Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GG51

Protein Details
Accession C1GG51    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-368KSPTTPGGGKIRRKKSKVSSATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-362GGGKIRRKKSK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 7, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pbn:PADG_06288  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAAQPDVPLEEITWRSPHHVQMMGGFLHSNNILFYFAESPFFDATSNNASLAIQASYNENFRHFIETREAFEGRLKTMQGVEFMVVRDPLQELPQEPSNVWVIRKQVRKKRASDDEIQVLATYFVVGDSVYMAPSVLKVIGSRMLSTVTSLTKALSVASPLPLFSPSYGHTYMPPVPRTLDPSRPGQQSTQQSTANTPIPDLPAQSRAGTAPTLATTSTTTTNAPSSLSQYTTMQDSRSFAEAFNLLSRYGDEFMDDAPLLGEPGSFIIGKAFTEPLATRQQAKALQPKAPTPVPTVGVGVMSKPDTPAGTGVGAGASTWAGAAVPAIKTDAATIGAARAGNGGEKSPTTPGGGKIRRKKSKVSSATATNAGAGAGAGVGMPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.26
3 0.29
4 0.33
5 0.34
6 0.36
7 0.34
8 0.34
9 0.37
10 0.32
11 0.28
12 0.24
13 0.19
14 0.17
15 0.17
16 0.13
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.15
30 0.13
31 0.15
32 0.18
33 0.18
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.14
40 0.09
41 0.09
42 0.12
43 0.13
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.19
49 0.26
50 0.23
51 0.24
52 0.3
53 0.31
54 0.33
55 0.36
56 0.35
57 0.29
58 0.33
59 0.32
60 0.26
61 0.26
62 0.23
63 0.2
64 0.22
65 0.23
66 0.19
67 0.18
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.16
81 0.2
82 0.2
83 0.19
84 0.2
85 0.23
86 0.23
87 0.23
88 0.21
89 0.24
90 0.3
91 0.39
92 0.47
93 0.52
94 0.6
95 0.67
96 0.7
97 0.74
98 0.77
99 0.74
100 0.72
101 0.68
102 0.63
103 0.56
104 0.49
105 0.39
106 0.29
107 0.23
108 0.16
109 0.1
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.18
159 0.23
160 0.26
161 0.25
162 0.21
163 0.22
164 0.22
165 0.28
166 0.29
167 0.3
168 0.27
169 0.32
170 0.37
171 0.37
172 0.38
173 0.32
174 0.36
175 0.36
176 0.39
177 0.37
178 0.33
179 0.31
180 0.31
181 0.33
182 0.29
183 0.22
184 0.18
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.13
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.03
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.09
262 0.1
263 0.13
264 0.19
265 0.2
266 0.22
267 0.23
268 0.28
269 0.3
270 0.35
271 0.4
272 0.37
273 0.41
274 0.4
275 0.42
276 0.43
277 0.41
278 0.38
279 0.34
280 0.33
281 0.3
282 0.29
283 0.27
284 0.21
285 0.2
286 0.17
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.04
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.15
334 0.17
335 0.18
336 0.19
337 0.21
338 0.26
339 0.35
340 0.43
341 0.51
342 0.58
343 0.68
344 0.75
345 0.77
346 0.81
347 0.81
348 0.83
349 0.82
350 0.8
351 0.76
352 0.73
353 0.73
354 0.66
355 0.56
356 0.45
357 0.36
358 0.28
359 0.2
360 0.13
361 0.08
362 0.04
363 0.04
364 0.03