Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C1GHT3

Protein Details
Accession C1GHT3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-101QGEYSNCSKQKRRYQWHPKPDPNAPKKPLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pbn:PADG_06819  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MEDLAVVFHELGMTQYLHRFIGNGFETWNDVLEITEIDLYGFNKSLLALNIMQRLQQRVAKERNDFRNRPAQQGEYSNCSKQKRRYQWHPKPDPNAPKKPLTAYAVFANEKRAELQYKALSFPEMAIEIGRLWRELPENEKKIAQARATQAREEYKIALGEYENSDNYNTHVRYLNEWKARNSTDRRMEEKRSQSNTSSPQYVERSPVSMETSAESQLNHALRGGSLRNTLPNGWGSSNPCHLVEHIPDTFGWSLSHKNPHNQIGGDERLFDNAPSTLSSLNMRNGDIDVEYEDDALGCTSFWSAGSRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.13
8 0.21
9 0.21
10 0.19
11 0.18
12 0.18
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.12
33 0.11
34 0.14
35 0.15
36 0.18
37 0.23
38 0.23
39 0.25
40 0.25
41 0.28
42 0.29
43 0.29
44 0.3
45 0.35
46 0.42
47 0.46
48 0.52
49 0.57
50 0.64
51 0.71
52 0.69
53 0.65
54 0.68
55 0.63
56 0.62
57 0.57
58 0.5
59 0.44
60 0.49
61 0.47
62 0.42
63 0.44
64 0.41
65 0.43
66 0.45
67 0.48
68 0.5
69 0.58
70 0.63
71 0.69
72 0.76
73 0.82
74 0.87
75 0.91
76 0.92
77 0.89
78 0.85
79 0.84
80 0.84
81 0.81
82 0.8
83 0.73
84 0.67
85 0.61
86 0.58
87 0.53
88 0.46
89 0.39
90 0.31
91 0.3
92 0.3
93 0.29
94 0.26
95 0.25
96 0.22
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.17
102 0.21
103 0.21
104 0.21
105 0.22
106 0.21
107 0.19
108 0.17
109 0.16
110 0.12
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.1
123 0.17
124 0.24
125 0.27
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.3
130 0.32
131 0.27
132 0.23
133 0.25
134 0.33
135 0.33
136 0.33
137 0.31
138 0.29
139 0.3
140 0.26
141 0.22
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.18
159 0.18
160 0.22
161 0.29
162 0.35
163 0.35
164 0.37
165 0.37
166 0.38
167 0.39
168 0.43
169 0.41
170 0.42
171 0.45
172 0.48
173 0.52
174 0.53
175 0.58
176 0.58
177 0.62
178 0.62
179 0.58
180 0.56
181 0.53
182 0.53
183 0.54
184 0.49
185 0.42
186 0.34
187 0.33
188 0.34
189 0.33
190 0.31
191 0.25
192 0.23
193 0.21
194 0.22
195 0.19
196 0.17
197 0.16
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.1
204 0.14
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.14
211 0.15
212 0.12
213 0.15
214 0.15
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.19
219 0.2
220 0.2
221 0.19
222 0.21
223 0.22
224 0.24
225 0.28
226 0.27
227 0.26
228 0.24
229 0.24
230 0.25
231 0.24
232 0.26
233 0.22
234 0.21
235 0.2
236 0.23
237 0.22
238 0.19
239 0.17
240 0.13
241 0.18
242 0.22
243 0.31
244 0.31
245 0.38
246 0.43
247 0.48
248 0.51
249 0.46
250 0.44
251 0.42
252 0.44
253 0.37
254 0.33
255 0.27
256 0.25
257 0.25
258 0.22
259 0.18
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.14
264 0.11
265 0.13
266 0.16
267 0.18
268 0.23
269 0.24
270 0.23
271 0.22
272 0.23
273 0.22
274 0.19
275 0.17
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07