Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HL69

Protein Details
Accession A0A1E3HL69    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-126SITTYTPKRRKDEPPQEQRDLLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito_nucl 9.666, nucl 9.5, mito 9.5, cyto_nucl 8.833, cyto_mito 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR011044  Quino_amine_DH_bsu  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MSFDLAPLPVLTALKHRITAIHHHADRLYLGLANGQLQVYAYDGDGAELLKTIQPGKRQIDQLGVLPTSKLLAVLSDTVVTLYSLPDLTKSAPTLSQARTVHAFSITTYTPKRRKDEPPQEQRDLLVVGCRKKVAVFGAGERGLNEGWELSIPHSPRHIVFPPSPSSASLPTPIHLCFTSTTSALLHLNAESPSSHLTMTDVTTDKYPQSDIPDAGQKEEGAGSGLGMGMGRFTNFGGYVGIGGKNNGPLGVGTVTGEVLLAREDTGVFYSSEGSYTRPTSLRWPASPDGLAYSNPFIYSVVPAPPASHAQGQKEGVGGTVQIHLAPTLREFTSLPIPAPSVGSLALGPIATLSTFSTGTSPKLLVTTTPTDKSLLAQGSSVYVLSSPPGDILVDGLVRKGRVDDAIAFLESTSTLPRLTSPATTAPPTPSSTTSPKPYTLQTLQILQSLQLFAQGQYQTALESFARHNVNPAKVLALYPKGSIAGKLGVGREGWMDLFGGEGGRLEEGAHGQNKEDHSGEGGVKGLLETVKHGLQRTPSHETLSKETASIKSSSTHLKSPAAADLAPEGELPRAALEALMFFLSDRRQKLAQPIASFSSSSSSTAFPSSPPLPPLSALSPAELFALPSLPFFQVSPEELLRMAQIVYTGLVKVYLLARPTLVGSLCRIENWCDVEEVEGLLKEKEKFGDLIDLYQGKKMHRKALEMVHDLAKEEDDPLDRYPPTISYLQKLPSSPPELLQLRFEFSKWILEEDVARGLEIFKGDEPPTSELPRKEVVDFLEGVQPSKKGKKKEACVSYLEWLIVDMGEKEEWAHEKLAELYLDGARLEKGEMFTKLLSFLETSDGYGAGKMLSRLKKDEMPEARAILLGRMGRHEDALKVYVYQLRDYTQAEAYCIKNEKNKTNIFAILLQLYLRPAPSYSSEQLLKPALALLAAHPSSLSMSSSLPLLPPLTPMSDVQTYLLQTLRSTHSNSYSGKVHAHLSEGRKEQIDLALMAVEGKRVRVGEQRVCPGCMKRLGVAAVAVHAPRGEVTHLHCKDKFSRKLESLRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.25
4 0.26
5 0.3
6 0.39
7 0.41
8 0.46
9 0.45
10 0.46
11 0.46
12 0.44
13 0.41
14 0.33
15 0.25
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.1
39 0.15
40 0.18
41 0.24
42 0.33
43 0.38
44 0.44
45 0.47
46 0.48
47 0.5
48 0.48
49 0.46
50 0.43
51 0.38
52 0.31
53 0.27
54 0.25
55 0.19
56 0.17
57 0.13
58 0.07
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.13
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.22
81 0.27
82 0.28
83 0.34
84 0.32
85 0.34
86 0.35
87 0.35
88 0.33
89 0.28
90 0.26
91 0.18
92 0.22
93 0.2
94 0.22
95 0.26
96 0.35
97 0.41
98 0.48
99 0.53
100 0.57
101 0.66
102 0.72
103 0.78
104 0.79
105 0.82
106 0.83
107 0.83
108 0.76
109 0.66
110 0.57
111 0.47
112 0.36
113 0.32
114 0.28
115 0.27
116 0.28
117 0.28
118 0.26
119 0.25
120 0.28
121 0.24
122 0.25
123 0.24
124 0.25
125 0.31
126 0.32
127 0.31
128 0.28
129 0.27
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.14
139 0.15
140 0.17
141 0.19
142 0.21
143 0.21
144 0.28
145 0.3
146 0.31
147 0.33
148 0.37
149 0.39
150 0.41
151 0.41
152 0.35
153 0.34
154 0.31
155 0.3
156 0.3
157 0.26
158 0.23
159 0.25
160 0.23
161 0.23
162 0.2
163 0.19
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.11
175 0.12
176 0.11
177 0.12
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.2
197 0.23
198 0.23
199 0.24
200 0.31
201 0.31
202 0.31
203 0.3
204 0.23
205 0.2
206 0.19
207 0.16
208 0.1
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.05
246 0.04
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.14
264 0.17
265 0.16
266 0.17
267 0.23
268 0.32
269 0.35
270 0.34
271 0.39
272 0.38
273 0.4
274 0.39
275 0.32
276 0.26
277 0.22
278 0.21
279 0.16
280 0.16
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.1
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.16
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.27
299 0.27
300 0.26
301 0.24
302 0.22
303 0.16
304 0.14
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.13
320 0.18
321 0.18
322 0.18
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.14
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.09
353 0.13
354 0.18
355 0.2
356 0.21
357 0.21
358 0.22
359 0.22
360 0.22
361 0.22
362 0.17
363 0.14
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.14
410 0.16
411 0.17
412 0.18
413 0.18
414 0.19
415 0.2
416 0.2
417 0.19
418 0.21
419 0.25
420 0.28
421 0.32
422 0.32
423 0.32
424 0.32
425 0.31
426 0.33
427 0.3
428 0.31
429 0.26
430 0.28
431 0.26
432 0.26
433 0.25
434 0.18
435 0.17
436 0.12
437 0.11
438 0.09
439 0.09
440 0.07
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.12
446 0.1
447 0.1
448 0.11
449 0.06
450 0.08
451 0.08
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.19
456 0.22
457 0.23
458 0.22
459 0.22
460 0.18
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.13
465 0.13
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.08
473 0.08
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.05
496 0.07
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.12
501 0.12
502 0.14
503 0.13
504 0.11
505 0.1
506 0.12
507 0.12
508 0.09
509 0.09
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.07
518 0.09
519 0.1
520 0.11
521 0.12
522 0.16
523 0.2
524 0.24
525 0.29
526 0.27
527 0.29
528 0.32
529 0.33
530 0.32
531 0.32
532 0.27
533 0.21
534 0.22
535 0.21
536 0.19
537 0.17
538 0.14
539 0.12
540 0.14
541 0.19
542 0.19
543 0.2
544 0.2
545 0.21
546 0.21
547 0.2
548 0.2
549 0.16
550 0.14
551 0.12
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.08
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.03
565 0.03
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.03
570 0.05
571 0.08
572 0.11
573 0.12
574 0.15
575 0.16
576 0.17
577 0.25
578 0.31
579 0.32
580 0.29
581 0.3
582 0.3
583 0.3
584 0.28
585 0.21
586 0.16
587 0.13
588 0.13
589 0.12
590 0.1
591 0.1
592 0.12
593 0.12
594 0.1
595 0.14
596 0.15
597 0.15
598 0.15
599 0.16
600 0.15
601 0.15
602 0.17
603 0.14
604 0.16
605 0.15
606 0.14
607 0.13
608 0.13
609 0.13
610 0.11
611 0.1
612 0.06
613 0.07
614 0.06
615 0.06
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.13
624 0.11
625 0.11
626 0.11
627 0.11
628 0.1
629 0.09
630 0.08
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.04
640 0.05
641 0.06
642 0.07
643 0.08
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.1
653 0.1
654 0.11
655 0.12
656 0.13
657 0.15
658 0.18
659 0.17
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.14
664 0.12
665 0.1
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.1
670 0.09
671 0.1
672 0.11
673 0.11
674 0.11
675 0.12
676 0.18
677 0.16
678 0.16
679 0.18
680 0.19
681 0.19
682 0.21
683 0.23
684 0.18
685 0.25
686 0.28
687 0.33
688 0.33
689 0.36
690 0.38
691 0.44
692 0.49
693 0.45
694 0.44
695 0.39
696 0.37
697 0.34
698 0.29
699 0.21
700 0.14
701 0.12
702 0.11
703 0.09
704 0.11
705 0.12
706 0.15
707 0.15
708 0.15
709 0.16
710 0.15
711 0.17
712 0.2
713 0.2
714 0.19
715 0.23
716 0.26
717 0.27
718 0.27
719 0.26
720 0.27
721 0.3
722 0.28
723 0.25
724 0.29
725 0.3
726 0.3
727 0.31
728 0.26
729 0.25
730 0.25
731 0.24
732 0.19
733 0.17
734 0.21
735 0.18
736 0.18
737 0.16
738 0.16
739 0.17
740 0.16
741 0.19
742 0.13
743 0.13
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.11
748 0.1
749 0.07
750 0.11
751 0.12
752 0.13
753 0.16
754 0.19
755 0.22
756 0.25
757 0.29
758 0.27
759 0.3
760 0.32
761 0.31
762 0.28
763 0.27
764 0.25
765 0.23
766 0.23
767 0.2
768 0.21
769 0.19
770 0.2
771 0.19
772 0.18
773 0.2
774 0.28
775 0.32
776 0.34
777 0.44
778 0.53
779 0.61
780 0.69
781 0.72
782 0.67
783 0.66
784 0.62
785 0.56
786 0.48
787 0.38
788 0.28
789 0.2
790 0.16
791 0.12
792 0.1
793 0.07
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.09
799 0.11
800 0.12
801 0.13
802 0.12
803 0.13
804 0.15
805 0.16
806 0.14
807 0.12
808 0.12
809 0.12
810 0.12
811 0.11
812 0.1
813 0.08
814 0.09
815 0.09
816 0.09
817 0.1
818 0.13
819 0.14
820 0.16
821 0.16
822 0.16
823 0.17
824 0.15
825 0.14
826 0.11
827 0.1
828 0.12
829 0.12
830 0.12
831 0.11
832 0.11
833 0.1
834 0.1
835 0.1
836 0.06
837 0.07
838 0.09
839 0.16
840 0.21
841 0.24
842 0.28
843 0.32
844 0.37
845 0.38
846 0.46
847 0.45
848 0.46
849 0.45
850 0.42
851 0.39
852 0.35
853 0.33
854 0.23
855 0.21
856 0.17
857 0.15
858 0.16
859 0.19
860 0.18
861 0.2
862 0.2
863 0.18
864 0.2
865 0.21
866 0.19
867 0.16
868 0.18
869 0.2
870 0.2
871 0.2
872 0.18
873 0.18
874 0.21
875 0.22
876 0.22
877 0.23
878 0.22
879 0.22
880 0.25
881 0.25
882 0.27
883 0.29
884 0.29
885 0.32
886 0.39
887 0.44
888 0.49
889 0.52
890 0.51
891 0.51
892 0.51
893 0.46
894 0.41
895 0.35
896 0.28
897 0.23
898 0.19
899 0.16
900 0.14
901 0.13
902 0.11
903 0.1
904 0.1
905 0.12
906 0.16
907 0.23
908 0.23
909 0.28
910 0.3
911 0.3
912 0.33
913 0.33
914 0.28
915 0.21
916 0.21
917 0.15
918 0.13
919 0.12
920 0.09
921 0.15
922 0.15
923 0.14
924 0.13
925 0.13
926 0.14
927 0.15
928 0.15
929 0.08
930 0.09
931 0.1
932 0.11
933 0.11
934 0.1
935 0.11
936 0.12
937 0.1
938 0.12
939 0.14
940 0.15
941 0.16
942 0.16
943 0.2
944 0.21
945 0.21
946 0.2
947 0.21
948 0.2
949 0.2
950 0.21
951 0.16
952 0.15
953 0.19
954 0.22
955 0.22
956 0.25
957 0.28
958 0.31
959 0.36
960 0.37
961 0.38
962 0.37
963 0.36
964 0.35
965 0.33
966 0.32
967 0.27
968 0.3
969 0.31
970 0.33
971 0.38
972 0.4
973 0.41
974 0.39
975 0.38
976 0.36
977 0.33
978 0.3
979 0.22
980 0.19
981 0.16
982 0.14
983 0.15
984 0.13
985 0.13
986 0.11
987 0.12
988 0.14
989 0.14
990 0.17
991 0.24
992 0.33
993 0.38
994 0.45
995 0.54
996 0.55
997 0.57
998 0.58
999 0.55
1000 0.53
1001 0.51
1002 0.46
1003 0.38
1004 0.4
1005 0.39
1006 0.35
1007 0.33
1008 0.26
1009 0.21
1010 0.21
1011 0.19
1012 0.14
1013 0.13
1014 0.12
1015 0.11
1016 0.12
1017 0.12
1018 0.13
1019 0.2
1020 0.3
1021 0.34
1022 0.41
1023 0.43
1024 0.47
1025 0.54
1026 0.62
1027 0.65
1028 0.59
1029 0.65
1030 0.66