Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GKV2

Protein Details
Accession C1GKV2    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-306TGTGTVPKKKRLNTPKKYSSNKSTPPSHydrophilic
340-359TTTSTSSKKKLNPPEGKTGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-289K
347-368KKKLNPPEGKTGKLKRNEIKDR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013246  SAGA_su_Sgf11  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG pbn:PADG_07959  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08209  Sgf11  
Amino Acid Sequences MASIPETDNTIPSATMSKLARSLLDDTIYNIIHDIVAEVHREEKIARMRSAVVLAKKLGEEEAARIQANEPRESESGTVSTIVNKKVNKTVRVETDGAIYDNGKVYLKGNPLQTTKEILCPNCFLPRLLYPLTGVGARPPPDPCKEYCKKHPPIIMPGHDVHGNPFATDKINRKKKQQPQHQTTANTPASSPPSTPSTPANSFKQVTTEKISFPTVKCPNCPRYFVVTRVAQHLDRCLGLSGRQTKRILTPLESGTSTPVPPPMKPSNLKRSLPNGDDETGTGTVPKKKRLNTPKKYSSNKSTPPSKLKNGTTPDMAAAIEFAAPTPASTFGGDGDSGSTTTSTSSKKKLNPPEGKTGKLKRNEIKDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.19
3 0.19
4 0.2
5 0.22
6 0.23
7 0.24
8 0.24
9 0.27
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.22
14 0.25
15 0.24
16 0.2
17 0.17
18 0.14
19 0.12
20 0.12
21 0.1
22 0.08
23 0.09
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.14
30 0.19
31 0.26
32 0.31
33 0.31
34 0.31
35 0.33
36 0.34
37 0.39
38 0.37
39 0.32
40 0.29
41 0.29
42 0.28
43 0.26
44 0.25
45 0.2
46 0.17
47 0.14
48 0.15
49 0.19
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.22
55 0.25
56 0.24
57 0.2
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.23
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.17
66 0.12
67 0.17
68 0.2
69 0.23
70 0.26
71 0.27
72 0.29
73 0.37
74 0.43
75 0.43
76 0.45
77 0.47
78 0.49
79 0.53
80 0.51
81 0.43
82 0.4
83 0.35
84 0.3
85 0.24
86 0.18
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.14
94 0.18
95 0.21
96 0.24
97 0.28
98 0.3
99 0.32
100 0.32
101 0.32
102 0.29
103 0.31
104 0.31
105 0.28
106 0.28
107 0.28
108 0.28
109 0.29
110 0.28
111 0.22
112 0.21
113 0.22
114 0.25
115 0.24
116 0.22
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.15
121 0.13
122 0.11
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.21
128 0.24
129 0.27
130 0.26
131 0.32
132 0.38
133 0.44
134 0.51
135 0.58
136 0.6
137 0.63
138 0.67
139 0.61
140 0.62
141 0.62
142 0.54
143 0.48
144 0.42
145 0.38
146 0.34
147 0.3
148 0.23
149 0.2
150 0.17
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.13
155 0.16
156 0.23
157 0.29
158 0.39
159 0.42
160 0.5
161 0.59
162 0.66
163 0.73
164 0.76
165 0.77
166 0.74
167 0.8
168 0.77
169 0.7
170 0.62
171 0.61
172 0.5
173 0.4
174 0.32
175 0.26
176 0.24
177 0.22
178 0.21
179 0.14
180 0.18
181 0.18
182 0.19
183 0.2
184 0.22
185 0.25
186 0.29
187 0.3
188 0.29
189 0.3
190 0.29
191 0.32
192 0.27
193 0.26
194 0.27
195 0.25
196 0.22
197 0.23
198 0.26
199 0.23
200 0.22
201 0.29
202 0.31
203 0.31
204 0.35
205 0.4
206 0.47
207 0.47
208 0.5
209 0.44
210 0.45
211 0.47
212 0.45
213 0.43
214 0.39
215 0.37
216 0.38
217 0.37
218 0.3
219 0.27
220 0.27
221 0.22
222 0.18
223 0.17
224 0.14
225 0.12
226 0.12
227 0.18
228 0.25
229 0.27
230 0.33
231 0.33
232 0.34
233 0.37
234 0.41
235 0.37
236 0.31
237 0.33
238 0.29
239 0.3
240 0.29
241 0.26
242 0.23
243 0.22
244 0.18
245 0.15
246 0.19
247 0.18
248 0.18
249 0.25
250 0.28
251 0.34
252 0.4
253 0.48
254 0.53
255 0.6
256 0.62
257 0.6
258 0.62
259 0.62
260 0.57
261 0.53
262 0.46
263 0.39
264 0.37
265 0.32
266 0.27
267 0.21
268 0.18
269 0.16
270 0.16
271 0.22
272 0.26
273 0.34
274 0.37
275 0.42
276 0.53
277 0.63
278 0.71
279 0.74
280 0.81
281 0.83
282 0.86
283 0.89
284 0.87
285 0.85
286 0.84
287 0.82
288 0.79
289 0.77
290 0.76
291 0.77
292 0.77
293 0.76
294 0.74
295 0.7
296 0.71
297 0.69
298 0.64
299 0.57
300 0.5
301 0.43
302 0.35
303 0.3
304 0.21
305 0.15
306 0.11
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.1
329 0.14
330 0.18
331 0.23
332 0.3
333 0.37
334 0.46
335 0.55
336 0.65
337 0.72
338 0.76
339 0.77
340 0.81
341 0.79
342 0.77
343 0.77
344 0.76
345 0.73
346 0.72
347 0.76
348 0.73