Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QR54

Protein Details
Accession A0A1E3QR54    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-70QSQKRSKPEGSQAPKKKVRRVRDDDRELSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-60RSKPEGSQAPKKKVRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDNELSPPNDDNSDFSDLSDVDEEQVLEDDVAQDLIRDLQSQKRSKPEGSQAPKKKVRRVRDDDRELSARGLRDEDEGDYAPVMGTQEGLRGIHAKMDAALRGNKTSRRKKDEHDLEQIQDELIDNLRRRMTDAARQDAEAVEKGEIAANKLSLLPEVRDVLLRSNYAVAILDNNLLDAVRLWLEPLPDRSLPAYEIQKTLLSAVQNLPISTDHLSASGLGKIMVFYQRSKKVEPALKKIAESLIGEWTRPIMKKSDNYRNKQIETTDFDVNKFLNNYALNKNKLTAAAESEQKTLYQESAERRKRAAAPTARSTAYKIAPKVDLSSLRSNKPNEIGSGALKGETYRNINSRLQSLGGRKKTTKKGGVSIEGRGVKLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.24
4 0.25
5 0.22
6 0.24
7 0.23
8 0.18
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.13
27 0.2
28 0.3
29 0.36
30 0.41
31 0.48
32 0.53
33 0.55
34 0.6
35 0.63
36 0.65
37 0.68
38 0.73
39 0.73
40 0.78
41 0.84
42 0.83
43 0.83
44 0.81
45 0.82
46 0.82
47 0.82
48 0.83
49 0.84
50 0.87
51 0.81
52 0.78
53 0.71
54 0.61
55 0.54
56 0.46
57 0.37
58 0.28
59 0.26
60 0.2
61 0.19
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.12
82 0.13
83 0.11
84 0.12
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.19
89 0.18
90 0.22
91 0.25
92 0.31
93 0.39
94 0.48
95 0.55
96 0.6
97 0.63
98 0.66
99 0.73
100 0.77
101 0.74
102 0.73
103 0.66
104 0.59
105 0.55
106 0.49
107 0.37
108 0.27
109 0.2
110 0.11
111 0.1
112 0.13
113 0.12
114 0.15
115 0.16
116 0.16
117 0.18
118 0.22
119 0.24
120 0.27
121 0.33
122 0.36
123 0.36
124 0.36
125 0.34
126 0.3
127 0.28
128 0.21
129 0.16
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.1
213 0.1
214 0.12
215 0.19
216 0.26
217 0.29
218 0.3
219 0.33
220 0.37
221 0.43
222 0.47
223 0.48
224 0.5
225 0.48
226 0.47
227 0.45
228 0.38
229 0.33
230 0.27
231 0.2
232 0.19
233 0.18
234 0.18
235 0.16
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.15
241 0.2
242 0.28
243 0.37
244 0.47
245 0.53
246 0.58
247 0.67
248 0.7
249 0.67
250 0.63
251 0.57
252 0.51
253 0.48
254 0.46
255 0.42
256 0.36
257 0.34
258 0.33
259 0.3
260 0.27
261 0.21
262 0.17
263 0.15
264 0.16
265 0.2
266 0.26
267 0.33
268 0.33
269 0.33
270 0.34
271 0.31
272 0.31
273 0.29
274 0.22
275 0.2
276 0.21
277 0.26
278 0.27
279 0.27
280 0.25
281 0.24
282 0.24
283 0.2
284 0.17
285 0.14
286 0.16
287 0.24
288 0.34
289 0.42
290 0.43
291 0.43
292 0.49
293 0.52
294 0.54
295 0.55
296 0.53
297 0.52
298 0.57
299 0.6
300 0.55
301 0.51
302 0.47
303 0.43
304 0.4
305 0.39
306 0.34
307 0.34
308 0.35
309 0.36
310 0.36
311 0.36
312 0.36
313 0.35
314 0.44
315 0.45
316 0.47
317 0.52
318 0.52
319 0.5
320 0.5
321 0.46
322 0.38
323 0.36
324 0.33
325 0.28
326 0.29
327 0.25
328 0.2
329 0.17
330 0.17
331 0.17
332 0.19
333 0.22
334 0.25
335 0.29
336 0.34
337 0.39
338 0.4
339 0.4
340 0.37
341 0.35
342 0.36
343 0.41
344 0.46
345 0.49
346 0.53
347 0.57
348 0.65
349 0.72
350 0.76
351 0.76
352 0.72
353 0.73
354 0.74
355 0.77
356 0.71
357 0.65
358 0.63
359 0.57