Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GA52

Protein Details
Accession C1GA52    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30IERWQKQHGKRLDHEERTRKRIARBasic
40-66QSFRGLRAKLYQKKRHAEKIQMKKRIRHydrophilic
134-156KVVNTGKKTHKKSWKRMVTKPTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-35RTRKRIARESHKQ
41-67SFRGLRAKLYQKKRHAEKIQMKKRIRA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_04138  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MPQNEYIERWQKQHGKRLDHEERTRKRIARESHKQSHDAQSFRGLRAKLYQKKRHAEKIQMKKRIRAQEEKNVKSAGPNELSSTPLPNYLLDRSQETNAKSLSSAIKNKRAEKAAQFSVPLPKVKGISEEEMFKVVNTGKKTHKKSWKRMVTKPTFVGNDFTRRPVKYERFIRPMGLRYKKANVTHPKLGVTVQLPIISVKKNPQSPMYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGQVTASGKVVWGKLAQITNNSENDGCVNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.65
3 0.69
4 0.77
5 0.78
6 0.78
7 0.81
8 0.82
9 0.82
10 0.8
11 0.81
12 0.75
13 0.72
14 0.71
15 0.71
16 0.71
17 0.73
18 0.77
19 0.78
20 0.78
21 0.74
22 0.7
23 0.7
24 0.66
25 0.57
26 0.49
27 0.48
28 0.46
29 0.45
30 0.46
31 0.36
32 0.31
33 0.38
34 0.47
35 0.46
36 0.54
37 0.62
38 0.65
39 0.75
40 0.81
41 0.83
42 0.8
43 0.81
44 0.81
45 0.83
46 0.83
47 0.83
48 0.79
49 0.75
50 0.77
51 0.76
52 0.72
53 0.71
54 0.68
55 0.69
56 0.76
57 0.71
58 0.66
59 0.57
60 0.5
61 0.43
62 0.39
63 0.34
64 0.26
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.26
69 0.23
70 0.22
71 0.17
72 0.15
73 0.15
74 0.13
75 0.15
76 0.15
77 0.17
78 0.15
79 0.18
80 0.19
81 0.21
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.21
86 0.21
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.21
91 0.27
92 0.29
93 0.38
94 0.42
95 0.45
96 0.48
97 0.46
98 0.44
99 0.42
100 0.43
101 0.38
102 0.34
103 0.32
104 0.28
105 0.31
106 0.3
107 0.25
108 0.2
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.2
113 0.16
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.13
124 0.13
125 0.17
126 0.25
127 0.34
128 0.4
129 0.48
130 0.57
131 0.63
132 0.72
133 0.79
134 0.81
135 0.79
136 0.81
137 0.82
138 0.79
139 0.74
140 0.67
141 0.61
142 0.52
143 0.46
144 0.42
145 0.34
146 0.33
147 0.29
148 0.31
149 0.3
150 0.29
151 0.32
152 0.37
153 0.41
154 0.43
155 0.51
156 0.54
157 0.55
158 0.56
159 0.56
160 0.51
161 0.51
162 0.52
163 0.5
164 0.46
165 0.44
166 0.49
167 0.52
168 0.52
169 0.55
170 0.56
171 0.56
172 0.59
173 0.57
174 0.51
175 0.46
176 0.43
177 0.36
178 0.27
179 0.22
180 0.17
181 0.15
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.14
186 0.15
187 0.2
188 0.26
189 0.3
190 0.32
191 0.36
192 0.39
193 0.41
194 0.46
195 0.44
196 0.38
197 0.34
198 0.36
199 0.32
200 0.28
201 0.25
202 0.18
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.1
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.18
229 0.22
230 0.23
231 0.26
232 0.32
233 0.35
234 0.36
235 0.37
236 0.32
237 0.28