Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0A0HWM5

Protein Details
Accession A0A0A0HWM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-108RSTGSTQPTEKKKSKKERRREKKKAEEEKKAEVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-104KKKSKKERRREKKKAEEEKK
Subcellular Location(s) mito 8cyto_nucl 8, nucl 7, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG pbn:PADG_12105  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
Amino Acid Sequences MSTNKVVPPAHVIPANAAAAALNRSSLPAESSPTVWDRISTWASENKALLYTIAGVSVVVTSAGVVYYLTSDSGRSTGSTQPTEKKKSKKERRREKKKAEEEKKAEVTPPSNATQKKPEEALEIPEFDESTIDSLSAEVRASYAAKLKAAGNRAFGSLDYNRAIELYGKAILCKPDPVYYSNRAACYNALSEWDKVVEDTSAALSMDDEYVKAMNRRANAYEKLGKFSEALLDYTASCIIDGFAKESSKQAVERLLKKVAEQKGHAILEAKGKKLPSATFVSNYLQSFRLRPLPDGLGEDVELDEESSKGQLRKGLLAMSKPTSDGYEEAARAFEKALELGDLGEFEALALNMRATFTYLAGDAQAALQDLNKSVELSPSLVQSYIKRASLHLELGNREAAADDFDLAVAQNKDDPDIYYHRAQLHFILVDPECDIAVATLAQLLLQQGKVSQALKYFERAGELARTEAEVINAVSYAEATRAQLEVQERYPKLAARLQQVAGAAAMGVPPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.22
4 0.19
5 0.14
6 0.13
7 0.15
8 0.12
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.19
17 0.19
18 0.2
19 0.23
20 0.24
21 0.26
22 0.22
23 0.22
24 0.19
25 0.23
26 0.25
27 0.22
28 0.24
29 0.27
30 0.3
31 0.32
32 0.32
33 0.26
34 0.26
35 0.24
36 0.2
37 0.15
38 0.14
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.12
64 0.18
65 0.23
66 0.27
67 0.31
68 0.39
69 0.47
70 0.55
71 0.6
72 0.64
73 0.7
74 0.77
75 0.83
76 0.86
77 0.88
78 0.9
79 0.94
80 0.96
81 0.96
82 0.96
83 0.96
84 0.96
85 0.96
86 0.95
87 0.94
88 0.88
89 0.86
90 0.8
91 0.7
92 0.62
93 0.55
94 0.47
95 0.4
96 0.38
97 0.33
98 0.34
99 0.36
100 0.37
101 0.41
102 0.43
103 0.42
104 0.4
105 0.38
106 0.37
107 0.36
108 0.38
109 0.31
110 0.29
111 0.25
112 0.23
113 0.22
114 0.17
115 0.15
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.16
134 0.19
135 0.22
136 0.27
137 0.28
138 0.26
139 0.26
140 0.26
141 0.25
142 0.22
143 0.23
144 0.18
145 0.19
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.11
152 0.11
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.14
158 0.16
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.22
165 0.26
166 0.29
167 0.35
168 0.35
169 0.35
170 0.32
171 0.31
172 0.28
173 0.24
174 0.21
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.08
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.11
201 0.13
202 0.15
203 0.17
204 0.2
205 0.24
206 0.26
207 0.29
208 0.34
209 0.32
210 0.34
211 0.32
212 0.29
213 0.25
214 0.22
215 0.21
216 0.14
217 0.14
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.17
239 0.21
240 0.25
241 0.28
242 0.3
243 0.29
244 0.3
245 0.36
246 0.33
247 0.31
248 0.28
249 0.28
250 0.3
251 0.3
252 0.29
253 0.23
254 0.2
255 0.25
256 0.26
257 0.24
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.21
262 0.2
263 0.16
264 0.19
265 0.19
266 0.19
267 0.21
268 0.22
269 0.23
270 0.22
271 0.2
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.16
276 0.22
277 0.2
278 0.21
279 0.22
280 0.21
281 0.22
282 0.22
283 0.21
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.12
299 0.14
300 0.16
301 0.17
302 0.2
303 0.19
304 0.2
305 0.22
306 0.21
307 0.2
308 0.18
309 0.18
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.09
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.04
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.14
371 0.2
372 0.21
373 0.23
374 0.22
375 0.22
376 0.26
377 0.27
378 0.29
379 0.26
380 0.26
381 0.25
382 0.26
383 0.27
384 0.22
385 0.19
386 0.16
387 0.12
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.11
396 0.09
397 0.09
398 0.11
399 0.12
400 0.13
401 0.14
402 0.15
403 0.15
404 0.2
405 0.25
406 0.26
407 0.29
408 0.32
409 0.33
410 0.33
411 0.3
412 0.29
413 0.24
414 0.21
415 0.22
416 0.18
417 0.18
418 0.17
419 0.16
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.08
436 0.11
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.19
441 0.22
442 0.24
443 0.27
444 0.28
445 0.26
446 0.28
447 0.26
448 0.24
449 0.25
450 0.25
451 0.22
452 0.2
453 0.2
454 0.18
455 0.18
456 0.16
457 0.13
458 0.12
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.14
472 0.18
473 0.21
474 0.25
475 0.34
476 0.33
477 0.37
478 0.39
479 0.38
480 0.39
481 0.4
482 0.41
483 0.39
484 0.44
485 0.41
486 0.41
487 0.39
488 0.35
489 0.28
490 0.22
491 0.15
492 0.09