Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QQ08

Protein Details
Accession A0A1E3QQ08    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44NDRMAKFKALQKRKRESEKLNRQEVYHydrophilic
179-202MGDADARRMKRRRNKNEEDDVHSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-33KRKR
187-191MKRRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSENKYLSASTLEKEATLNDRMAKFKALQKRKRESEKLNRQEVYAEHAKQKEDSQKLKRLEAKKMKAEEELEKIEATERGEDYDRKKNLEYSIEDCEKWEAVQLERRKGTSGASQNYEAIADRAYDKDLKNIDVVANMTAYKASKERLLRSHKEHTIDHMDLTANKPAKQLVKKLVADMGDADARRMKRRRNKNEEDDVHSYINDKNKHFNMKLNREANGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.19
4 0.2
5 0.21
6 0.23
7 0.26
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.29
12 0.34
13 0.43
14 0.48
15 0.54
16 0.62
17 0.71
18 0.77
19 0.84
20 0.85
21 0.86
22 0.86
23 0.89
24 0.88
25 0.86
26 0.77
27 0.67
28 0.61
29 0.5
30 0.47
31 0.42
32 0.36
33 0.33
34 0.34
35 0.35
36 0.33
37 0.39
38 0.4
39 0.41
40 0.48
41 0.5
42 0.56
43 0.58
44 0.64
45 0.66
46 0.62
47 0.65
48 0.66
49 0.66
50 0.65
51 0.66
52 0.61
53 0.56
54 0.54
55 0.48
56 0.42
57 0.37
58 0.3
59 0.25
60 0.24
61 0.21
62 0.19
63 0.16
64 0.13
65 0.1
66 0.12
67 0.14
68 0.17
69 0.21
70 0.28
71 0.29
72 0.29
73 0.3
74 0.31
75 0.32
76 0.34
77 0.32
78 0.26
79 0.32
80 0.31
81 0.3
82 0.27
83 0.25
84 0.2
85 0.17
86 0.16
87 0.11
88 0.1
89 0.18
90 0.21
91 0.25
92 0.26
93 0.26
94 0.25
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.27
99 0.25
100 0.26
101 0.26
102 0.25
103 0.25
104 0.23
105 0.16
106 0.1
107 0.08
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.11
113 0.11
114 0.15
115 0.16
116 0.17
117 0.16
118 0.17
119 0.15
120 0.13
121 0.14
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.14
132 0.18
133 0.23
134 0.31
135 0.39
136 0.44
137 0.5
138 0.57
139 0.56
140 0.57
141 0.52
142 0.49
143 0.48
144 0.43
145 0.36
146 0.29
147 0.25
148 0.23
149 0.24
150 0.25
151 0.19
152 0.2
153 0.2
154 0.22
155 0.29
156 0.33
157 0.37
158 0.39
159 0.46
160 0.46
161 0.47
162 0.47
163 0.39
164 0.35
165 0.29
166 0.23
167 0.18
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.28
173 0.34
174 0.41
175 0.48
176 0.6
177 0.7
178 0.76
179 0.84
180 0.85
181 0.9
182 0.86
183 0.84
184 0.79
185 0.71
186 0.62
187 0.51
188 0.43
189 0.36
190 0.38
191 0.35
192 0.32
193 0.37
194 0.42
195 0.51
196 0.52
197 0.57
198 0.6
199 0.64
200 0.72
201 0.67