Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1G279

Protein Details
Accession C1G279    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-102LSRFRDSDAQKKRPVEKRKLQNHYLNFIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR019458  Est1-like_N  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG pbn:PADG_02245  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10374  EST1  
PF10373  EST1_DNA_bind  
Amino Acid Sequences MLSSELDGEKDLLNALAEKEPTFAEIDDCLAKFRIACQNAIFQCFENGTESASLSVERRLWEIHVKINTRFRKLLSRFRDSDAQKKRPVEKRKLQNHYLNFIKSSQRFYRGYIQHLVSRFNIIPELDKLAKELKFETLSTDDKPDISEDLRKAVLLTCHATLIRLGDLSRYREMELVPPTKNRNWDRAVRFYKLADMNNPDSGMSHNQLAVIGLADGNHLQATYHLYRALSAQEPNPTSNGNLEIEFKKVLAAWAKGELIANSKDEKTSLISSFVYLHAQCYKGVDFPEHDELENEILSQIAVDLKELSLPLHLLQKVCLINIAAENYANARRTNGKEKDGVEPARDAGLFFQRLNVKTFFTLLQILVAELECSAAANESEKISPVAQCVLPSLRHYSSWLLSNSGSLICEDQDTPLYVQIKEFWKMYASTLSLLTSSFDVPSLSEVSYLLHEDEDTLGFCPLVNDVTWRRYFNEHGQKKPRSDDVKEKQPVHIEMLFRVREFVIDGLDLVVQEKIPIILAENNETKLFVYKEEGLPQFSSPSGGHHHSLSSTRIDREDIRPLESNSGVMEYATSQSASASISFAMNQMVDNLVESESTESCPPMERTLSSSTAWQNANLNNANANRGTPQRDSGEPSGNSNDTGTGTGTFHPYSPIIEAEAPKSYSPRPALPSILNTPFAPQPGEAISPATRPSTAMRQRDQCQHTIGAINAASNNIGGSYPQPQDFPLQQQYVMGYQNNLQLPSNPHDYAYATRSISPTQTQTSSFQYNNDGGYSSRPLPMAMQQAPPSLPISGFVDNNINFYQFNERVFGQPSSPYYPRSSPYVPGSSVNSNTAGVSGPTPPCGRGFGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.15
4 0.16
5 0.16
6 0.17
7 0.16
8 0.17
9 0.17
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.15
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.22
21 0.29
22 0.28
23 0.3
24 0.31
25 0.39
26 0.41
27 0.44
28 0.4
29 0.31
30 0.31
31 0.29
32 0.28
33 0.22
34 0.19
35 0.17
36 0.17
37 0.16
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.21
48 0.28
49 0.3
50 0.34
51 0.39
52 0.42
53 0.47
54 0.56
55 0.6
56 0.58
57 0.58
58 0.54
59 0.57
60 0.6
61 0.64
62 0.62
63 0.65
64 0.61
65 0.63
66 0.69
67 0.63
68 0.66
69 0.66
70 0.66
71 0.64
72 0.69
73 0.73
74 0.74
75 0.8
76 0.81
77 0.8
78 0.83
79 0.86
80 0.87
81 0.87
82 0.86
83 0.82
84 0.79
85 0.75
86 0.67
87 0.58
88 0.53
89 0.53
90 0.46
91 0.48
92 0.45
93 0.46
94 0.45
95 0.47
96 0.54
97 0.49
98 0.52
99 0.51
100 0.48
101 0.46
102 0.47
103 0.45
104 0.36
105 0.37
106 0.32
107 0.26
108 0.25
109 0.21
110 0.22
111 0.2
112 0.26
113 0.22
114 0.22
115 0.23
116 0.26
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.24
121 0.25
122 0.25
123 0.27
124 0.26
125 0.27
126 0.27
127 0.3
128 0.25
129 0.23
130 0.24
131 0.21
132 0.19
133 0.19
134 0.23
135 0.2
136 0.23
137 0.23
138 0.22
139 0.21
140 0.22
141 0.22
142 0.19
143 0.2
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.17
149 0.16
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.14
154 0.19
155 0.22
156 0.25
157 0.25
158 0.25
159 0.25
160 0.26
161 0.27
162 0.3
163 0.31
164 0.3
165 0.34
166 0.39
167 0.41
168 0.49
169 0.47
170 0.48
171 0.49
172 0.55
173 0.57
174 0.62
175 0.64
176 0.59
177 0.57
178 0.5
179 0.51
180 0.47
181 0.42
182 0.37
183 0.38
184 0.37
185 0.36
186 0.36
187 0.28
188 0.24
189 0.24
190 0.23
191 0.18
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.08
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.19
217 0.15
218 0.16
219 0.17
220 0.22
221 0.24
222 0.24
223 0.25
224 0.22
225 0.2
226 0.19
227 0.2
228 0.15
229 0.14
230 0.17
231 0.17
232 0.18
233 0.17
234 0.16
235 0.13
236 0.12
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.14
241 0.16
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.13
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.18
275 0.24
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.2
280 0.19
281 0.17
282 0.13
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.18
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.17
320 0.21
321 0.31
322 0.34
323 0.35
324 0.38
325 0.4
326 0.43
327 0.44
328 0.41
329 0.33
330 0.29
331 0.26
332 0.23
333 0.21
334 0.15
335 0.1
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.16
340 0.19
341 0.2
342 0.24
343 0.23
344 0.2
345 0.19
346 0.2
347 0.17
348 0.14
349 0.14
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.17
384 0.17
385 0.17
386 0.2
387 0.19
388 0.16
389 0.15
390 0.15
391 0.14
392 0.12
393 0.11
394 0.07
395 0.07
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.11
407 0.14
408 0.16
409 0.16
410 0.16
411 0.14
412 0.13
413 0.14
414 0.15
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.08
437 0.07
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.07
453 0.09
454 0.14
455 0.16
456 0.17
457 0.18
458 0.2
459 0.24
460 0.3
461 0.39
462 0.41
463 0.47
464 0.56
465 0.59
466 0.59
467 0.59
468 0.58
469 0.53
470 0.52
471 0.54
472 0.52
473 0.58
474 0.61
475 0.59
476 0.54
477 0.51
478 0.48
479 0.41
480 0.37
481 0.27
482 0.23
483 0.27
484 0.25
485 0.21
486 0.21
487 0.17
488 0.14
489 0.14
490 0.12
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.08
507 0.09
508 0.12
509 0.14
510 0.15
511 0.14
512 0.15
513 0.14
514 0.14
515 0.13
516 0.1
517 0.12
518 0.14
519 0.16
520 0.21
521 0.22
522 0.21
523 0.22
524 0.21
525 0.19
526 0.16
527 0.17
528 0.11
529 0.13
530 0.15
531 0.17
532 0.18
533 0.17
534 0.18
535 0.17
536 0.19
537 0.19
538 0.19
539 0.19
540 0.19
541 0.2
542 0.22
543 0.24
544 0.25
545 0.32
546 0.28
547 0.3
548 0.31
549 0.31
550 0.32
551 0.29
552 0.26
553 0.17
554 0.16
555 0.13
556 0.1
557 0.09
558 0.06
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.12
590 0.13
591 0.14
592 0.16
593 0.15
594 0.19
595 0.23
596 0.25
597 0.22
598 0.25
599 0.24
600 0.28
601 0.28
602 0.25
603 0.25
604 0.24
605 0.29
606 0.27
607 0.25
608 0.24
609 0.24
610 0.25
611 0.21
612 0.21
613 0.18
614 0.2
615 0.24
616 0.21
617 0.25
618 0.26
619 0.28
620 0.33
621 0.34
622 0.38
623 0.34
624 0.35
625 0.35
626 0.33
627 0.31
628 0.25
629 0.22
630 0.15
631 0.15
632 0.13
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.14
637 0.14
638 0.13
639 0.14
640 0.14
641 0.14
642 0.14
643 0.13
644 0.12
645 0.15
646 0.16
647 0.16
648 0.19
649 0.19
650 0.18
651 0.2
652 0.2
653 0.24
654 0.26
655 0.29
656 0.31
657 0.32
658 0.36
659 0.35
660 0.39
661 0.39
662 0.39
663 0.35
664 0.31
665 0.3
666 0.28
667 0.27
668 0.23
669 0.16
670 0.15
671 0.15
672 0.17
673 0.14
674 0.16
675 0.15
676 0.15
677 0.17
678 0.17
679 0.15
680 0.15
681 0.18
682 0.26
683 0.33
684 0.39
685 0.45
686 0.51
687 0.57
688 0.66
689 0.66
690 0.59
691 0.54
692 0.49
693 0.43
694 0.38
695 0.33
696 0.26
697 0.22
698 0.19
699 0.16
700 0.15
701 0.13
702 0.1
703 0.1
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.07
708 0.13
709 0.15
710 0.16
711 0.17
712 0.18
713 0.23
714 0.26
715 0.31
716 0.32
717 0.31
718 0.3
719 0.31
720 0.31
721 0.29
722 0.29
723 0.23
724 0.17
725 0.18
726 0.24
727 0.25
728 0.25
729 0.22
730 0.24
731 0.28
732 0.32
733 0.35
734 0.3
735 0.28
736 0.28
737 0.3
738 0.3
739 0.28
740 0.28
741 0.23
742 0.25
743 0.27
744 0.27
745 0.28
746 0.28
747 0.29
748 0.29
749 0.3
750 0.3
751 0.31
752 0.36
753 0.38
754 0.35
755 0.33
756 0.33
757 0.32
758 0.31
759 0.28
760 0.23
761 0.18
762 0.21
763 0.24
764 0.22
765 0.22
766 0.21
767 0.21
768 0.22
769 0.27
770 0.31
771 0.3
772 0.33
773 0.33
774 0.35
775 0.35
776 0.34
777 0.3
778 0.23
779 0.19
780 0.16
781 0.19
782 0.19
783 0.19
784 0.19
785 0.25
786 0.24
787 0.28
788 0.26
789 0.23
790 0.2
791 0.21
792 0.29
793 0.23
794 0.25
795 0.24
796 0.25
797 0.27
798 0.31
799 0.31
800 0.24
801 0.26
802 0.3
803 0.34
804 0.35
805 0.36
806 0.37
807 0.4
808 0.41
809 0.44
810 0.42
811 0.41
812 0.46
813 0.48
814 0.44
815 0.43
816 0.45
817 0.43
818 0.43
819 0.39
820 0.33
821 0.28
822 0.26
823 0.23
824 0.19
825 0.15
826 0.14
827 0.17
828 0.17
829 0.21
830 0.22
831 0.23
832 0.24