Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HAK2

Protein Details
Accession A0A1E3HAK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-378IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
360-369FRKEKNKKKR
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 13.333, nucl 10.5, cyto_mito 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MATQPSKELDAAVLAYLVKRGYTKSVKSLEKEAAVKLAPGQEAALENAWAAAAVAAVASTLAEADPASVPLPDSSSDSDSDSSASSSSSSSGSSSSGSDSDSDSDSDSDSDSESSSSSSTVGKKPAAAFLDVEAEESDDESSSSDESGSESDSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSSSSSGSSSDSSSSSSSSSSSSSSSDSESEEEEVARPVIGKRKARSPSTSSSSSSSSSSSSSTMAEDPAPKSPVVTVVTTKKRKLEDGVETVTSTATISTPAPAASSRDSSTPFSGAGTPLSAKGKGKQPRVQGQRFERIKPENVTFHDQALMDNSFDARERAGASSNDYGAKASADLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITLQTHSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.12
8 0.2
9 0.28
10 0.32
11 0.39
12 0.48
13 0.53
14 0.56
15 0.6
16 0.56
17 0.55
18 0.53
19 0.45
20 0.41
21 0.34
22 0.31
23 0.28
24 0.27
25 0.21
26 0.19
27 0.17
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.15
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.07
37 0.06
38 0.04
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.03
43 0.03
44 0.03
45 0.02
46 0.02
47 0.03
48 0.03
49 0.03
50 0.03
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.1
59 0.09
60 0.12
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.17
68 0.15
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.1
106 0.14
107 0.16
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.23
112 0.27
113 0.25
114 0.23
115 0.2
116 0.17
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.14
200 0.2
201 0.25
202 0.26
203 0.35
204 0.41
205 0.44
206 0.48
207 0.47
208 0.47
209 0.48
210 0.49
211 0.42
212 0.39
213 0.37
214 0.33
215 0.28
216 0.22
217 0.17
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.16
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.17
238 0.24
239 0.34
240 0.39
241 0.41
242 0.42
243 0.41
244 0.43
245 0.44
246 0.42
247 0.4
248 0.41
249 0.41
250 0.37
251 0.35
252 0.33
253 0.28
254 0.21
255 0.14
256 0.08
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.11
266 0.12
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.2
271 0.22
272 0.23
273 0.21
274 0.19
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.12
280 0.11
281 0.13
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.21
286 0.29
287 0.36
288 0.44
289 0.48
290 0.54
291 0.62
292 0.71
293 0.73
294 0.74
295 0.73
296 0.75
297 0.73
298 0.67
299 0.65
300 0.6
301 0.59
302 0.55
303 0.53
304 0.49
305 0.5
306 0.54
307 0.47
308 0.43
309 0.4
310 0.35
311 0.3
312 0.27
313 0.23
314 0.16
315 0.15
316 0.14
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.12
324 0.16
325 0.16
326 0.21
327 0.23
328 0.24
329 0.25
330 0.23
331 0.22
332 0.18
333 0.18
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.13
344 0.13
345 0.17
346 0.22
347 0.29
348 0.39
349 0.5
350 0.6
351 0.69
352 0.78
353 0.82
354 0.88
355 0.9
356 0.88
357 0.87
358 0.83
359 0.82
360 0.78
361 0.7
362 0.6
363 0.5
364 0.41
365 0.33
366 0.27
367 0.18
368 0.13