FuNGI

C1GJ56

Protein Details

Accession

C1GJ56

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
410-431	LFTKQRGYKRLCFRNKQNGPMC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 4.499, cyto 4, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	pbn:PADG_07292 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12245 RRM_scw1_like

Amino Acid Sequences

MSNGPSNQPGAMFTLKRNGSSSAVSSHLPGSTSNGTSTMHNANISEPFSPVSCQAPSSSSTAFKSILPPIGQPPMHPTDVDLSSNGLSSVNGTNGSYNPQGINGGIVAVLLRRLAPTYSNELLHGLLTFSQHLMDYSFVPNEYPEDGQCRSAIARFETRAAAEEVCNALHGKLNSTGETNLIVEILNTPSTSALLGRRNTIDHASNRAAPNSASQPVAPSALIRQTSLFNGAFQAFERAGNSELPAPEENSQLTSIFSPQSPIENSISDRSYGSGKMMIKQDPDEDTGELLNDPVGYARNGPSSAAAMPRRSTNPPVALSRFSNLLLSTNVGSSMPQLGGTRSSTNLGTPSTMPPGLSSTIVPNSGYMHSPQFHRVNYPPVNPADQNPPCNTLYVGNLPHDTSEDELKSLFTKQRGYKRLCFRNKQNGPMCFVEFEDISFATKALHELYGYQLSNSVKGGIRLSFSKNPLGVRPGPPPGMNAASSIANAGKAANGNGMPLFATANTFPPGLGIPPGFGGVNSAHSPLSLGLNCNNGSNGNGNGNKNTFHSHSTPGLGIIPGAIGTSRSHTLNGGGGPSMANMNVTAYGDYLGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.33
3	0.34
4	0.35
5	0.34
6	0.31
7	0.32
8	0.32
9	0.26
10	0.27
11	0.26
12	0.25
13	0.23
14	0.21
15	0.19
16	0.17
17	0.19
18	0.21
19	0.22
20	0.21
21	0.21
22	0.21
23	0.22
24	0.26
25	0.24
26	0.22
27	0.21
28	0.21
29	0.22
30	0.25
31	0.25
32	0.21
33	0.18
34	0.17
35	0.17
36	0.18
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.17
41	0.17
42	0.18
43	0.2
44	0.22
45	0.23
46	0.23
47	0.24
48	0.26
49	0.25
50	0.24
51	0.26
52	0.26
53	0.3
54	0.27
55	0.28
56	0.29
57	0.36
58	0.35
59	0.31
60	0.34
61	0.34
62	0.33
63	0.31
64	0.28
65	0.26
66	0.29
67	0.29
68	0.22
69	0.19
70	0.18
71	0.18
72	0.17
73	0.12
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.11
78	0.11
79	0.11
80	0.13
81	0.13
82	0.18
83	0.16
84	0.16
85	0.15
86	0.15
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.09
91	0.08
92	0.06
93	0.06
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.07
101	0.07
102	0.1
103	0.13
104	0.2
105	0.23
106	0.23
107	0.23
108	0.23
109	0.23
110	0.21
111	0.17
112	0.1
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.13
129	0.14
130	0.13
131	0.12
132	0.16
133	0.17
134	0.17
135	0.17
136	0.17
137	0.16
138	0.17
139	0.19
140	0.18
141	0.22
142	0.22
143	0.24
144	0.24
145	0.23
146	0.23
147	0.22
148	0.19
149	0.14
150	0.15
151	0.14
152	0.12
153	0.13
154	0.11
155	0.1
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.16
160	0.17
161	0.17
162	0.18
163	0.18
164	0.16
165	0.17
166	0.14
167	0.1
168	0.09
169	0.08
170	0.06
171	0.07
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.11
181	0.17
182	0.18
183	0.2
184	0.21
185	0.22
186	0.23
187	0.25
188	0.26
189	0.22
190	0.27
191	0.27
192	0.31
193	0.31
194	0.3
195	0.28
196	0.22
197	0.23
198	0.21
199	0.2
200	0.16
201	0.15
202	0.15
203	0.15
204	0.16
205	0.13
206	0.1
207	0.1
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.13
213	0.13
214	0.17
215	0.16
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.11
221	0.13
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.13
232	0.13
233	0.14
234	0.14
235	0.14
236	0.14
237	0.12
238	0.13
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.11
248	0.12
249	0.14
250	0.14
251	0.15
252	0.16
253	0.17
254	0.17
255	0.15
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.12
260	0.11
261	0.13
262	0.13
263	0.16
264	0.19
265	0.2
266	0.2
267	0.2
268	0.21
269	0.18
270	0.2
271	0.17
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.09
277	0.07
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.06
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.13
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.17
297	0.2
298	0.21
299	0.23
300	0.23
301	0.25
302	0.26
303	0.29
304	0.29
305	0.28
306	0.26
307	0.24
308	0.21
309	0.18
310	0.16
311	0.12
312	0.11
313	0.09
314	0.1
315	0.09
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.1
330	0.12
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.12
345	0.11
346	0.11
347	0.12
348	0.13
349	0.12
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.12
354	0.11
355	0.13
356	0.14
357	0.16
358	0.22
359	0.24
360	0.23
361	0.27
362	0.28
363	0.34
364	0.36
365	0.37
366	0.35
367	0.33
368	0.36
369	0.32
370	0.32
371	0.33
372	0.33
373	0.34
374	0.31
375	0.34
376	0.3
377	0.3
378	0.29
379	0.2
380	0.19
381	0.2
382	0.2
383	0.18
384	0.18
385	0.18
386	0.17
387	0.17
388	0.15
389	0.12
390	0.14
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.12
395	0.12
396	0.15
397	0.17
398	0.16
399	0.24
400	0.3
401	0.4
402	0.48
403	0.54
404	0.59
405	0.66
406	0.74
407	0.76
408	0.79
409	0.79
410	0.82
411	0.81
412	0.82
413	0.79
414	0.72
415	0.67
416	0.61
417	0.52
418	0.42
419	0.36
420	0.28
421	0.2
422	0.17
423	0.14
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.08
434	0.09
435	0.12
436	0.17
437	0.17
438	0.16
439	0.19
440	0.19
441	0.2
442	0.19
443	0.19
444	0.14
445	0.16
446	0.18
447	0.15
448	0.17
449	0.19
450	0.25
451	0.28
452	0.3
453	0.33
454	0.33
455	0.34
456	0.34
457	0.38
458	0.36
459	0.34
460	0.37
461	0.37
462	0.38
463	0.36
464	0.34
465	0.32
466	0.3
467	0.26
468	0.22
469	0.19
470	0.17
471	0.16
472	0.16
473	0.13
474	0.1
475	0.1
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.11
481	0.1
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.09
487	0.09
488	0.07
489	0.09
490	0.09
491	0.11
492	0.13
493	0.13
494	0.12
495	0.12
496	0.13
497	0.12
498	0.14
499	0.11
500	0.1
501	0.11
502	0.12
503	0.11
504	0.1
505	0.11
506	0.09
507	0.13
508	0.14
509	0.15
510	0.14
511	0.13
512	0.15
513	0.14
514	0.18
515	0.15
516	0.17
517	0.18
518	0.23
519	0.23
520	0.23
521	0.23
522	0.18
523	0.19
524	0.19
525	0.19
526	0.22
527	0.27
528	0.29
529	0.32
530	0.34
531	0.33
532	0.33
533	0.36
534	0.31
535	0.31
536	0.32
537	0.32
538	0.34
539	0.35
540	0.34
541	0.29
542	0.28
543	0.23
544	0.19
545	0.14
546	0.11
547	0.08
548	0.07
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.11
553	0.14
554	0.15
555	0.16
556	0.17
557	0.18
558	0.21
559	0.21
560	0.19
561	0.16
562	0.16
563	0.15
564	0.15
565	0.14
566	0.1
567	0.1
568	0.08
569	0.09
570	0.1
571	0.11
572	0.1
573	0.1

C1GJ56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer