Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QNC4

Protein Details
Accession A0A1E3QNC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-394VSNLSIKEMKRKKKAEPVEMVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-85KAARKKFR
383-385RKK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAKSIFDVGNAPFYLVEPILLKMTAKQLNLVEESSPHLQQDTSVIWQNLICKDFPDRPIVDNMFADGSMRAVPKAETKAARKKFRLMAKRSLVRELGSAPASYKDLYYQYKRELEDFHKDSASRLKLATQKFQSLKPSIIEIPTHEIIRRPTGSSKRAQSQSLWAMGTSMPRTGGYMTPANSNRCSIIKKAKKGLEGRSLMFTDPKVKAPRVGGLATLVAPYLSMLPGLVDKKAGPIITQPLARPSARKFQPTELARIMSAKATEAITVAKSHRSPMPQVSSSLPNIPVKPAALPIRAPVHGHITVPEARKRPKETVSIFHNIKRAPVQTSRPPPVPAPRPVLRTADPVVQPSVGISESRAKQAAGIEMMDSVSNLSIKEMKRKKKAEPVEMVTTFKKFKSSVFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.15
3 0.16
4 0.11
5 0.12
6 0.14
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.22
11 0.25
12 0.24
13 0.27
14 0.28
15 0.32
16 0.34
17 0.32
18 0.25
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.23
23 0.19
24 0.18
25 0.17
26 0.16
27 0.19
28 0.17
29 0.18
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.24
34 0.28
35 0.29
36 0.28
37 0.24
38 0.2
39 0.26
40 0.31
41 0.32
42 0.35
43 0.32
44 0.33
45 0.41
46 0.42
47 0.38
48 0.32
49 0.31
50 0.24
51 0.22
52 0.2
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.12
60 0.17
61 0.21
62 0.26
63 0.3
64 0.38
65 0.48
66 0.57
67 0.65
68 0.63
69 0.67
70 0.68
71 0.71
72 0.74
73 0.7
74 0.71
75 0.71
76 0.75
77 0.7
78 0.67
79 0.59
80 0.49
81 0.44
82 0.35
83 0.29
84 0.22
85 0.2
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.16
93 0.22
94 0.27
95 0.29
96 0.34
97 0.39
98 0.4
99 0.4
100 0.4
101 0.39
102 0.44
103 0.42
104 0.39
105 0.35
106 0.35
107 0.34
108 0.37
109 0.34
110 0.26
111 0.23
112 0.26
113 0.31
114 0.34
115 0.4
116 0.35
117 0.4
118 0.41
119 0.44
120 0.45
121 0.41
122 0.4
123 0.33
124 0.33
125 0.27
126 0.26
127 0.23
128 0.18
129 0.22
130 0.21
131 0.21
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.24
136 0.24
137 0.2
138 0.26
139 0.32
140 0.36
141 0.4
142 0.43
143 0.46
144 0.48
145 0.47
146 0.41
147 0.41
148 0.39
149 0.36
150 0.31
151 0.22
152 0.2
153 0.19
154 0.2
155 0.14
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.19
166 0.22
167 0.24
168 0.24
169 0.24
170 0.22
171 0.22
172 0.23
173 0.21
174 0.29
175 0.33
176 0.38
177 0.45
178 0.47
179 0.51
180 0.55
181 0.57
182 0.55
183 0.5
184 0.46
185 0.41
186 0.38
187 0.32
188 0.27
189 0.21
190 0.18
191 0.16
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.26
198 0.24
199 0.23
200 0.18
201 0.15
202 0.15
203 0.12
204 0.11
205 0.08
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.08
223 0.1
224 0.13
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.18
229 0.21
230 0.21
231 0.22
232 0.22
233 0.29
234 0.31
235 0.35
236 0.35
237 0.36
238 0.45
239 0.44
240 0.46
241 0.39
242 0.36
243 0.32
244 0.3
245 0.26
246 0.18
247 0.16
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.14
259 0.16
260 0.19
261 0.22
262 0.24
263 0.29
264 0.35
265 0.32
266 0.34
267 0.35
268 0.35
269 0.34
270 0.34
271 0.3
272 0.26
273 0.25
274 0.25
275 0.23
276 0.19
277 0.18
278 0.21
279 0.21
280 0.2
281 0.2
282 0.22
283 0.25
284 0.26
285 0.26
286 0.22
287 0.24
288 0.23
289 0.23
290 0.2
291 0.2
292 0.24
293 0.28
294 0.32
295 0.33
296 0.38
297 0.45
298 0.5
299 0.52
300 0.53
301 0.57
302 0.56
303 0.57
304 0.58
305 0.6
306 0.57
307 0.54
308 0.54
309 0.45
310 0.43
311 0.4
312 0.36
313 0.33
314 0.37
315 0.4
316 0.45
317 0.54
318 0.57
319 0.56
320 0.56
321 0.55
322 0.58
323 0.58
324 0.55
325 0.54
326 0.53
327 0.54
328 0.55
329 0.56
330 0.49
331 0.47
332 0.43
333 0.42
334 0.38
335 0.36
336 0.34
337 0.28
338 0.25
339 0.21
340 0.19
341 0.13
342 0.11
343 0.11
344 0.18
345 0.2
346 0.24
347 0.24
348 0.22
349 0.24
350 0.26
351 0.28
352 0.22
353 0.2
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.15
358 0.12
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.15
365 0.18
366 0.28
367 0.37
368 0.46
369 0.56
370 0.63
371 0.7
372 0.75
373 0.82
374 0.82
375 0.82
376 0.8
377 0.79
378 0.75
379 0.7
380 0.62
381 0.56
382 0.49
383 0.4
384 0.38
385 0.29