FuNGI

A0A1E3QPB3

Protein Details

Accession

A0A1E3QPB3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
662-683	EKKFDRRKFVPKDVKPGQKRKW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
571-579	RRREKAAAK
666-682	DRRKFVPKDVKPGQKRK

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, mito 9, cyto_nucl 9, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022712 Beta_Casp IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR035639 CPSF2_MBL IPR001279 Metallo-B-lactamas IPR007515 Mss4 IPR011057 Mss4-like_sf IPR011323 Mss4/transl-control_tumour IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0005085 F:guanyl-nucleotide exchange factor activity GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0015031 P:protein transport GO:0007264 P:small GTPase mediated signal transduction
Pfam	View protein in Pfam PF10996 Beta-Casp PF13299 CPSF100_C PF16661 Lactamase_B_6 PF04421 Mss4
PROSITE	View protein in PROSITE PS51796 MSS4
CDD	cd16293 CPSF2-like_MBL-fold

Amino Acid Sequences

MSIKQPILRCPFPECHSRIMVSPPKLSTVGIRSSPDMLVCHGTEIPTLESATDTLQFYQINDIWAFDNIGVSRSTDGVFTSPATPVLVAGEKIKLDRFLTCADCDKGPLGFAGVASGHGIKEAGNLDARVLQAQDLCYYLSQNTSPLLPLSPAMFTFESLVSPLDSSTRCSRLSFGLVHILADPGWDSIADLAYLAPAVAETHLILLSHPTAEYLGGYASLLHHYPVLKTIPTYSTLPVTNLGRVNTIDQYRSAGLIGPLDTAQFEVEDIEDMFDKILPLKHAQTTQLTGNFDNLRITPYNAGHTLGGTVWLLSKDNEKIVYAPAWNHSKDSFLNGSAFLQANGQPLPQLLRPTAVITNSNIGSALPHKKRTEKFLQLVDATLANGGSVLLPSSLGGRMLELIHLVDEHLQSAPIPVLMLAHTGSRVLNYAGSMLEWMAPAVIKDWELKNQVPFDASRVQLIEAHELPKFSGPKVVFAADSCFSRGTDAQACLAALCSDERTTILLTERTHGRCLAKELYSTWEALSMQRLGKLEDGNAVPFEQTLVFDTKKEEPLSGLELQEFKSIVAGRRREKAAAKNIDKKNKSLLSSDNTNILDESSDESSEEEDIKEVVAPTDEGLVDMDVRAAKGKHRMFPFLQKRPRYDDYGETIRHADYQKVEEKKFDRRKFVPKDVKPGQKRKWNDAEVLEKEKKEFKVNELDSLHNPRRVVYGTQSLGARCGLAFVDLAGLVDLRSMAMILPLLKPKKVVLLADVTEPRNQAVVYNFFSKSANFAKNGIDVLCVAVNEALEIGGANNSFEIRLDDELVKLLKWQNITGGYSISHVIGEVAVVERDTLAEDRKAEMNDDDDDDDDYDPEAKVNDNTELVLRPLSAPSTSIIQTQPLAVGDIRLSELKKRLGAANHRAEFKGEGTLVVNDEVIIRKVNDGNLIVDGFPGTLFYEVRESVRGMLGYVG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.49
3	0.49
4	0.47
5	0.43
6	0.46
7	0.51
8	0.46
9	0.48
10	0.43
11	0.43
12	0.42
13	0.4
14	0.36
15	0.33
16	0.35
17	0.34
18	0.35
19	0.33
20	0.35
21	0.35
22	0.31
23	0.26
24	0.23
25	0.23
26	0.2
27	0.21
28	0.19
29	0.19
30	0.18
31	0.19
32	0.18
33	0.15
34	0.15
35	0.13
36	0.13
37	0.13
38	0.13
39	0.14
40	0.14
41	0.13
42	0.16
43	0.16
44	0.16
45	0.22
46	0.22
47	0.22
48	0.21
49	0.21
50	0.2
51	0.2
52	0.2
53	0.14
54	0.15
55	0.12
56	0.14
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.13
61	0.13
62	0.11
63	0.12
64	0.12
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.13
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.11
73	0.13
74	0.13
75	0.13
76	0.14
77	0.15
78	0.16
79	0.17
80	0.19
81	0.19
82	0.19
83	0.2
84	0.21
85	0.23
86	0.26
87	0.27
88	0.31
89	0.3
90	0.29
91	0.29
92	0.28
93	0.23
94	0.2
95	0.18
96	0.14
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.09
101	0.09
102	0.1
103	0.1
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.07
108	0.1
109	0.11
110	0.11
111	0.13
112	0.13
113	0.14
114	0.16
115	0.16
116	0.14
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.14
121	0.14
122	0.12
123	0.13
124	0.12
125	0.13
126	0.12
127	0.13
128	0.12
129	0.13
130	0.13
131	0.13
132	0.14
133	0.13
134	0.13
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.12
139	0.11
140	0.15
141	0.14
142	0.14
143	0.15
144	0.14
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.11
152	0.11
153	0.16
154	0.21
155	0.24
156	0.25
157	0.25
158	0.27
159	0.27
160	0.31
161	0.28
162	0.24
163	0.28
164	0.27
165	0.26
166	0.24
167	0.21
168	0.17
169	0.15
170	0.13
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.04
183	0.03
184	0.03
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.06
202	0.06
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.13
214	0.15
215	0.14
216	0.14
217	0.17
218	0.16
219	0.19
220	0.21
221	0.18
222	0.19
223	0.2
224	0.2
225	0.21
226	0.21
227	0.22
228	0.22
229	0.22
230	0.2
231	0.2
232	0.21
233	0.22
234	0.23
235	0.2
236	0.18
237	0.2
238	0.19
239	0.18
240	0.16
241	0.13
242	0.11
243	0.12
244	0.11
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.1
265	0.11
266	0.13
267	0.16
268	0.19
269	0.21
270	0.23
271	0.24
272	0.24
273	0.26
274	0.28
275	0.27
276	0.24
277	0.27
278	0.25
279	0.23
280	0.22
281	0.18
282	0.17
283	0.16
284	0.17
285	0.17
286	0.17
287	0.2
288	0.19
289	0.2
290	0.16
291	0.16
292	0.15
293	0.11
294	0.11
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.11
302	0.11
303	0.13
304	0.14
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.16
309	0.14
310	0.14
311	0.17
312	0.21
313	0.21
314	0.22
315	0.21
316	0.21
317	0.2
318	0.24
319	0.2
320	0.17
321	0.17
322	0.16
323	0.17
324	0.16
325	0.16
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.09
333	0.09
334	0.11
335	0.12
336	0.12
337	0.11
338	0.12
339	0.13
340	0.15
341	0.16
342	0.15
343	0.14
344	0.13
345	0.16
346	0.15
347	0.14
348	0.12
349	0.1
350	0.1
351	0.13
352	0.21
353	0.22
354	0.28
355	0.3
356	0.38
357	0.41
358	0.47
359	0.52
360	0.51
361	0.52
362	0.51
363	0.52
364	0.44
365	0.42
366	0.35
367	0.26
368	0.18
369	0.13
370	0.09
371	0.05
372	0.05
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.07
432	0.08
433	0.12
434	0.15
435	0.16
436	0.18
437	0.19
438	0.18
439	0.17
440	0.16
441	0.16
442	0.17
443	0.16
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.16
449	0.16
450	0.13
451	0.14
452	0.13
453	0.13
454	0.13
455	0.14
456	0.14
457	0.11
458	0.15
459	0.14
460	0.16
461	0.17
462	0.18
463	0.14
464	0.14
465	0.17
466	0.12
467	0.13
468	0.11
469	0.1
470	0.09
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.12
478	0.12
479	0.11
480	0.11
481	0.08
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.06
490	0.07
491	0.08
492	0.1
493	0.11
494	0.13
495	0.18
496	0.19
497	0.2
498	0.21
499	0.21
500	0.19
501	0.23
502	0.24
503	0.19
504	0.19
505	0.19
506	0.21
507	0.2
508	0.19
509	0.15
510	0.13
511	0.12
512	0.12
513	0.13
514	0.11
515	0.11
516	0.13
517	0.13
518	0.13
519	0.14
520	0.14
521	0.13
522	0.13
523	0.14
524	0.12
525	0.12
526	0.11
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.09
534	0.09
535	0.1
536	0.13
537	0.15
538	0.19
539	0.19
540	0.17
541	0.15
542	0.17
543	0.2
544	0.19
545	0.17
546	0.14
547	0.14
548	0.15
549	0.15
550	0.14
551	0.09
552	0.1
553	0.11
554	0.15
555	0.21
556	0.27
557	0.28
558	0.33
559	0.35
560	0.36
561	0.4
562	0.43
563	0.46
564	0.5
565	0.54
566	0.59
567	0.64
568	0.7
569	0.67
570	0.6
571	0.59
572	0.53
573	0.48
574	0.41
575	0.39
576	0.35
577	0.38
578	0.37
579	0.34
580	0.29
581	0.28
582	0.25
583	0.2
584	0.15
585	0.11
586	0.12
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.07
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.05
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.07
615	0.07
616	0.1
617	0.19
618	0.23
619	0.28
620	0.31
621	0.36
622	0.37
623	0.47
624	0.55
625	0.56
626	0.62
627	0.61
628	0.62
629	0.65
630	0.66
631	0.61
632	0.54
633	0.49
634	0.46
635	0.48
636	0.44
637	0.38
638	0.35
639	0.29
640	0.3
641	0.26
642	0.22
643	0.17
644	0.22
645	0.28
646	0.32
647	0.33
648	0.35
649	0.38
650	0.46
651	0.55
652	0.56
653	0.57
654	0.58
655	0.68
656	0.71
657	0.78
658	0.78
659	0.72
660	0.76
661	0.77
662	0.8
663	0.79
664	0.81
665	0.78
666	0.77
667	0.77
668	0.75
669	0.76
670	0.7
671	0.65
672	0.6
673	0.59
674	0.55
675	0.58
676	0.53
677	0.43
678	0.42
679	0.43
680	0.4
681	0.39
682	0.36
683	0.32
684	0.39
685	0.4
686	0.46
687	0.42
688	0.43
689	0.4
690	0.48
691	0.47
692	0.4
693	0.38
694	0.32
695	0.32
696	0.31
697	0.29
698	0.25
699	0.29
700	0.27
701	0.3
702	0.3
703	0.27
704	0.26
705	0.24
706	0.19
707	0.11
708	0.11
709	0.08
710	0.07
711	0.07
712	0.05
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.05
717	0.05
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.04
726	0.05
727	0.06
728	0.09
729	0.16
730	0.18
731	0.18
732	0.19
733	0.2
734	0.25
735	0.27
736	0.25
737	0.21
738	0.25
739	0.26
740	0.3
741	0.34
742	0.29
743	0.28
744	0.28
745	0.25
746	0.2
747	0.19
748	0.16
749	0.16
750	0.2
751	0.21
752	0.25
753	0.25
754	0.25
755	0.26
756	0.24
757	0.25
758	0.27
759	0.27
760	0.24
761	0.25
762	0.26
763	0.27
764	0.29
765	0.24
766	0.17
767	0.14
768	0.14
769	0.13
770	0.11
771	0.09
772	0.09
773	0.08
774	0.07
775	0.07
776	0.05
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.08
788	0.09
789	0.1
790	0.13
791	0.14
792	0.14
793	0.17
794	0.17
795	0.15
796	0.17
797	0.2
798	0.2
799	0.2
800	0.21
801	0.23
802	0.25
803	0.27
804	0.24
805	0.21
806	0.19
807	0.19
808	0.19
809	0.14
810	0.11
811	0.09
812	0.08
813	0.07
814	0.06
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.08
823	0.09
824	0.11
825	0.14
826	0.15
827	0.18
828	0.22
829	0.22
830	0.22
831	0.22
832	0.22
833	0.21
834	0.23
835	0.21
836	0.18
837	0.19
838	0.18
839	0.17
840	0.14
841	0.13
842	0.12
843	0.11
844	0.11
845	0.1
846	0.1
847	0.12
848	0.14
849	0.16
850	0.15
851	0.16
852	0.17
853	0.18
854	0.17
855	0.16
856	0.14
857	0.13
858	0.14
859	0.15
860	0.13
861	0.13
862	0.13
863	0.16
864	0.17
865	0.19
866	0.18
867	0.19
868	0.19
869	0.19
870	0.19
871	0.15
872	0.16
873	0.13
874	0.13
875	0.11
876	0.12
877	0.13
878	0.15
879	0.16
880	0.2
881	0.25
882	0.28
883	0.3
884	0.32
885	0.36
886	0.42
887	0.5
888	0.54
889	0.59
890	0.6
891	0.61
892	0.59
893	0.55
894	0.49
895	0.4
896	0.36
897	0.25
898	0.22
899	0.2
900	0.21
901	0.21
902	0.19
903	0.17
904	0.12
905	0.13
906	0.14
907	0.13
908	0.14
909	0.13
910	0.16
911	0.19
912	0.21
913	0.24
914	0.23
915	0.24
916	0.23
917	0.24
918	0.2
919	0.17
920	0.16
921	0.12
922	0.1
923	0.09
924	0.07
925	0.08
926	0.08
927	0.1
928	0.14
929	0.15
930	0.17
931	0.19
932	0.19
933	0.19
934	0.23
935	0.21

A0A1E3QPB3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer