Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HCH1

Protein Details
Accession A0A1E3HCH1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-140WDLTKEDKKHPERRPVLLRNVRIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8, cyto_nucl 7.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR016528  VPS11  
IPR024763  VPS11_C  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0033263  C:CORVET complex  
GO:0000329  C:fungal-type vacuole membrane  
GO:0030897  C:HOPS complex  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF12451  VPS11_C  
PF17122  zf-C3H2C3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16688  RING-H2_Vps11  
Amino Acid Sequences MAIPPSHAGTSAPQWRQFTFFDVHDVKDTHDLAQSPRAIRELTPPLAVTAISSQSPLPPSLIVSSGQTITQLDRYFTPERSFTAWERNGRATALLEAGGLLVGIGEEDGSLWPVLKVWDLTKEDKKHPERRPVLLRNVRIQHGQRPHPVSSVALTTTLSHLAIGLGDGTVLLYRHFLQSLTTSPTALTSLPKARVVHQSHEPVTGLGFSEQSSSTSLFIVTTNRVLCAPVSGKGEARTIDELGCGLGCAVMDWERNDMIVARDEAIYLYSPEGRGASFAYEGPKSSIAVFNHNLVITSPPFHPSASSKSATVRHHVKANPNGDSPSVDIAKITVFDLQNKLVGYSGTYKDGVRDVYCQWGGIYVHGGNGKLARLEEHSTQAKLDVLYRRNLFTLAISLARQQGLGDAGVSDIHRRYGDYLYNKGDFEGAMSQFVKTLGNLQPSYVIRKVSVTRGFRAEAYPVQFLDAQRIHNLTTYLQELHSRGLANPDHTTLLLNCYTKTSDRTRLDQFIKTESHRTDTGAEELPFDLDTAIRVCRQAGFYEHATYLAKKFGRHEDYLRIQIENAGKVGEALRYLRSLGPKACDENMVRYGRTLLHQEPAATTALLVDLCSGNLGKKKASTPPQIVDQLNGTSNGTNGATGPAMLSYLGYNKVSGLFTGEATGTATPTDKNEPQRVDREETSALEKLAFESEGPDYVPPSPRQYFAHFVDHLDLFVHFLEAVALNLWDQKVDLSVPSSAPSPISTRDADIPPPDDPTGVDQRAVWNTLMELYLSATKSPDSTVASQSREKALALISSKDTPYDPLHALVLCSTVGFRAGMVRLWEGMGMYEDVLRYYMEAGEDDGDEVDASAKVFSHLDLYGPTHPQLYPLVLRYLTSSPAILSRHPKELGNILAKIDEYQIMPPLAVVQVLSRNGVVSVGNMKDWLKGKVEDNEAEIESNKHLYDSYRADTATKRKAMLDRTNPSQPEVFQVTKCASCGGQLDLPSVHFMCKHSYHQRCLPDSDPECPLCARQHSVIKEIRRNQLRLADRHDLFLEEVHSAEDGFGVVADAYGRGLFGREGEVLDGEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.47
4 0.45
5 0.41
6 0.36
7 0.31
8 0.34
9 0.34
10 0.34
11 0.35
12 0.35
13 0.32
14 0.34
15 0.34
16 0.27
17 0.29
18 0.29
19 0.27
20 0.34
21 0.37
22 0.32
23 0.33
24 0.34
25 0.31
26 0.3
27 0.36
28 0.36
29 0.33
30 0.33
31 0.32
32 0.3
33 0.29
34 0.28
35 0.21
36 0.16
37 0.16
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.17
42 0.2
43 0.19
44 0.17
45 0.15
46 0.17
47 0.18
48 0.19
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.2
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.26
62 0.29
63 0.31
64 0.33
65 0.29
66 0.31
67 0.34
68 0.36
69 0.33
70 0.4
71 0.44
72 0.46
73 0.48
74 0.49
75 0.46
76 0.42
77 0.41
78 0.31
79 0.27
80 0.21
81 0.17
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.06
87 0.04
88 0.03
89 0.02
90 0.03
91 0.02
92 0.02
93 0.02
94 0.03
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.2
106 0.24
107 0.31
108 0.4
109 0.45
110 0.51
111 0.6
112 0.68
113 0.7
114 0.74
115 0.78
116 0.76
117 0.79
118 0.82
119 0.8
120 0.82
121 0.8
122 0.77
123 0.75
124 0.74
125 0.67
126 0.64
127 0.59
128 0.57
129 0.57
130 0.59
131 0.58
132 0.59
133 0.57
134 0.52
135 0.49
136 0.42
137 0.35
138 0.3
139 0.22
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.07
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.13
166 0.17
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.19
171 0.2
172 0.19
173 0.18
174 0.16
175 0.15
176 0.21
177 0.24
178 0.28
179 0.29
180 0.32
181 0.41
182 0.43
183 0.43
184 0.45
185 0.49
186 0.46
187 0.47
188 0.43
189 0.33
190 0.29
191 0.25
192 0.18
193 0.11
194 0.1
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.2
218 0.21
219 0.22
220 0.24
221 0.26
222 0.22
223 0.23
224 0.21
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.12
230 0.11
231 0.08
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.15
273 0.19
274 0.17
275 0.23
276 0.23
277 0.23
278 0.24
279 0.23
280 0.22
281 0.17
282 0.18
283 0.13
284 0.14
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.14
289 0.16
290 0.16
291 0.22
292 0.25
293 0.26
294 0.25
295 0.28
296 0.35
297 0.35
298 0.39
299 0.39
300 0.36
301 0.42
302 0.45
303 0.49
304 0.5
305 0.53
306 0.5
307 0.45
308 0.43
309 0.37
310 0.35
311 0.28
312 0.23
313 0.19
314 0.14
315 0.13
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.13
323 0.16
324 0.16
325 0.18
326 0.17
327 0.17
328 0.13
329 0.12
330 0.11
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.16
337 0.18
338 0.18
339 0.14
340 0.16
341 0.14
342 0.19
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.18
347 0.17
348 0.15
349 0.16
350 0.1
351 0.12
352 0.13
353 0.14
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.11
361 0.14
362 0.15
363 0.19
364 0.21
365 0.21
366 0.21
367 0.2
368 0.18
369 0.16
370 0.19
371 0.2
372 0.21
373 0.26
374 0.27
375 0.27
376 0.27
377 0.27
378 0.22
379 0.16
380 0.15
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.06
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.11
403 0.13
404 0.19
405 0.21
406 0.25
407 0.27
408 0.29
409 0.28
410 0.26
411 0.23
412 0.17
413 0.15
414 0.14
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.11
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.07
423 0.12
424 0.13
425 0.18
426 0.18
427 0.17
428 0.22
429 0.22
430 0.27
431 0.24
432 0.21
433 0.17
434 0.19
435 0.21
436 0.23
437 0.3
438 0.28
439 0.29
440 0.31
441 0.31
442 0.29
443 0.28
444 0.24
445 0.19
446 0.2
447 0.18
448 0.16
449 0.16
450 0.17
451 0.16
452 0.2
453 0.18
454 0.16
455 0.17
456 0.18
457 0.16
458 0.16
459 0.17
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.11
464 0.11
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.12
470 0.1
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.16
476 0.15
477 0.14
478 0.15
479 0.1
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.11
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.18
488 0.2
489 0.27
490 0.29
491 0.33
492 0.36
493 0.42
494 0.44
495 0.43
496 0.39
497 0.34
498 0.33
499 0.3
500 0.32
501 0.26
502 0.26
503 0.23
504 0.23
505 0.21
506 0.19
507 0.2
508 0.18
509 0.17
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.11
514 0.1
515 0.08
516 0.04
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.08
524 0.09
525 0.09
526 0.11
527 0.13
528 0.14
529 0.16
530 0.16
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.13
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.16
539 0.23
540 0.27
541 0.29
542 0.31
543 0.33
544 0.35
545 0.4
546 0.38
547 0.3
548 0.25
549 0.27
550 0.26
551 0.19
552 0.16
553 0.11
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.07
562 0.09
563 0.1
564 0.12
565 0.14
566 0.15
567 0.17
568 0.17
569 0.19
570 0.19
571 0.21
572 0.19
573 0.21
574 0.26
575 0.24
576 0.23
577 0.21
578 0.21
579 0.19
580 0.2
581 0.2
582 0.14
583 0.15
584 0.16
585 0.16
586 0.15
587 0.16
588 0.15
589 0.1
590 0.09
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.05
595 0.05
596 0.04
597 0.04
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.1
602 0.11
603 0.11
604 0.13
605 0.16
606 0.23
607 0.31
608 0.36
609 0.37
610 0.38
611 0.42
612 0.46
613 0.44
614 0.37
615 0.31
616 0.25
617 0.21
618 0.19
619 0.15
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.08
624 0.07
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.05
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.08
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.09
645 0.09
646 0.1
647 0.09
648 0.08
649 0.09
650 0.09
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.08
656 0.13
657 0.16
658 0.22
659 0.28
660 0.31
661 0.35
662 0.41
663 0.44
664 0.45
665 0.41
666 0.39
667 0.35
668 0.32
669 0.32
670 0.26
671 0.22
672 0.17
673 0.16
674 0.13
675 0.12
676 0.11
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.09
682 0.08
683 0.08
684 0.1
685 0.14
686 0.14
687 0.2
688 0.21
689 0.23
690 0.26
691 0.29
692 0.33
693 0.33
694 0.38
695 0.32
696 0.32
697 0.32
698 0.29
699 0.25
700 0.19
701 0.15
702 0.1
703 0.09
704 0.08
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.04
713 0.06
714 0.06
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.09
724 0.1
725 0.11
726 0.1
727 0.1
728 0.11
729 0.11
730 0.13
731 0.16
732 0.16
733 0.17
734 0.21
735 0.22
736 0.23
737 0.24
738 0.24
739 0.21
740 0.23
741 0.21
742 0.17
743 0.16
744 0.19
745 0.24
746 0.22
747 0.21
748 0.19
749 0.22
750 0.24
751 0.25
752 0.2
753 0.13
754 0.13
755 0.13
756 0.13
757 0.09
758 0.08
759 0.07
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.11
767 0.12
768 0.13
769 0.15
770 0.21
771 0.26
772 0.29
773 0.31
774 0.32
775 0.32
776 0.3
777 0.27
778 0.22
779 0.18
780 0.18
781 0.18
782 0.18
783 0.18
784 0.19
785 0.19
786 0.19
787 0.19
788 0.18
789 0.18
790 0.2
791 0.19
792 0.18
793 0.19
794 0.18
795 0.18
796 0.15
797 0.14
798 0.09
799 0.08
800 0.07
801 0.06
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.08
806 0.08
807 0.1
808 0.12
809 0.12
810 0.12
811 0.12
812 0.12
813 0.09
814 0.09
815 0.08
816 0.07
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.07
821 0.08
822 0.07
823 0.06
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.08
832 0.08
833 0.07
834 0.06
835 0.06
836 0.06
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.11
848 0.14
849 0.16
850 0.18
851 0.18
852 0.18
853 0.18
854 0.19
855 0.19
856 0.19
857 0.18
858 0.19
859 0.21
860 0.19
861 0.2
862 0.22
863 0.22
864 0.2
865 0.18
866 0.16
867 0.13
868 0.17
869 0.19
870 0.2
871 0.27
872 0.28
873 0.34
874 0.35
875 0.35
876 0.34
877 0.38
878 0.4
879 0.37
880 0.34
881 0.29
882 0.28
883 0.27
884 0.25
885 0.21
886 0.16
887 0.12
888 0.12
889 0.14
890 0.14
891 0.13
892 0.12
893 0.12
894 0.11
895 0.1
896 0.09
897 0.07
898 0.12
899 0.13
900 0.14
901 0.13
902 0.13
903 0.13
904 0.13
905 0.12
906 0.09
907 0.13
908 0.13
909 0.13
910 0.15
911 0.15
912 0.2
913 0.22
914 0.23
915 0.22
916 0.24
917 0.29
918 0.34
919 0.39
920 0.35
921 0.35
922 0.36
923 0.32
924 0.3
925 0.27
926 0.21
927 0.17
928 0.18
929 0.15
930 0.13
931 0.13
932 0.14
933 0.2
934 0.23
935 0.25
936 0.26
937 0.26
938 0.28
939 0.34
940 0.41
941 0.43
942 0.41
943 0.4
944 0.42
945 0.48
946 0.55
947 0.59
948 0.6
949 0.58
950 0.61
951 0.68
952 0.64
953 0.6
954 0.54
955 0.44
956 0.4
957 0.4
958 0.36
959 0.29
960 0.32
961 0.32
962 0.31
963 0.31
964 0.26
965 0.19
966 0.19
967 0.21
968 0.21
969 0.21
970 0.2
971 0.23
972 0.22
973 0.22
974 0.23
975 0.21
976 0.18
977 0.17
978 0.18
979 0.22
980 0.25
981 0.33
982 0.41
983 0.48
984 0.55
985 0.6
986 0.67
987 0.65
988 0.66
989 0.61
990 0.61
991 0.56
992 0.52
993 0.5
994 0.43
995 0.4
996 0.36
997 0.36
998 0.31
999 0.33
1000 0.34
1001 0.35
1002 0.42
1003 0.43
1004 0.5
1005 0.54
1006 0.57
1007 0.62
1008 0.65
1009 0.68
1010 0.69
1011 0.68
1012 0.66
1013 0.68
1014 0.67
1015 0.64
1016 0.64
1017 0.64
1018 0.56
1019 0.57
1020 0.52
1021 0.44
1022 0.37
1023 0.32
1024 0.26
1025 0.17
1026 0.16
1027 0.13
1028 0.13
1029 0.11
1030 0.1
1031 0.08
1032 0.06
1033 0.06
1034 0.05
1035 0.05
1036 0.05
1037 0.05
1038 0.05
1039 0.05
1040 0.06
1041 0.06
1042 0.06
1043 0.05
1044 0.07
1045 0.07
1046 0.08
1047 0.11
1048 0.11
1049 0.12
1050 0.13