FuNGI

C1G5K6

Protein Details

Accession

C1G5K6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-144	VNNAKLVQRNGRKRKRAGADD	Hydrophilic
158-178	AKEEEKRRIEKPKRRKFETAV	Basic
460-482	FPPMLPRKLRVTRAKRVVKKAGG	Hydrophilic
562-597	TADKPAFKVKTKSRGVKSRGGKSKTRSTRRAAVFRA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
134-139	GRKRKR
159-173	KEEEKRRIEKPKRRK
466-481	RKLRVTRAKRVVKKAG
567-611	AFKVKTKSRGVKSRGGKSKTRSTRRAAVFRAGGGKRKGDGQWRKK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	pbn:PADG_02461 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MGKKQKSQSKSAAGIAGENVTSTFLSNRSKAPTLPFLNGENNVTAIDPMLVSLFEKSAGPVTAPQFTSANLRAATVEDTRRCGKKGGKEPDFEQDAADATSSDEEDQTAGRFSLESGDEGMEDVNNAKLVQRNGRKRKRAGADDLEGAYMQRIVKEEAKEEEKRRIEKPKRRKFETAVENDSEPSASESDEEKNSESESDGISSPPPVHESLTDTVGSAVLDKTARTVFLSNVSTEAIKSKTAKKALLKHLSSFFPSLPDSTTPHKIESIRFRSTAFSTNAMPKRAAYAKRELMDSTTRSTNAYVVYTTTAAARRAPKALNGSFVLDRHLRVDSVAHPSPIDYKRCIFVGNLGFVDEETPTDEKVEQQTKKKNTQPADVEEGLWRTFNEHTRSAIAKLSKSPAKSKGSDASNTNNPAIGTVESVRVIRDPATRIGKGIAYVQFHDENAVEAALLLDGQKFPPMLPRKLRVTRAKRVVKKAGGSAGNMNNNGRNAKNSKDANKTALGPRRGGDKQASSQGCATGLLGKGEAWKVQNSRTSDERDGKSEGCGSNSFIFEGYRATADKPAFKVKTKSRGVKSRGGKSKTRSTRRAAVFRAGGGKRKGDGQWRKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.4
3	0.32
4	0.23
5	0.18
6	0.14
7	0.11
8	0.11
9	0.1
10	0.1
11	0.14
12	0.19
13	0.21
14	0.25
15	0.31
16	0.33
17	0.35
18	0.4
19	0.45
20	0.44
21	0.46
22	0.44
23	0.42
24	0.44
25	0.44
26	0.39
27	0.3
28	0.26
29	0.23
30	0.2
31	0.16
32	0.11
33	0.1
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.06
38	0.07
39	0.08
40	0.07
41	0.08
42	0.08
43	0.09
44	0.11
45	0.12
46	0.12
47	0.16
48	0.19
49	0.24
50	0.24
51	0.25
52	0.23
53	0.24
54	0.29
55	0.27
56	0.28
57	0.22
58	0.23
59	0.21
60	0.22
61	0.24
62	0.23
63	0.27
64	0.25
65	0.3
66	0.36
67	0.38
68	0.38
69	0.42
70	0.44
71	0.47
72	0.55
73	0.61
74	0.62
75	0.64
76	0.65
77	0.67
78	0.64
79	0.54
80	0.44
81	0.34
82	0.27
83	0.23
84	0.2
85	0.12
86	0.08
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.08
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.09
95	0.09
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.06
112	0.07
113	0.07
114	0.08
115	0.13
116	0.16
117	0.25
118	0.35
119	0.45
120	0.56
121	0.66
122	0.73
123	0.75
124	0.81
125	0.81
126	0.79
127	0.77
128	0.74
129	0.67
130	0.62
131	0.56
132	0.47
133	0.37
134	0.29
135	0.21
136	0.15
137	0.11
138	0.09
139	0.1
140	0.13
141	0.18
142	0.19
143	0.22
144	0.25
145	0.31
146	0.37
147	0.39
148	0.45
149	0.46
150	0.49
151	0.52
152	0.58
153	0.62
154	0.66
155	0.74
156	0.76
157	0.79
158	0.82
159	0.84
160	0.79
161	0.78
162	0.78
163	0.75
164	0.69
165	0.62
166	0.55
167	0.48
168	0.42
169	0.32
170	0.21
171	0.15
172	0.1
173	0.08
174	0.08
175	0.1
176	0.13
177	0.14
178	0.15
179	0.14
180	0.15
181	0.15
182	0.14
183	0.13
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.15
198	0.15
199	0.17
200	0.16
201	0.14
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.08
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.1
215	0.09
216	0.14
217	0.16
218	0.14
219	0.15
220	0.15
221	0.14
222	0.13
223	0.14
224	0.1
225	0.11
226	0.14
227	0.19
228	0.25
229	0.28
230	0.33
231	0.37
232	0.45
233	0.53
234	0.6
235	0.55
236	0.52
237	0.52
238	0.49
239	0.44
240	0.37
241	0.27
242	0.2
243	0.19
244	0.16
245	0.14
246	0.14
247	0.15
248	0.18
249	0.24
250	0.23
251	0.23
252	0.26
253	0.26
254	0.29
255	0.36
256	0.39
257	0.35
258	0.35
259	0.34
260	0.34
261	0.34
262	0.35
263	0.27
264	0.22
265	0.21
266	0.28
267	0.31
268	0.3
269	0.28
270	0.22
271	0.25
272	0.29
273	0.31
274	0.26
275	0.3
276	0.33
277	0.34
278	0.35
279	0.31
280	0.28
281	0.28
282	0.26
283	0.21
284	0.18
285	0.17
286	0.17
287	0.17
288	0.16
289	0.13
290	0.12
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.12
300	0.15
301	0.15
302	0.18
303	0.18
304	0.19
305	0.24
306	0.24
307	0.24
308	0.22
309	0.23
310	0.21
311	0.21
312	0.21
313	0.15
314	0.15
315	0.13
316	0.13
317	0.11
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.17
322	0.17
323	0.16
324	0.16
325	0.16
326	0.23
327	0.25
328	0.26
329	0.21
330	0.21
331	0.22
332	0.23
333	0.23
334	0.16
335	0.18
336	0.18
337	0.18
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.15
342	0.15
343	0.09
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.15
352	0.23
353	0.26
354	0.33
355	0.42
356	0.47
357	0.55
358	0.59
359	0.61
360	0.57
361	0.6
362	0.58
363	0.53
364	0.54
365	0.46
366	0.41
367	0.35
368	0.33
369	0.25
370	0.2
371	0.15
372	0.11
373	0.13
374	0.18
375	0.21
376	0.21
377	0.22
378	0.25
379	0.27
380	0.26
381	0.27
382	0.24
383	0.21
384	0.23
385	0.27
386	0.27
387	0.28
388	0.32
389	0.36
390	0.39
391	0.4
392	0.41
393	0.43
394	0.44
395	0.45
396	0.42
397	0.4
398	0.41
399	0.41
400	0.37
401	0.31
402	0.27
403	0.24
404	0.22
405	0.16
406	0.12
407	0.1
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.11
414	0.11
415	0.14
416	0.16
417	0.22
418	0.27
419	0.27
420	0.27
421	0.28
422	0.26
423	0.23
424	0.25
425	0.22
426	0.18
427	0.19
428	0.22
429	0.21
430	0.2
431	0.21
432	0.16
433	0.13
434	0.12
435	0.11
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.16
449	0.23
450	0.3
451	0.36
452	0.42
453	0.5
454	0.58
455	0.67
456	0.68
457	0.7
458	0.73
459	0.77
460	0.81
461	0.8
462	0.82
463	0.82
464	0.77
465	0.72
466	0.66
467	0.63
468	0.54
469	0.48
470	0.46
471	0.43
472	0.41
473	0.39
474	0.36
475	0.32
476	0.32
477	0.33
478	0.27
479	0.27
480	0.26
481	0.29
482	0.36
483	0.4
484	0.45
485	0.51
486	0.54
487	0.52
488	0.52
489	0.52
490	0.52
491	0.54
492	0.49
493	0.42
494	0.4
495	0.44
496	0.42
497	0.42
498	0.39
499	0.36
500	0.38
501	0.46
502	0.46
503	0.4
504	0.4
505	0.37
506	0.31
507	0.25
508	0.21
509	0.16
510	0.16
511	0.14
512	0.13
513	0.13
514	0.15
515	0.16
516	0.19
517	0.16
518	0.21
519	0.23
520	0.28
521	0.34
522	0.35
523	0.39
524	0.41
525	0.46
526	0.49
527	0.55
528	0.53
529	0.5
530	0.5
531	0.46
532	0.43
533	0.42
534	0.35
535	0.3
536	0.28
537	0.28
538	0.28
539	0.28
540	0.26
541	0.2
542	0.19
543	0.16
544	0.17
545	0.14
546	0.13
547	0.14
548	0.15
549	0.2
550	0.23
551	0.28
552	0.3
553	0.38
554	0.4
555	0.45
556	0.53
557	0.56
558	0.64
559	0.68
560	0.74
561	0.74
562	0.8
563	0.8
564	0.81
565	0.81
566	0.81
567	0.81
568	0.78
569	0.76
570	0.73
571	0.78
572	0.79
573	0.8
574	0.77
575	0.75
576	0.79
577	0.81
578	0.82
579	0.76
580	0.74
581	0.66
582	0.62
583	0.63
584	0.57
585	0.56
586	0.5
587	0.49
588	0.42
589	0.45
590	0.47
591	0.48

C1G5K6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer