Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HK88

Protein Details
Accession A0A1E3HK88    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-85AAVTRAPGDDRKRKIKPRRTVDYQGGVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-76RKRKIKPRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045245  Pfs2-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MTAAPPTVPSDQNGNPLPRSHAGPSRRPQREDSWAPTRYLEPPHPDNEEVLEQAAYQAAVTRAPGDDRKRKIKPRRTVDYQGGVQKWRMLNKLKGIHEFRPSIHPNASDIVNLLPPMALRSNPSTSVCDYWVHTSINKERSPTRVVQWTPDARRLLTGNDKGQFTLWNGASFNYESITQVHDDSIRSFTYSHNGQALVSADKGGTIKYFTPHLTNIHGFQGHREACHDVSWSPNDERFVSCGDDGLVKIWSYREAKEEKTLSGHGWDVRCVDWHPTKGLIASGSKDMLVKFWDPRTGKDLSTLHSAKSTVNACRWSPDGHLVATGGQDNVIRLFDIRTFRELEVLKGHQKEVNTIEFHPIHHSLIVSGDAAGAINYYSLDSPTPSEPITSLSAAHEDAVFSLSWHPLGHILCSGSRDFTARFWCRARPSGGQEDDKWHLGEDGAAQRELEKVHKRAWGVPARSEKKEEASLPGLSNLMATVGNNNSHSSSLPGLSAPPGLPGLGGLGASNDGPSRTSTPGSMSDAGFRRGALPSQGDMLKQNNVPGGRFGERGPVSENRDRPPFRGAPGNAPPASASGGYPSAGQGSKGYGGYPPPGAPQGGYSNHPPPSGGSGYGGPPQQGQAGYPPYGRDGRDGRDDRDSRDGRPQDRDPRGGQGYGGGGAGQYGSSGGGYGGGGGRGGYSGGGGRGGYNGGGSGGYGGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.39
4 0.43
5 0.39
6 0.42
7 0.4
8 0.42
9 0.45
10 0.53
11 0.6
12 0.66
13 0.71
14 0.7
15 0.7
16 0.7
17 0.72
18 0.71
19 0.69
20 0.67
21 0.62
22 0.6
23 0.56
24 0.51
25 0.46
26 0.45
27 0.43
28 0.42
29 0.44
30 0.47
31 0.5
32 0.48
33 0.44
34 0.41
35 0.37
36 0.3
37 0.26
38 0.21
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.1
43 0.07
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.15
51 0.23
52 0.3
53 0.38
54 0.46
55 0.56
56 0.64
57 0.74
58 0.81
59 0.84
60 0.86
61 0.87
62 0.89
63 0.87
64 0.86
65 0.84
66 0.81
67 0.76
68 0.74
69 0.67
70 0.59
71 0.51
72 0.48
73 0.44
74 0.41
75 0.42
76 0.42
77 0.45
78 0.51
79 0.58
80 0.57
81 0.62
82 0.63
83 0.61
84 0.61
85 0.58
86 0.51
87 0.52
88 0.51
89 0.46
90 0.44
91 0.4
92 0.35
93 0.35
94 0.33
95 0.24
96 0.21
97 0.18
98 0.15
99 0.14
100 0.12
101 0.09
102 0.08
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.13
107 0.18
108 0.21
109 0.24
110 0.27
111 0.27
112 0.28
113 0.3
114 0.28
115 0.25
116 0.24
117 0.25
118 0.26
119 0.25
120 0.24
121 0.28
122 0.34
123 0.4
124 0.4
125 0.39
126 0.39
127 0.42
128 0.46
129 0.43
130 0.4
131 0.41
132 0.41
133 0.43
134 0.48
135 0.52
136 0.51
137 0.54
138 0.5
139 0.42
140 0.43
141 0.39
142 0.36
143 0.36
144 0.38
145 0.37
146 0.39
147 0.39
148 0.36
149 0.36
150 0.32
151 0.26
152 0.27
153 0.22
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.22
158 0.2
159 0.18
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.17
177 0.18
178 0.19
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.14
196 0.14
197 0.17
198 0.19
199 0.2
200 0.23
201 0.23
202 0.23
203 0.24
204 0.25
205 0.22
206 0.22
207 0.28
208 0.24
209 0.22
210 0.23
211 0.22
212 0.21
213 0.22
214 0.22
215 0.14
216 0.17
217 0.19
218 0.21
219 0.2
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.22
224 0.19
225 0.19
226 0.17
227 0.15
228 0.14
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.19
241 0.22
242 0.24
243 0.3
244 0.31
245 0.27
246 0.28
247 0.28
248 0.23
249 0.21
250 0.21
251 0.18
252 0.17
253 0.17
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.19
259 0.19
260 0.2
261 0.21
262 0.2
263 0.2
264 0.19
265 0.19
266 0.15
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.21
280 0.21
281 0.23
282 0.26
283 0.26
284 0.24
285 0.28
286 0.27
287 0.23
288 0.3
289 0.29
290 0.25
291 0.24
292 0.25
293 0.18
294 0.22
295 0.22
296 0.17
297 0.2
298 0.22
299 0.21
300 0.22
301 0.24
302 0.21
303 0.19
304 0.21
305 0.19
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.11
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.09
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.16
326 0.16
327 0.21
328 0.21
329 0.19
330 0.19
331 0.21
332 0.23
333 0.22
334 0.23
335 0.19
336 0.19
337 0.21
338 0.2
339 0.21
340 0.18
341 0.18
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.21
346 0.19
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.11
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.08
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.21
407 0.22
408 0.25
409 0.27
410 0.31
411 0.34
412 0.37
413 0.4
414 0.36
415 0.39
416 0.44
417 0.46
418 0.44
419 0.42
420 0.42
421 0.4
422 0.36
423 0.3
424 0.21
425 0.17
426 0.14
427 0.13
428 0.12
429 0.14
430 0.14
431 0.14
432 0.13
433 0.14
434 0.15
435 0.15
436 0.19
437 0.2
438 0.22
439 0.26
440 0.29
441 0.3
442 0.34
443 0.41
444 0.43
445 0.39
446 0.44
447 0.5
448 0.52
449 0.53
450 0.52
451 0.45
452 0.4
453 0.41
454 0.36
455 0.3
456 0.28
457 0.28
458 0.25
459 0.24
460 0.2
461 0.16
462 0.15
463 0.1
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.07
468 0.08
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.13
475 0.12
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.08
501 0.11
502 0.13
503 0.14
504 0.14
505 0.17
506 0.2
507 0.23
508 0.24
509 0.21
510 0.25
511 0.27
512 0.28
513 0.25
514 0.22
515 0.2
516 0.19
517 0.2
518 0.16
519 0.16
520 0.15
521 0.18
522 0.19
523 0.18
524 0.2
525 0.21
526 0.22
527 0.21
528 0.22
529 0.22
530 0.22
531 0.22
532 0.22
533 0.24
534 0.22
535 0.23
536 0.21
537 0.26
538 0.26
539 0.27
540 0.28
541 0.3
542 0.35
543 0.41
544 0.45
545 0.41
546 0.49
547 0.5
548 0.48
549 0.5
550 0.46
551 0.41
552 0.46
553 0.44
554 0.43
555 0.48
556 0.53
557 0.45
558 0.42
559 0.4
560 0.31
561 0.31
562 0.23
563 0.16
564 0.11
565 0.12
566 0.12
567 0.12
568 0.11
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.11
573 0.12
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.13
578 0.15
579 0.17
580 0.18
581 0.17
582 0.17
583 0.18
584 0.18
585 0.17
586 0.18
587 0.22
588 0.22
589 0.24
590 0.27
591 0.31
592 0.33
593 0.33
594 0.3
595 0.26
596 0.29
597 0.29
598 0.24
599 0.21
600 0.2
601 0.22
602 0.26
603 0.25
604 0.19
605 0.18
606 0.18
607 0.19
608 0.17
609 0.16
610 0.18
611 0.22
612 0.23
613 0.24
614 0.24
615 0.25
616 0.29
617 0.29
618 0.29
619 0.3
620 0.32
621 0.42
622 0.45
623 0.44
624 0.51
625 0.52
626 0.5
627 0.56
628 0.53
629 0.46
630 0.53
631 0.56
632 0.51
633 0.58
634 0.62
635 0.62
636 0.68
637 0.7
638 0.62
639 0.63
640 0.62
641 0.54
642 0.45
643 0.38
644 0.31
645 0.26
646 0.23
647 0.14
648 0.1
649 0.09
650 0.09
651 0.06
652 0.05
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.05
657 0.04
658 0.05
659 0.05
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.06
667 0.07
668 0.05
669 0.05
670 0.07
671 0.07
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.1
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.08