPRSINGEENVSAVPTPNPTLSHEQRHMSSEGIMATASRQLLLPSTHPVSGAGAQSATTLGYSASPFAPTPPPLSTSPQPIPTSRNLFNTFSRPRSSSQPASIPAKSVQFDLRPHYASSPSTDRRARIPTGENQGYETDDSDSTMDGLDRSRLRFHSRPHHRLRTHTSYHPHQSTASPASIPFPPTPSFPRTTSATPQHSSDKTHTRVHNNNLDVESDSTIELSDRFDARGHRLLVPWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.38
4 0.36
5 0.33
6 0.37
7 0.4
8 0.41
9 0.46
10 0.5
11 0.48
12 0.49
13 0.53
14 0.53
15 0.54
16 0.54
17 0.5
18 0.47
19 0.47
20 0.47
21 0.45
22 0.43
23 0.39
24 0.39
25 0.36
26 0.37
27 0.35
28 0.36
29 0.41
30 0.41
31 0.4
32 0.37
33 0.36
34 0.34
35 0.35
36 0.34
37 0.33
38 0.37
39 0.4
40 0.44
41 0.51
42 0.55
43 0.59
44 0.66
45 0.68
46 0.65
47 0.65
48 0.67
49 0.62
50 0.64
51 0.66
52 0.6
53 0.58
54 0.57
55 0.54
56 0.55
57 0.62
58 0.61
59 0.56
60 0.57
61 0.5
62 0.47
63 0.46
64 0.4
65 0.33
66 0.29
67 0.29
68 0.31
69 0.33
70 0.36
71 0.36
72 0.35
73 0.33
74 0.32
75 0.32
76 0.28
77 0.29
78 0.25
79 0.25
80 0.25
81 0.27
82 0.26
83 0.24
84 0.26
85 0.29
86 0.3
87 0.33
88 0.36
89 0.37
90 0.4
91 0.46
92 0.5
93 0.53
94 0.58
95 0.56
96 0.57
97 0.62
98 0.59
99 0.54
100 0.54
101 0.48
102 0.44
103 0.43
104 0.39
105 0.32
106 0.31
107 0.31
108 0.31
109 0.32
110 0.35
111 0.43
112 0.49
113 0.53
114 0.53
115 0.49
116 0.42
117 0.42
118 0.4
119 0.37
120 0.35
121 0.3
122 0.27
123 0.27
124 0.28
125 0.27
126 0.26
127 0.24
128 0.2
129 0.23
130 0.26
131 0.27
132 0.28
133 0.34
134 0.39
135 0.45
136 0.53
137 0.59
138 0.66
139 0.76
140 0.85
141 0.85
142 0.87
143 0.87
144 0.89
145 0.87
146 0.83
147 0.77
148 0.72
149 0.63
150 0.57
151 0.49
152 0.41
153 0.38
154 0.34
155 0.31
156 0.3
157 0.3
158 0.29
159 0.34
160 0.41
161 0.47
162 0.52
163 0.57
164 0.59
165 0.68
166 0.73
167 0.69
168 0.63
169 0.59
170 0.54
171 0.57
172 0.51
173 0.41
174 0.36
175 0.33
176 0.32
177 0.26
178 0.22
179 0.12
180 0.1
181 0.09
182 0.05
183 0.03
184 0.02
185 0.03
186 0.08
187 0.13
188 0.18
189 0.21
190 0.29
191 0.38
192 0.47
193 0.53
194 0.59
195 0.61
196 0.63
197 0.66
198 0.6
199 0.53
200 0.44
201 0.38
202 0.28
203 0.21
204 0.15
205 0.1
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.03
222 0.03
223 0.06
224 0.08
225 0.1
226 0.18
227 0.29
228 0.36
229 0.47
230 0.58
231 0.66
232 0.76
233 0.85
234 0.88
235 0.87
236 0.86
237 0.83
238 0.82
239 0.82
240 0.81
241 0.79
242 0.71
243 0.66
244 0.65
245 0.62
246 0.58
247 0.56
248 0.56
249 0.56
250 0.64
251 0.71
252 0.77
253 0.82
254 0.88
255 0.9
256 0.91
257 0.92
258 0.93
259 0.92
260 0.91
261 0.93
262 0.9
263 0.88
264 0.86
265 0.81
266 0.72
267 0.65
268 0.55
269 0.45
270 0.37
271 0.28
272 0.2
273 0.13
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.04
279 0.02
280 0.02
281 0.02
282 0.02
283 0.01
284 0.01
285 0.02
286 0.03
287 0.04
288 0.07
289 0.1
290 0.13
291 0.21
292 0.31
293 0.4
294 0.47
295 0.56
296 0.62
297 0.69
298 0.71
299 0.71
300 0.69
301 0.66
302 0.65
303 0.62
304 0.58
305 0.55
306 0.61
307 0.65
308 0.69
309 0.73
310 0.76
311 0.78
312 0.83
313 0.84
314 0.82
315 0.79
316 0.74
317 0.68
318 0.62
319 0.56
320 0.48
321 0.44
322 0.37
323 0.3
324 0.28
325 0.34
326 0.39
327 0.44
328 0.48
329 0.46
330 0.51
331 0.51
332 0.48
333 0.39
334 0.3
335 0.24
336 0.19
337 0.16
338 0.1
339 0.07
340 0.05
341 0.04
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.02
346 0.03
347 0.04
348 0.06
349 0.09
350 0.13
351 0.2
352 0.3
353 0.39
354 0.49
355 0.57
356 0.65
357 0.73
358 0.81
359 0.84
360 0.83
361 0.85
362 0.83
363 0.81
364 0.76
365 0.68
366 0.64
367 0.57
368 0.51
369 0.41
370 0.33
371 0.26
372 0.2
373 0.18
374 0.1
375 0.08
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.02
380 0.02
381 0.02
382 0.02
383 0.03
384 0.05
385 0.07
386 0.1
387 0.15
388 0.18
389 0.24
390 0.28
391 0.37
392 0.46
393 0.53
394 0.56
395 0.59
396 0.61
397 0.67
398 0.71
399 0.64
400 0.64
401 0.61
402 0.65
403 0.68
404 0.72
405 0.69
406 0.7
407 0.72
408 0.69
409 0.66
410 0.6
411 0.51
412 0.44
413 0.39
414 0.32
415 0.27
416 0.2
417 0.18
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.07
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.12
444 0.15
445 0.19
446 0.2
447 0.21
448 0.25
449 0.32
450 0.36
451 0.39
452 0.43
453 0.4
454 0.41
455 0.4
456 0.36
457 0.34
458 0.37
459 0.42
460 0.43
461 0.46
462 0.46
463 0.49
464 0.57
465 0.63
466 0.66
467 0.65
468 0.65
469 0.68
470 0.75
471 0.8
472 0.76
473 0.71
474 0.7
475 0.7
476 0.72
477 0.73
478 0.72
479 0.65
480 0.62
481 0.6
482 0.55
483 0.47
484 0.4
485 0.35
486 0.28
487 0.25
488 0.24
489 0.21
490 0.17
491 0.16
492 0.13
493 0.14
494 0.11
495 0.15
496 0.18
497 0.22
498 0.27
499 0.31
500 0.33
501 0.38
502 0.49
503 0.55
504 0.62
505 0.69
506 0.72
507 0.77
508 0.84
509 0.88
510 0.89
511 0.86
512 0.79
513 0.76
514 0.68
515 0.64
516 0.55
517 0.46
518 0.36
519 0.28
520 0.24
521 0.15
522 0.13
523 0.07
524 0.05
525 0.03
526 0.02
527 0.02
528 0.02
529 0.02
530 0.02
531 0.02
532 0.04
533 0.05
534 0.1
535 0.18
536 0.25
537 0.3
538 0.39
539 0.47
540 0.55
541 0.63
542 0.7
543 0.73
544 0.76
545 0.8
546 0.82
547 0.84
548 0.8
549 0.8
550 0.8
551 0.79
552 0.74
553 0.7
554 0.64
555 0.58
556 0.54
557 0.47
558 0.37
559 0.27
560 0.22
561 0.17
562 0.13
563 0.1
564 0.09
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.11
570 0.13
571 0.17
572 0.21
573 0.24
574 0.25
575 0.25
576 0.29
577 0.29
578 0.31
579 0.3
580 0.32
581 0.29
582 0.3
583 0.34
584 0.32
585 0.34
586 0.34
587 0.36
588 0.32
589 0.35
590 0.36
591 0.35
592 0.35
593 0.34
594 0.37
595 0.36
596 0.39
597 0.38
598 0.37
599 0.34
600 0.35
601 0.34
602 0.29
603 0.3
604 0.26
605 0.26
606 0.23
607 0.22
608 0.22
609 0.21
610 0.24
611 0.2
612 0.2
613 0.18
614 0.19
615 0.21
616 0.18
617 0.19
618 0.18
619 0.19
620 0.18
621 0.2
622 0.23
623 0.23
624 0.24
625 0.25
626 0.23
627 0.23
628 0.26
629 0.26
630 0.24
631 0.25
632 0.3
633 0.31
634 0.33
635 0.34
636 0.36
637 0.41
638 0.39
639 0.36
640 0.33
641 0.31
642 0.31
643 0.29
644 0.27
645 0.2
646 0.22
647 0.21
648 0.18
649 0.15
650 0.13
651 0.11
652 0.09
653 0.11
654 0.11
655 0.12
656 0.16
657 0.24
658 0.29
659 0.35
660 0.38
661 0.39
662 0.4
663 0.42
664 0.39
665 0.31
666 0.27
667 0.21
668 0.17
669 0.15
670 0.13
671 0.09
672 0.08
673 0.1
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.11
679 0.12
680 0.13
681 0.16
682 0.19
683 0.19
684 0.19
685 0.19
686 0.18
687 0.2
688 0.19
689 0.14
690 0.12
691 0.11
692 0.11
693 0.11
694 0.09
695 0.06
696 0.05
697 0.05
698 0.06
699 0.06
700 0.08
701 0.08
702 0.09
703 0.1
704 0.12
705 0.17
706 0.17
707 0.2
708 0.2
709 0.23
710 0.25
711 0.31
712 0.31
713 0.35
714 0.38
715 0.42
716 0.42
717 0.41
718 0.43
719 0.44
720 0.48
721 0.43
722 0.47
723 0.44
724 0.45
725 0.47
726 0.52
727 0.51
728 0.48
729 0.5
730 0.45
731 0.43
732 0.48
733 0.52
734 0.49
735 0.48
736 0.49
737 0.5
738 0.54
739 0.51
740 0.46
741 0.41
742 0.39
743 0.35
744 0.31
745 0.3
746 0.28
747 0.31
748 0.34
749 0.36
750 0.34
751 0.35
752 0.35
753 0.34
754 0.3
755 0.33
756 0.36
757 0.36
758 0.41
759 0.44
760 0.43
761 0.46
762 0.51
763 0.48
764 0.45
765 0.47
766 0.47
767 0.52
768 0.55
769 0.49
770 0.45
771 0.43
772 0.38
773 0.33
774 0.27
775 0.19
776 0.15
777 0.16
778 0.14
779 0.13
780 0.11
781 0.11
782 0.1
783 0.08
784 0.09
785 0.15
786 0.17
787 0.2
788 0.25
789 0.28
790 0.36
791 0.42
792 0.49
793 0.54
794 0.62
795 0.7
796 0.76
797 0.82
798 0.78
799 0.82
800 0.83
801 0.81
802 0.77
803 0.75
804 0.72
805 0.71
806 0.76
807 0.7
808 0.62
809 0.54
810 0.5
811 0.48
812 0.44
813 0.37
814 0.28
815 0.26
816 0.27
817 0.28
818 0.3
819 0.24
820 0.24
821 0.24
822 0.27
823 0.33
824 0.36
825 0.37
826 0.36
827 0.38
828 0.4
829 0.43
830 0.48
831 0.51
832 0.53
833 0.51
834 0.53
835 0.56
836 0.54
837 0.54
838 0.53
839 0.53
840 0.51
841 0.57
842 0.61
843 0.63
844 0.69
845 0.72
846 0.73
847 0.66
848 0.66
849 0.59
850 0.53
851 0.45
852 0.39
853 0.31
854 0.23
855 0.2
856 0.15
857 0.14
858 0.13
859 0.11
860 0.11
861 0.14
862 0.14
863 0.15
864 0.18
865 0.22
866 0.28
867 0.35
868 0.35
869 0.34