Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GDI3

Protein Details
Accession C1GDI3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-429ASGAEAKSKKAKRKGSEKYKKKARDNVGGGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-422RHRHASGAEAKSKKAKRKGSEKYKKKAR
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 11.166, cyto_mito 10.166, nucl 7, mito_nucl 6.666, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
KEGG pbn:PADG_05319  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
CDD cd20071  SET_SMYD  
Amino Acid Sequences MLLNLSTLINSTSIYEAKTCGDRGQGLVANESFDEGECIVCEEVMVAVGTLETTGGSIASYNKYLAQQVKAVANPSFSRRFFELPHLPKEKWGPFAAVFERGSIPMQIGAVRGRVLGLSSAYLNHACLPNAQHTLFTMKCNDDREERYFLTVYACKKVAQGEEITIPYDVLYMDRASRQQFLLQEYGFECACKLCGKENSRIEAGFELIYLKLPIIFTEKVIDAEPAGILQMAHTLLDIHLKAEITDNRFARIWEHCAFVCTWHSDEGRAMVFLSKAQNAFLKIQGANGKDFLRIKELQKDPMKTSHSGSTQRGLSSKNDMDIIRRNQERDVEILFMLDANDLGDYIKLSEYERAHTSTMEAGDEGDNCEKSSIVDIDELVRELQVEKKEHDQSRHRHASGAEAKSKKAKRKGSEKYKKKARDNVGGGDVDGDKNQEKGKQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.18
5 0.21
6 0.21
7 0.2
8 0.23
9 0.24
10 0.24
11 0.29
12 0.3
13 0.27
14 0.3
15 0.28
16 0.25
17 0.23
18 0.23
19 0.16
20 0.13
21 0.13
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.03
43 0.04
44 0.05
45 0.08
46 0.1
47 0.11
48 0.12
49 0.14
50 0.16
51 0.21
52 0.24
53 0.24
54 0.25
55 0.27
56 0.31
57 0.3
58 0.32
59 0.28
60 0.27
61 0.27
62 0.3
63 0.34
64 0.3
65 0.33
66 0.34
67 0.36
68 0.34
69 0.41
70 0.46
71 0.44
72 0.52
73 0.53
74 0.5
75 0.51
76 0.57
77 0.51
78 0.46
79 0.42
80 0.36
81 0.32
82 0.37
83 0.35
84 0.32
85 0.28
86 0.25
87 0.24
88 0.22
89 0.21
90 0.16
91 0.14
92 0.1
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.13
115 0.15
116 0.18
117 0.21
118 0.21
119 0.19
120 0.19
121 0.24
122 0.23
123 0.22
124 0.21
125 0.2
126 0.23
127 0.26
128 0.28
129 0.28
130 0.32
131 0.35
132 0.37
133 0.35
134 0.34
135 0.31
136 0.28
137 0.27
138 0.26
139 0.24
140 0.22
141 0.22
142 0.2
143 0.21
144 0.24
145 0.21
146 0.19
147 0.18
148 0.16
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.14
153 0.13
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.11
163 0.12
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.19
169 0.21
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.18
174 0.15
175 0.13
176 0.1
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.12
182 0.2
183 0.24
184 0.32
185 0.36
186 0.38
187 0.38
188 0.37
189 0.33
190 0.26
191 0.23
192 0.14
193 0.1
194 0.08
195 0.06
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.11
231 0.14
232 0.15
233 0.2
234 0.2
235 0.21
236 0.22
237 0.22
238 0.2
239 0.2
240 0.22
241 0.18
242 0.2
243 0.18
244 0.19
245 0.19
246 0.18
247 0.18
248 0.14
249 0.13
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.09
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.18
270 0.16
271 0.19
272 0.22
273 0.22
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.22
279 0.2
280 0.21
281 0.24
282 0.25
283 0.33
284 0.34
285 0.4
286 0.44
287 0.47
288 0.44
289 0.48
290 0.49
291 0.41
292 0.42
293 0.39
294 0.39
295 0.4
296 0.4
297 0.38
298 0.36
299 0.35
300 0.35
301 0.3
302 0.27
303 0.29
304 0.28
305 0.24
306 0.26
307 0.25
308 0.27
309 0.33
310 0.36
311 0.37
312 0.38
313 0.39
314 0.38
315 0.41
316 0.39
317 0.33
318 0.29
319 0.23
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.12
324 0.11
325 0.08
326 0.06
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.14
338 0.15
339 0.19
340 0.22
341 0.23
342 0.23
343 0.23
344 0.23
345 0.2
346 0.2
347 0.17
348 0.14
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.15
353 0.15
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.16
360 0.14
361 0.12
362 0.13
363 0.13
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.16
372 0.19
373 0.22
374 0.24
375 0.32
376 0.41
377 0.46
378 0.54
379 0.58
380 0.6
381 0.68
382 0.75
383 0.68
384 0.63
385 0.57
386 0.59
387 0.59
388 0.58
389 0.56
390 0.48
391 0.51
392 0.57
393 0.64
394 0.63
395 0.63
396 0.65
397 0.66
398 0.76
399 0.84
400 0.86
401 0.9
402 0.9
403 0.92
404 0.93
405 0.93
406 0.92
407 0.91
408 0.88
409 0.88
410 0.84
411 0.79
412 0.75
413 0.65
414 0.55
415 0.48
416 0.4
417 0.3
418 0.24
419 0.2
420 0.16
421 0.18
422 0.21