Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QI88

Protein Details
Accession A0A1E3QI88    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-96GQISKSSLRRQKRKVKEQLKPKMEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-87RRQKRKVK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12.5, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAVKKKTNSLRGKAATRAVSSAAKAQNAEATGITELKDLNPFLHQLKQTKRDKMLTKATEFIGKLKSGNTSGQISKSSLRRQKRKVKEQLKPKMEDLLTSLPLNLLETAETTRIVAAPTAQFVNKLVKNKPSIMKKKGSLKIIQEETIKFHSVLSDKSFRANPMDAMRQSLLAQQQQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.6
3 0.52
4 0.47
5 0.4
6 0.35
7 0.31
8 0.33
9 0.29
10 0.27
11 0.25
12 0.24
13 0.24
14 0.23
15 0.22
16 0.15
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.14
29 0.15
30 0.21
31 0.24
32 0.28
33 0.36
34 0.45
35 0.51
36 0.55
37 0.59
38 0.61
39 0.62
40 0.63
41 0.65
42 0.6
43 0.56
44 0.51
45 0.47
46 0.43
47 0.38
48 0.33
49 0.25
50 0.2
51 0.18
52 0.17
53 0.18
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.2
63 0.24
64 0.3
65 0.34
66 0.42
67 0.5
68 0.58
69 0.67
70 0.74
71 0.79
72 0.82
73 0.84
74 0.83
75 0.84
76 0.85
77 0.8
78 0.73
79 0.63
80 0.58
81 0.48
82 0.41
83 0.34
84 0.27
85 0.22
86 0.19
87 0.19
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.09
92 0.06
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.17
111 0.19
112 0.23
113 0.26
114 0.3
115 0.34
116 0.39
117 0.46
118 0.49
119 0.56
120 0.58
121 0.62
122 0.63
123 0.69
124 0.7
125 0.68
126 0.63
127 0.6
128 0.62
129 0.58
130 0.55
131 0.49
132 0.43
133 0.42
134 0.39
135 0.35
136 0.26
137 0.22
138 0.23
139 0.21
140 0.24
141 0.26
142 0.29
143 0.27
144 0.32
145 0.34
146 0.32
147 0.35
148 0.34
149 0.32
150 0.33
151 0.4
152 0.36
153 0.39
154 0.38
155 0.34
156 0.33
157 0.33
158 0.32