Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1G258

Protein Details
Accession C1G258    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
423-447EDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEAIGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-331RRKKRK
428-441HAKRKGAKGKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG pbn:PADG_02224  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRQWIDKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDAEADDRVLHRVSGAPITESPSIPLKTTKTTAKNLAELEKEFGGAQVRKNEGEAANYGIYYDDSQYDYMQHLRDLGRSGDGQSHFIEAVPVKGKGKARTVKLEDALRETSLDDGDDLGSVYDDILSTASTYSRKPTYQDQQNVPDSIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAFVDTDDAGDLFESLVQGGPDAEVDPSEWKDTFIEDDDEGWESDATEKAPEQPSVSTTYAESPAKGPMDDVQIPDTVAGEGDWLRNFAQYKKDIKSKPAPPLIHGDTGSVLRAGTVASTMYTAGGTPVRRKKRKGALTNSTAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERIEALYALDEEGEDYDGASLVDDMSVVSGMSKVSEVPSLVSGGTPLRSDFNQIMDGFLEGWEDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEAIGMKMLDEIRQGLGPAKLPGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.57
3 0.56
4 0.59
5 0.54
6 0.52
7 0.51
8 0.5
9 0.5
10 0.55
11 0.48
12 0.4
13 0.42
14 0.41
15 0.34
16 0.31
17 0.27
18 0.21
19 0.19
20 0.17
21 0.14
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.16
29 0.19
30 0.19
31 0.2
32 0.2
33 0.25
34 0.27
35 0.23
36 0.23
37 0.26
38 0.26
39 0.24
40 0.28
41 0.27
42 0.3
43 0.34
44 0.41
45 0.41
46 0.47
47 0.54
48 0.54
49 0.55
50 0.53
51 0.53
52 0.48
53 0.43
54 0.4
55 0.31
56 0.28
57 0.23
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.24
62 0.27
63 0.29
64 0.29
65 0.3
66 0.33
67 0.27
68 0.28
69 0.25
70 0.22
71 0.2
72 0.19
73 0.18
74 0.14
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.14
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.17
88 0.17
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.19
95 0.22
96 0.22
97 0.22
98 0.2
99 0.21
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.12
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.16
108 0.21
109 0.26
110 0.28
111 0.37
112 0.4
113 0.42
114 0.5
115 0.55
116 0.55
117 0.55
118 0.55
119 0.47
120 0.45
121 0.41
122 0.32
123 0.27
124 0.22
125 0.18
126 0.14
127 0.12
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.12
148 0.15
149 0.17
150 0.19
151 0.27
152 0.35
153 0.44
154 0.51
155 0.52
156 0.56
157 0.58
158 0.55
159 0.48
160 0.39
161 0.29
162 0.23
163 0.18
164 0.12
165 0.09
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.18
239 0.19
240 0.15
241 0.14
242 0.15
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.18
273 0.23
274 0.29
275 0.33
276 0.41
277 0.41
278 0.47
279 0.54
280 0.55
281 0.58
282 0.6
283 0.56
284 0.5
285 0.55
286 0.51
287 0.45
288 0.38
289 0.3
290 0.23
291 0.22
292 0.21
293 0.13
294 0.09
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.09
309 0.1
310 0.18
311 0.27
312 0.38
313 0.45
314 0.5
315 0.58
316 0.65
317 0.74
318 0.76
319 0.78
320 0.77
321 0.77
322 0.76
323 0.68
324 0.59
325 0.49
326 0.38
327 0.29
328 0.2
329 0.14
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.13
337 0.19
338 0.21
339 0.22
340 0.23
341 0.24
342 0.25
343 0.32
344 0.31
345 0.27
346 0.25
347 0.23
348 0.22
349 0.21
350 0.21
351 0.14
352 0.14
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.13
395 0.13
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.23
400 0.23
401 0.23
402 0.2
403 0.2
404 0.16
405 0.14
406 0.13
407 0.08
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.18
413 0.21
414 0.27
415 0.32
416 0.37
417 0.44
418 0.54
419 0.64
420 0.65
421 0.73
422 0.76
423 0.82
424 0.85
425 0.87
426 0.83
427 0.82
428 0.8
429 0.74
430 0.7
431 0.62
432 0.54
433 0.47
434 0.41
435 0.31
436 0.27
437 0.23
438 0.17
439 0.17
440 0.16
441 0.15
442 0.16
443 0.16
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.23