Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QSA4

Protein Details
Accession A0A1E3QSA4    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-350SLKSSMSKEKPKQTAKEKKEAKHydrophilic
381-426DGTPTEPPAKKKRGTYKKKPKGEAKDGKETPKKASKTTKKSEAKQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
336-358KEKPKQTAKEKKEAKAAAARKPV
388-424PAKKKRGTYKKKPKGEAKDGKETPKKASKTTKKSEAK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 9.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MFTIPQNRSFEDASAAKTVPLTVKATTAALQLLVSQTPHPQPVPVKPRRHYKFAETNEEILKKYEHLPPSLEFHIHENHYRFSTQEGGNIPKSSPTVKKFMENVLNEEIPPELVEVLRDGGIQLYEGCIILQIADYRELSGKLNMQAQPEPKTYRTLLRPTQLSLYFDLLYHTDFSITRFSDQLSLNLESEILTLTKRNIDLSVPLNPYNYEHLKPDVAPPQLVTDPVSGQKRLIHPHREEKVPFTTLKPPGVFHDKDIQQRSSEYEDLMLIMTNDQLTNAATGQFARLRYIEQIRRKMKLAQQQAANAATVHDEPDHNLSISTASVVSLKSSMSKEKPKQTAKEKKEAKAAAARKPVSGKTLPGHYASKTVPGGMASTADGTPTEPPAKKKRGTYKKKPKGEAKDGKETPKKASKTTKKSEAKQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.24
4 0.23
5 0.24
6 0.2
7 0.21
8 0.21
9 0.18
10 0.19
11 0.2
12 0.21
13 0.2
14 0.19
15 0.16
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.16
24 0.19
25 0.23
26 0.22
27 0.25
28 0.29
29 0.39
30 0.48
31 0.52
32 0.59
33 0.63
34 0.73
35 0.74
36 0.78
37 0.73
38 0.72
39 0.73
40 0.71
41 0.74
42 0.66
43 0.64
44 0.63
45 0.6
46 0.51
47 0.42
48 0.35
49 0.27
50 0.28
51 0.31
52 0.28
53 0.28
54 0.31
55 0.31
56 0.35
57 0.36
58 0.33
59 0.26
60 0.26
61 0.3
62 0.3
63 0.34
64 0.31
65 0.31
66 0.32
67 0.31
68 0.28
69 0.25
70 0.29
71 0.24
72 0.25
73 0.27
74 0.3
75 0.33
76 0.33
77 0.31
78 0.26
79 0.27
80 0.27
81 0.31
82 0.29
83 0.34
84 0.34
85 0.4
86 0.4
87 0.46
88 0.49
89 0.43
90 0.44
91 0.42
92 0.4
93 0.34
94 0.32
95 0.25
96 0.16
97 0.15
98 0.11
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.21
131 0.22
132 0.24
133 0.26
134 0.28
135 0.31
136 0.32
137 0.34
138 0.29
139 0.31
140 0.3
141 0.33
142 0.35
143 0.38
144 0.39
145 0.41
146 0.41
147 0.39
148 0.42
149 0.38
150 0.34
151 0.28
152 0.25
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.12
189 0.13
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.21
197 0.21
198 0.16
199 0.15
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.2
204 0.21
205 0.19
206 0.18
207 0.17
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.15
212 0.1
213 0.1
214 0.15
215 0.16
216 0.14
217 0.14
218 0.18
219 0.2
220 0.26
221 0.32
222 0.35
223 0.38
224 0.47
225 0.5
226 0.52
227 0.49
228 0.47
229 0.44
230 0.38
231 0.35
232 0.28
233 0.32
234 0.3
235 0.33
236 0.3
237 0.27
238 0.28
239 0.35
240 0.32
241 0.27
242 0.33
243 0.33
244 0.39
245 0.43
246 0.4
247 0.33
248 0.33
249 0.34
250 0.3
251 0.26
252 0.2
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.1
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.17
278 0.26
279 0.32
280 0.37
281 0.47
282 0.5
283 0.53
284 0.54
285 0.55
286 0.54
287 0.55
288 0.56
289 0.52
290 0.51
291 0.51
292 0.51
293 0.46
294 0.39
295 0.3
296 0.21
297 0.17
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.14
304 0.15
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.11
319 0.13
320 0.2
321 0.26
322 0.36
323 0.43
324 0.52
325 0.62
326 0.66
327 0.73
328 0.77
329 0.81
330 0.79
331 0.81
332 0.8
333 0.76
334 0.77
335 0.7
336 0.64
337 0.62
338 0.61
339 0.59
340 0.6
341 0.56
342 0.5
343 0.52
344 0.49
345 0.45
346 0.42
347 0.38
348 0.33
349 0.38
350 0.37
351 0.37
352 0.38
353 0.32
354 0.35
355 0.31
356 0.33
357 0.27
358 0.25
359 0.22
360 0.2
361 0.2
362 0.16
363 0.16
364 0.1
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.15
372 0.21
373 0.23
374 0.31
375 0.41
376 0.5
377 0.54
378 0.63
379 0.69
380 0.74
381 0.81
382 0.85
383 0.86
384 0.88
385 0.93
386 0.93
387 0.92
388 0.92
389 0.92
390 0.91
391 0.87
392 0.88
393 0.83
394 0.83
395 0.82
396 0.74
397 0.71
398 0.7
399 0.66
400 0.64
401 0.7
402 0.71
403 0.73
404 0.8
405 0.82
406 0.82