Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GDR2

Protein Details
Accession C1GDR2    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-31GAPHQYKQPSRNGKKAWRKHVDVTEVHydrophilic
269-306YETPEWLKKKPRERKTRAQRNKIKRRKEVERKAKWEAQBasic
401-423EARNPITQPKKAKREYTEKWTYKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-310KKKPRERKTRAQRNKIKRRKEVERKAKWEAQIKKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG pbn:PADG_05398  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MATAIGAPHQYKQPSRNGKKAWRKHVDVTEVDACLQRVREEEIEGGVIAELPSDDLFIIDSKGSDEIQRKVKSTKALKCDEILARRSAIPAVDGRKRGSSKVTDGIIEPRSKRTKSDWITYKEWMRLKQVAKAANPLEQDIDNRITHDPWAEEPTSGPTEETKFNFLEKPKPIVAPPTTKLPPLSLAANGKPVPSVQKPNAGISYNPTFEDWDRLLTEEGQKEVEAEKKRLKEEKAEQERLARIEAARNESEEARSDDESAWEGFESEYETPEWLKKKPRERKTRAQRNKIKRRKEVERKAKWEAQIKKREEQAAQVKAIAEAVKAKEEAEKQLQKVDDESSAEGDDRVLRKRPFGKIPVPERPLELVLPDELQDSLRLLKPEGNLLGDRFRNLIVQGKLEARNPITQPKKAKREYTEKWTYKDFKIKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.64
3 0.7
4 0.74
5 0.79
6 0.84
7 0.88
8 0.88
9 0.86
10 0.84
11 0.84
12 0.83
13 0.79
14 0.7
15 0.67
16 0.61
17 0.51
18 0.46
19 0.39
20 0.31
21 0.26
22 0.24
23 0.19
24 0.16
25 0.21
26 0.21
27 0.21
28 0.22
29 0.2
30 0.2
31 0.18
32 0.17
33 0.11
34 0.1
35 0.08
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.1
50 0.1
51 0.15
52 0.19
53 0.24
54 0.33
55 0.36
56 0.38
57 0.4
58 0.44
59 0.48
60 0.53
61 0.55
62 0.55
63 0.58
64 0.57
65 0.55
66 0.57
67 0.54
68 0.51
69 0.46
70 0.4
71 0.36
72 0.34
73 0.33
74 0.28
75 0.21
76 0.17
77 0.18
78 0.23
79 0.27
80 0.29
81 0.3
82 0.36
83 0.38
84 0.38
85 0.39
86 0.37
87 0.36
88 0.39
89 0.39
90 0.33
91 0.32
92 0.36
93 0.35
94 0.34
95 0.31
96 0.33
97 0.39
98 0.39
99 0.41
100 0.41
101 0.47
102 0.48
103 0.57
104 0.57
105 0.57
106 0.6
107 0.62
108 0.6
109 0.56
110 0.55
111 0.48
112 0.44
113 0.45
114 0.43
115 0.44
116 0.44
117 0.43
118 0.4
119 0.43
120 0.39
121 0.36
122 0.35
123 0.29
124 0.26
125 0.21
126 0.21
127 0.18
128 0.2
129 0.16
130 0.17
131 0.18
132 0.16
133 0.16
134 0.17
135 0.14
136 0.13
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.15
145 0.13
146 0.15
147 0.18
148 0.19
149 0.18
150 0.17
151 0.19
152 0.22
153 0.23
154 0.28
155 0.27
156 0.31
157 0.29
158 0.3
159 0.29
160 0.32
161 0.34
162 0.32
163 0.3
164 0.33
165 0.32
166 0.32
167 0.32
168 0.26
169 0.24
170 0.2
171 0.19
172 0.15
173 0.17
174 0.16
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.23
183 0.21
184 0.28
185 0.29
186 0.3
187 0.32
188 0.28
189 0.25
190 0.23
191 0.25
192 0.19
193 0.18
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.18
198 0.14
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.16
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.17
212 0.16
213 0.19
214 0.24
215 0.27
216 0.31
217 0.36
218 0.36
219 0.38
220 0.44
221 0.51
222 0.56
223 0.57
224 0.54
225 0.52
226 0.53
227 0.45
228 0.37
229 0.27
230 0.18
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.19
235 0.18
236 0.19
237 0.19
238 0.19
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.14
245 0.14
246 0.15
247 0.13
248 0.11
249 0.08
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.13
260 0.16
261 0.18
262 0.27
263 0.34
264 0.44
265 0.54
266 0.64
267 0.71
268 0.77
269 0.84
270 0.86
271 0.91
272 0.91
273 0.91
274 0.91
275 0.91
276 0.94
277 0.93
278 0.91
279 0.89
280 0.88
281 0.88
282 0.89
283 0.89
284 0.88
285 0.89
286 0.86
287 0.84
288 0.8
289 0.74
290 0.72
291 0.71
292 0.7
293 0.69
294 0.67
295 0.65
296 0.65
297 0.64
298 0.56
299 0.55
300 0.54
301 0.49
302 0.45
303 0.41
304 0.36
305 0.31
306 0.31
307 0.23
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.17
315 0.19
316 0.24
317 0.3
318 0.34
319 0.33
320 0.38
321 0.39
322 0.35
323 0.35
324 0.31
325 0.25
326 0.21
327 0.21
328 0.17
329 0.17
330 0.16
331 0.14
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.2
336 0.26
337 0.26
338 0.34
339 0.41
340 0.47
341 0.51
342 0.56
343 0.6
344 0.62
345 0.7
346 0.72
347 0.69
348 0.63
349 0.57
350 0.52
351 0.46
352 0.37
353 0.29
354 0.2
355 0.18
356 0.17
357 0.15
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.13
364 0.15
365 0.16
366 0.17
367 0.21
368 0.21
369 0.26
370 0.27
371 0.27
372 0.25
373 0.26
374 0.32
375 0.3
376 0.29
377 0.25
378 0.24
379 0.22
380 0.22
381 0.28
382 0.23
383 0.24
384 0.26
385 0.31
386 0.33
387 0.34
388 0.39
389 0.34
390 0.38
391 0.39
392 0.46
393 0.47
394 0.51
395 0.59
396 0.64
397 0.72
398 0.73
399 0.79
400 0.78
401 0.82
402 0.83
403 0.82
404 0.83
405 0.79
406 0.75
407 0.75
408 0.72
409 0.7