FuNGI

A0A1E3I728

Protein Details

Accession

A0A1E3I728

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-28	ADATLFLRKNKDKQRRRNASGVNRVAS	Hydrophilic
164-187	PSDASGSKRKRTKRGTKEVFHQDI	Hydrophilic
609-628	STSGPQPKRNPSPTKNPSAP	Hydrophilic
637-664	SPGASDSRPKPPKKSKKSSSTTPVPQPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
171-177	KRKRTKR
432-440	KLRKIMRKR
616-653	KRNPSPTKNPSAPGTPSKRKSSPGASDSRPKPPKKSKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MADATLFLRKNKDKQRRRNASGVNRVASSSSVPGLASRPKPSSLPASSSAASSPSVKPDPTPDVKPDITEIRIMSTAPNNPLRFNLMRLNHSKTIDPADITPPILMNRKKPGPPEPPIYSLDAEGRINGRYLYDEAGKPVLDEDGKHMVDKKETIDMSLVGQAPSDASGSKRKRTKRGTKEVFHQDIDIMRLRREEALPWVLESANPQERPPQPEQWTGRMVEQGALGQVLLFNDGTGDGFELIPAGRTYKFEPERPFKPLDADAANKLFELQAKHKIHDRWALRPADGASGSAPAPTKVKAEHKELENRAQRLESRIQLLRGSTVDRKPKVEKYEDDYKREGHRVGGSNLEGGVGEELDFDEAEEFQDDDDNNTFYNDAREQEEARELEERLKKEFRLANANVGDRPQIANDDEDEDDLFGDNNLDDEGKKLRKIMRKRMRENGEDYDMDEDSDSDSDDEPVEEKKEEKKEKEKETEALKPSSQPSSRPTSRPPTARTASPSSNSNAHRFPSPKKGKASTAPPGSGASLLAQRAASRGASPRPGSHGSAAGRATSPLGRASSPGSGSAPGSRATSPVVRGSSPASGANTGRGGSPASGSASREASPASTSGPQPKRNPSPTKNPSAPGTPSKRKSSPGASDSRPKPPKKSKKSSSTTPVPQPADIPPFPGMITKEDVLSWFRGNQKQAIPMNEAIGAFRKRIVGAGPNRDANQKLFLGWIRQLADQEQGNLRLKAEYRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.87
3	0.89
4	0.89
5	0.9
6	0.89
7	0.89
8	0.89
9	0.85
10	0.77
11	0.67
12	0.6
13	0.51
14	0.41
15	0.33
16	0.24
17	0.18
18	0.15
19	0.14
20	0.15
21	0.18
22	0.25
23	0.28
24	0.32
25	0.34
26	0.36
27	0.37
28	0.4
29	0.45
30	0.41
31	0.41
32	0.39
33	0.41
34	0.39
35	0.39
36	0.35
37	0.27
38	0.25
39	0.23
40	0.21
41	0.23
42	0.26
43	0.25
44	0.26
45	0.31
46	0.38
47	0.4
48	0.43
49	0.41
50	0.45
51	0.45
52	0.44
53	0.42
54	0.39
55	0.34
56	0.33
57	0.29
58	0.24
59	0.24
60	0.23
61	0.22
62	0.23
63	0.26
64	0.29
65	0.36
66	0.34
67	0.35
68	0.36
69	0.4
70	0.36
71	0.35
72	0.38
73	0.35
74	0.41
75	0.45
76	0.51
77	0.5
78	0.5
79	0.47
80	0.41
81	0.43
82	0.38
83	0.35
84	0.29
85	0.28
86	0.28
87	0.27
88	0.24
89	0.19
90	0.2
91	0.27
92	0.28
93	0.3
94	0.37
95	0.44
96	0.47
97	0.52
98	0.58
99	0.59
100	0.63
101	0.65
102	0.61
103	0.59
104	0.57
105	0.55
106	0.46
107	0.38
108	0.34
109	0.28
110	0.23
111	0.2
112	0.19
113	0.16
114	0.16
115	0.15
116	0.12
117	0.12
118	0.13
119	0.15
120	0.18
121	0.18
122	0.19
123	0.21
124	0.2
125	0.18
126	0.17
127	0.16
128	0.13
129	0.13
130	0.15
131	0.21
132	0.21
133	0.22
134	0.26
135	0.26
136	0.28
137	0.29
138	0.27
139	0.26
140	0.26
141	0.26
142	0.23
143	0.21
144	0.2
145	0.22
146	0.21
147	0.14
148	0.14
149	0.12
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.07
154	0.08
155	0.18
156	0.23
157	0.31
158	0.39
159	0.46
160	0.56
161	0.66
162	0.75
163	0.76
164	0.83
165	0.85
166	0.84
167	0.85
168	0.86
169	0.79
170	0.69
171	0.58
172	0.48
173	0.4
174	0.37
175	0.33
176	0.24
177	0.2
178	0.2
179	0.21
180	0.22
181	0.21
182	0.2
183	0.19
184	0.22
185	0.22
186	0.21
187	0.21
188	0.18
189	0.17
190	0.18
191	0.19
192	0.21
193	0.21
194	0.21
195	0.28
196	0.32
197	0.39
198	0.42
199	0.44
200	0.42
201	0.5
202	0.54
203	0.51
204	0.5
205	0.44
206	0.4
207	0.34
208	0.3
209	0.22
210	0.19
211	0.14
212	0.11
213	0.1
214	0.08
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.06
219	0.05
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.09
236	0.12
237	0.21
238	0.24
239	0.29
240	0.37
241	0.42
242	0.45
243	0.48
244	0.49
245	0.4
246	0.4
247	0.35
248	0.31
249	0.28
250	0.26
251	0.24
252	0.23
253	0.22
254	0.18
255	0.17
256	0.14
257	0.13
258	0.15
259	0.16
260	0.25
261	0.26
262	0.28
263	0.34
264	0.35
265	0.38
266	0.42
267	0.41
268	0.37
269	0.43
270	0.43
271	0.37
272	0.37
273	0.33
274	0.28
275	0.25
276	0.19
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.1
282	0.08
283	0.09
284	0.1
285	0.11
286	0.13
287	0.21
288	0.24
289	0.3
290	0.34
291	0.37
292	0.45
293	0.47
294	0.52
295	0.5
296	0.47
297	0.42
298	0.39
299	0.35
300	0.31
301	0.33
302	0.25
303	0.24
304	0.24
305	0.24
306	0.24
307	0.23
308	0.2
309	0.16
310	0.18
311	0.18
312	0.22
313	0.29
314	0.29
315	0.33
316	0.36
317	0.41
318	0.44
319	0.44
320	0.41
321	0.4
322	0.5
323	0.5
324	0.5
325	0.46
326	0.44
327	0.42
328	0.41
329	0.35
330	0.27
331	0.27
332	0.26
333	0.25
334	0.25
335	0.21
336	0.19
337	0.18
338	0.16
339	0.11
340	0.07
341	0.06
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.06
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.17
372	0.14
373	0.14
374	0.15
375	0.13
376	0.19
377	0.22
378	0.22
379	0.23
380	0.25
381	0.24
382	0.28
383	0.31
384	0.26
385	0.31
386	0.31
387	0.33
388	0.34
389	0.35
390	0.29
391	0.27
392	0.25
393	0.17
394	0.16
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.11
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.06
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.06
416	0.11
417	0.13
418	0.13
419	0.17
420	0.23
421	0.31
422	0.4
423	0.5
424	0.55
425	0.64
426	0.7
427	0.77
428	0.77
429	0.73
430	0.69
431	0.63
432	0.57
433	0.46
434	0.4
435	0.33
436	0.26
437	0.21
438	0.16
439	0.11
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.09
451	0.09
452	0.11
453	0.17
454	0.26
455	0.33
456	0.39
457	0.47
458	0.55
459	0.63
460	0.69
461	0.65
462	0.61
463	0.6
464	0.62
465	0.56
466	0.5
467	0.42
468	0.37
469	0.36
470	0.38
471	0.33
472	0.28
473	0.28
474	0.35
475	0.39
476	0.39
477	0.43
478	0.45
479	0.51
480	0.55
481	0.55
482	0.54
483	0.53
484	0.52
485	0.51
486	0.48
487	0.45
488	0.41
489	0.39
490	0.33
491	0.37
492	0.37
493	0.36
494	0.32
495	0.3
496	0.33
497	0.34
498	0.36
499	0.4
500	0.47
501	0.49
502	0.53
503	0.56
504	0.56
505	0.59
506	0.62
507	0.6
508	0.56
509	0.5
510	0.44
511	0.41
512	0.36
513	0.3
514	0.22
515	0.15
516	0.12
517	0.11
518	0.11
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.11
523	0.1
524	0.1
525	0.14
526	0.17
527	0.22
528	0.24
529	0.25
530	0.3
531	0.33
532	0.33
533	0.3
534	0.32
535	0.28
536	0.3
537	0.29
538	0.24
539	0.21
540	0.19
541	0.19
542	0.15
543	0.14
544	0.12
545	0.13
546	0.13
547	0.14
548	0.16
549	0.17
550	0.17
551	0.17
552	0.16
553	0.15
554	0.16
555	0.17
556	0.16
557	0.14
558	0.16
559	0.15
560	0.14
561	0.16
562	0.18
563	0.18
564	0.21
565	0.22
566	0.2
567	0.21
568	0.23
569	0.22
570	0.21
571	0.2
572	0.17
573	0.18
574	0.18
575	0.2
576	0.18
577	0.17
578	0.15
579	0.14
580	0.14
581	0.11
582	0.12
583	0.1
584	0.13
585	0.14
586	0.15
587	0.16
588	0.17
589	0.17
590	0.17
591	0.16
592	0.14
593	0.14
594	0.13
595	0.14
596	0.15
597	0.17
598	0.27
599	0.34
600	0.41
601	0.46
602	0.55
603	0.62
604	0.69
605	0.76
606	0.73
607	0.76
608	0.77
609	0.8
610	0.76
611	0.69
612	0.63
613	0.59
614	0.58
615	0.56
616	0.58
617	0.58
618	0.6
619	0.64
620	0.65
621	0.63
622	0.65
623	0.64
624	0.64
625	0.61
626	0.62
627	0.59
628	0.66
629	0.66
630	0.7
631	0.69
632	0.65
633	0.68
634	0.72
635	0.78
636	0.79
637	0.85
638	0.85
639	0.87
640	0.9
641	0.89
642	0.88
643	0.86
644	0.84
645	0.81
646	0.8
647	0.71
648	0.64
649	0.56
650	0.52
651	0.5
652	0.42
653	0.37
654	0.29
655	0.27
656	0.27
657	0.28
658	0.24
659	0.2
660	0.23
661	0.2
662	0.2
663	0.19
664	0.21
665	0.2
666	0.21
667	0.2
668	0.21
669	0.28
670	0.33
671	0.36
672	0.4
673	0.41
674	0.47
675	0.5
676	0.5
677	0.48
678	0.43
679	0.42
680	0.38
681	0.34
682	0.26
683	0.28
684	0.25
685	0.21
686	0.22
687	0.22
688	0.2
689	0.21
690	0.24
691	0.26
692	0.33
693	0.42
694	0.46
695	0.48
696	0.5
697	0.53
698	0.52
699	0.45
700	0.42
701	0.33
702	0.28
703	0.28
704	0.29
705	0.3
706	0.3
707	0.33
708	0.29
709	0.31
710	0.32
711	0.29
712	0.31
713	0.28
714	0.3
715	0.29
716	0.34
717	0.37
718	0.36
719	0.35
720	0.34

A0A1E3I728

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer