Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GIK1

Protein Details
Accession C1GIK1    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-69LKSPPKTHSNRSSTKRLQSRAHydrophilic
510-538MEKDTKSTPPRPSGNRKRKQDLIDWRDRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
562-569RKKKRRIG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG pbn:PADG_07087  -  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MGSSTSVYDLDEENDSSDNDYFEHEVSPTGFTASSPPLQKPNLASSPGLKSPPKTHSNRSSTKRLQSRANGFQAVRKLHTEKYAKLFNKVVNGTFDGSAEANKPVCAPSQIGVVTWSSQEKETLFNALEKKGKNGIREIASHFESKTVMETQAYLETLHEALERQQLMERFSKNHILSDVPAAAEISEECCQALEENALALSRLDEKGENTVGRQKYGDMWLVDRHVAALVEDRLDAARDGSGDDVDDVANTLHPPPSILATAHLLNVGNWILLSERIFMNSGKSQIEDNWYNLRVDKETPSLTCEAFADFYALAISITRRLIQSSIFFSMSRIRALERGGYQRGKLVRRADVGAALDVLKMSHNSRQFWMGAARRHNLNVEDIRHRKGFKPTPLTYDEVEEELYLEDPRSRTSRSSSVAQSVAVSENNSISDAGGLPDDASSASAASTHHSSNISTSDDEEHLSDPEEMHAAALDREYSRGEELRLWREISLSPPRSLFPEHEDPDIGMEKDTKSTPPRPSGNRKRKQDLIDWRDRVLYRSEWEEYGPDIAFVDDELSENRKKKRRIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.16
5 0.15
6 0.13
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.13
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.16
20 0.18
21 0.23
22 0.24
23 0.27
24 0.32
25 0.34
26 0.37
27 0.37
28 0.42
29 0.42
30 0.41
31 0.4
32 0.38
33 0.43
34 0.43
35 0.44
36 0.39
37 0.38
38 0.42
39 0.49
40 0.54
41 0.54
42 0.6
43 0.65
44 0.72
45 0.77
46 0.76
47 0.79
48 0.78
49 0.81
50 0.8
51 0.75
52 0.75
53 0.75
54 0.77
55 0.75
56 0.73
57 0.68
58 0.6
59 0.6
60 0.58
61 0.52
62 0.45
63 0.42
64 0.39
65 0.37
66 0.45
67 0.46
68 0.44
69 0.47
70 0.54
71 0.5
72 0.52
73 0.54
74 0.47
75 0.5
76 0.47
77 0.42
78 0.37
79 0.37
80 0.34
81 0.29
82 0.27
83 0.2
84 0.18
85 0.17
86 0.14
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.18
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.15
102 0.15
103 0.16
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.17
112 0.2
113 0.22
114 0.25
115 0.29
116 0.27
117 0.3
118 0.34
119 0.37
120 0.35
121 0.37
122 0.39
123 0.37
124 0.4
125 0.4
126 0.37
127 0.36
128 0.35
129 0.3
130 0.25
131 0.22
132 0.19
133 0.18
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.12
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.07
148 0.09
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.17
153 0.18
154 0.21
155 0.26
156 0.26
157 0.24
158 0.27
159 0.34
160 0.31
161 0.31
162 0.29
163 0.25
164 0.24
165 0.25
166 0.22
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.12
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.21
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.18
203 0.19
204 0.21
205 0.23
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.16
212 0.13
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.08
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.17
275 0.16
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.18
280 0.19
281 0.19
282 0.15
283 0.16
284 0.16
285 0.15
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.16
291 0.15
292 0.13
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.2
318 0.2
319 0.18
320 0.16
321 0.14
322 0.15
323 0.16
324 0.18
325 0.17
326 0.21
327 0.25
328 0.26
329 0.25
330 0.28
331 0.32
332 0.31
333 0.34
334 0.32
335 0.32
336 0.33
337 0.34
338 0.3
339 0.27
340 0.25
341 0.19
342 0.16
343 0.12
344 0.1
345 0.08
346 0.07
347 0.05
348 0.06
349 0.08
350 0.12
351 0.16
352 0.18
353 0.19
354 0.22
355 0.21
356 0.22
357 0.27
358 0.27
359 0.29
360 0.32
361 0.34
362 0.32
363 0.33
364 0.34
365 0.28
366 0.29
367 0.28
368 0.27
369 0.33
370 0.35
371 0.38
372 0.39
373 0.4
374 0.38
375 0.44
376 0.48
377 0.47
378 0.54
379 0.52
380 0.55
381 0.56
382 0.55
383 0.46
384 0.41
385 0.33
386 0.24
387 0.22
388 0.16
389 0.13
390 0.1
391 0.1
392 0.08
393 0.07
394 0.09
395 0.09
396 0.12
397 0.14
398 0.16
399 0.18
400 0.23
401 0.29
402 0.31
403 0.36
404 0.36
405 0.37
406 0.36
407 0.34
408 0.29
409 0.24
410 0.21
411 0.17
412 0.14
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.08
435 0.11
436 0.11
437 0.13
438 0.14
439 0.14
440 0.16
441 0.18
442 0.18
443 0.16
444 0.17
445 0.18
446 0.18
447 0.19
448 0.18
449 0.16
450 0.14
451 0.15
452 0.14
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.12
467 0.14
468 0.16
469 0.17
470 0.21
471 0.27
472 0.31
473 0.33
474 0.33
475 0.3
476 0.3
477 0.3
478 0.3
479 0.35
480 0.33
481 0.32
482 0.33
483 0.33
484 0.35
485 0.37
486 0.33
487 0.31
488 0.37
489 0.37
490 0.38
491 0.38
492 0.35
493 0.35
494 0.35
495 0.28
496 0.19
497 0.19
498 0.18
499 0.2
500 0.21
501 0.23
502 0.27
503 0.34
504 0.41
505 0.48
506 0.56
507 0.62
508 0.72
509 0.78
510 0.82
511 0.85
512 0.86
513 0.86
514 0.86
515 0.82
516 0.81
517 0.81
518 0.79
519 0.8
520 0.73
521 0.66
522 0.65
523 0.59
524 0.51
525 0.45
526 0.39
527 0.32
528 0.35
529 0.36
530 0.31
531 0.32
532 0.31
533 0.27
534 0.26
535 0.23
536 0.17
537 0.14
538 0.13
539 0.12
540 0.1
541 0.1
542 0.07
543 0.08
544 0.11
545 0.15
546 0.22
547 0.28
548 0.38
549 0.45